安装ORCA 4.2.1 后运行测试文件，出错

风飞 · 发表于 Post on 2020-7-3 16:23:26

本帖最后由风飞于 2020-7-4 14:25 编辑

老师，您好，
根据您的帖子http://sobereva.com/451 在centos 7.8 下安装ORCA 4.2.1 ，OpenMPI 已安装正确，相关环境变量设置如下，结果运行test的时候出现这种错误，请问怎么解决呢？出错提示是SCF出错，但这个是简单的大家都用的例子，按照道理来说结构应该是正确的，所以不知道是什么原因，请老师指教

万里云 · 发表于 Post on 2020-7-5 10:19:32

风飞发表于 2020-7-4 14:40
嗯，抱歉，我还是没理解，您说的是这个图吗？，我shell前面是$,我就一直以为普通用户，我记得root用户 ...

我看花眼了，把room看成root了。

风飞 · 发表于 Post on 2020-7-4 14:40:06

万里云发表于 2020-7-4 13:48
你最后一张图执行mpiexec的时候，用的是root账户啊。

root账户应该只在修改系统设置的时候使用。平时 ...

嗯，抱歉，我还是没理解

，您说的是这个图吗？，我shell前面是$,我就一直以为普通用户，我记得root用户的shell前面不是#吗？我还是没明白，如果改，怎样改合适呢？我先在在终端中都是这样（[room@localhost ] $）的形式

万里云 · 发表于 Post on 2020-7-4 13:48:09

风飞发表于 2020-7-3 22:42
嗯，谢谢您，我明天装一下这个软件，此外，谢谢您的提醒，我应该用的是普通用户，我看书上说:如果是root ...

你最后一张图执行mpiexec的时候，用的是root账户啊。

root账户应该只在修改系统设置的时候使用。平时就用root的话，即使不手滑把系统搞坏，也容易遇到令人头疼的文件权限问题。

喵星大佬 · 发表于 Post on 2020-7-3 22:49:34

风飞发表于 2020-7-3 22:42
嗯，谢谢您，我明天装一下这个软件，此外，谢谢您的提醒，我应该用的是普通用户，我看书上说:如果是root ...

一样的，～/是相对路径，对于root用户就是/root/，对普通用户就是/home/用户名/

风飞 · 发表于 Post on 2020-7-3 22:42:06

本帖最后由风飞于 2020-7-3 22:46 编辑

万里云发表于 2020-7-3 22:21
切换mpi的问题可以用Environment Modules软件解决。

看截图你在用root账户，对于新手来说，这是个很糟 ...

嗯，谢谢您，我明天装一下这个软件，此外，谢谢您的提醒，我应该用的是普通用户，我看书上说:如果是root用户前面应该是# ，而普通用户是$，您是说我在root用户的bashrc上修改的环境变量吗？我每次打开bashrc文件用的命令是 gedit ~/.bashrc 。如果这个打开的是root用户的bashrc文件，请问我该用哪个命令打开当前普通用户的bashrc文件呢？

万里云 · 发表于 Post on 2020-7-3 22:21:57

风飞发表于 2020-7-3 21:14
你好我想请问以下，VASP 用的是inter MPI ORCA 用的是openMPI 。我现在使用ORCA 把interMPI 注释了，那 ...

切换mpi的问题可以用Environment Modules软件解决。

看截图你在用root账户，对于新手来说，这是个很糟糕的习惯。

风飞 · 发表于 Post on 2020-7-3 21:14:39

hebrewsnabla 发表于 2020-7-3 20:17
注释以后要退出重新登录。

删了就没了。

你好我想请问以下，VASP 用的是inter MPI ORCA 用的是openMPI 。我现在使用ORCA 把interMPI 注释了，那我使用interMPI的时候是不是也要把openMPI 注释掉呢？
如果我使用VASP 的时候，把interMPI 的注释去掉，然后给openMPI加上注释，这样修改好hashrc ，是不是点击source .bashrc 就可以了？

风飞 · 发表于 Post on 2020-7-3 21:02:35

最后，谢谢各位老师

风飞 · 发表于 Post on 2020-7-3 21:02:20

hebrewsnabla 发表于 2020-7-3 20:17
注释以后要退出重新登录。

删了就没了。

您好，我在回收站把文件找回来了，然后修改PATH 路径并且注释了inter MPI 然后就可以了

hebrewsnabla · 发表于 Post on 2020-7-3 20:17:05

风飞发表于 2020-7-3 20:14
其实我之前是先注释了inter MPI ，然后输入mpiexec -V 结果还是inter MPI，然后我就删除了，请问现在该 ...

注释以后要退出重新登录。

删了就没了。

风飞 · 发表于 Post on 2020-7-3 20:14:03

hebrewsnabla 发表于 2020-7-3 20:04
安装openmpi和intel没有关系，没报错就是成功的。根本没必要重新安装。

安装的时候要先阅读README和IN ...

其实我之前是先注释了inter MPI ，然后输入mpiexec -V 结果还是inter MPI，然后我就删除了，请问现在该怎么办呢？

hebrewsnabla · 发表于 Post on 2020-7-3 20:04:01

风飞发表于 2020-7-3 20:01
嗯，之前也是按照帖子来的，输入make all intsall -j，没有提示报错，结果可能是inter MPI 的原因，openM ...

安装openmpi和intel没有关系，没报错就是成功的。根本没必要重新安装。

安装的时候要先阅读README和INSTALL。

风飞 · 发表于 Post on 2020-7-3 20:02:18

hebrewsnabla 发表于 2020-7-3 19:57
export LD_LIBRARY_PATH=/home/room/openmpi314/lib:$LD_LIBRARY_PATH

当然，你把其他的mpi都注释掉， ...

恩，好的谢谢您

风飞 · 发表于 Post on 2020-7-3 20:01:17

hebrewsnabla 发表于 2020-7-3 19:53
不需要重新安装啊……

你非要重装，之前怎么装的还怎么装呗

嗯，之前也是按照帖子来的，输入make all intsall -j，没有提示报错，结果可能是inter MPI 的原因，openMPI 没有装成功，这次我把inter MPI注释掉了，然后重新来输入 make all intsall -j 结果就提示出错了

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