有必要计算溶剂的密度to check the accuracy吗？混合溶剂的介电常数的取值方式

yihanxu · 发表于 Post on 2020-3-26 11:26:16

老师好，请问有必要计算溶剂的密度 to check the accuracy 吗？体系含有几种溶质，处在两种有机溶剂的混合物中。采用GAFF力场，RESP atomic charge是用IEFPCM based on B3LYP-D3(BJ)/def2-TZVP 计算的，and then fit the RESP method by employing Multiwfn package。

得到了一个审稿人的comment: The solvent densities obtained from MD should be reported, to check the accuracy. 另外有个关于介电常数的comment，想请问老师混合溶剂的介电常数按体积权重来取有参考文献吗，查了高斯手册没有看到相关内容。

谢谢！

yihanxu · 发表于 Post on 2022-3-22 16:11:41

SuXXXX 发表于 2022-3-18 08:18
嗯嗯！！加油！

SuXXXX · 发表于 Post on 2022-3-18 08:18:07

yihanxu 发表于 2022-3-16 13:12
不客气，一起加油

嗯嗯！！加油！

yihanxu · 发表于 Post on 2022-3-16 13:12:18

SuXXXX 发表于 2022-3-16 08:18
看到了！非常感谢！！！！

不客气，一起加油

SuXXXX · 发表于 Post on 2022-3-16 08:18:40

yihanxu 发表于 2022-3-15 12:27
Composites Part B 206 (2021) 108531 你看一下这个里面提到了

看到了！非常感谢！！！！

yihanxu · 发表于 Post on 2022-3-15 12:27:09

SuXXXX 发表于 2022-3-14 19:22
想问一下楼主有没有找到混合溶剂介电常数的计算方法参考文献，我找了好久没找到……

Composites Part B 206 (2021) 108531 你看一下这个里面提到了

SuXXXX · 发表于 Post on 2022-3-15 09:22:03

想问一下楼主有没有找到混合溶剂介电常数的计算方法参考文献，我找了好久没找到……

sobereva · 发表于 Post on 2020-4-1 03:30:22

这帖子内容没什么机密的，不要设阅读权限。我把阅读权限撤了
跑几次取平均值，和一次性跑这几次长度的加和原理上是一样的

yihanxu · 发表于 Post on 2020-3-31 12:57:58

老师好，请问需要算几次密度取平均值吗，还是一次就够了？

sobereva · 发表于 Post on 2020-3-26 16:49:06

如果溶质的力场参数/电荷不是之前已有的，审稿人的comment也有一定道理，你可以对纯溶剂做MD，看看模拟的密度与实验密度是否吻合，判断当前的力场参数/电荷是否合适。

Gaussian手册里肯定不写这些实际计算上的guidance。很多文章里都这么做，一时想不起来，记得之前CCL上有人讨论的时候就提过，我忘了是否同时给出了文献。你用google学术去搜相关字眼肯定能搜到很多这么干的文章。

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