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[综合交流] 红外光谱对脲羰基和氨脂羰基位置的判定求助

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本帖最后由 dakedidi 于 2020-7-9 10:02 编辑

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采用R-NCO(异氰酸酯基团)和R-NH(亚胺基)生产脲基结构,脲基结构中含有脲羰基,实测红外位置在1650 cm-1左右的位置,但是高斯计算并用Multiwfn调整后得到的结果是1710cm-1(此处对应氨脂基团的羰基),请各位老师帮忙指点。


图片1.png (1.64 KB, 下载次数 Times of downloads: 95)

此为脲羰基

此为脲羰基

图片2.png (1.29 KB, 下载次数 Times of downloads: 40)

此为氨脂羰基(与脲羰基很接近)

此为氨脂羰基(与脲羰基很接近)

微信截图_20200709100145.png (28.17 KB, 下载次数 Times of downloads: 58)

拟分析的脲基结构

拟分析的脲基结构

图2.png (21.07 KB, 下载次数 Times of downloads: 31)

黑色计算值,黄色实测值

黑色计算值,黄色实测值

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-13 17:15:31 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-7-13 10:33
非谐振是更高级的振动问题的处理方法,原理上显然比谐振可靠
基于之前优化的结构用freq=anharm。此计算 ...

收到sob老师,我研究一下,感谢!

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发表于 Post on 2020-7-13 10:33:03 | 只看该作者 Only view this author
dakedidi 发表于 2020-7-12 10:52
感谢sob老师!我查询了资料,还是太搞清楚非谐振计算原理,请问sob老师非谐振计算结果可靠吗?用于结构优 ...

非谐振是更高级的振动问题的处理方法,原理上显然比谐振可靠
基于之前优化的结构用freq=anharm。此计算非常耗时

非谐振光谱的计算和绘制这里提了
使用Multiwfn绘制红外、拉曼、UV-Vis、ECD、VCD和ROA光谱图
http://sobereva.com/224

更多信息公社首页google框搜论坛,之前我也回答过很多相关问题
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-12 10:52:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-7-11 12:24
做非谐振计算试试

感谢sob老师!我查询了资料,还是太搞清楚非谐振计算原理,请问sob老师非谐振计算结果可靠吗?用于结构优化么还,还是为了单独进行频率分析?对应高斯中的那个关键词?再次感谢!!!

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发表于 Post on 2020-7-11 12:24:44 | 只看该作者 Only view this author
dakedidi 发表于 2020-7-10 10:32
感谢sob老师!我用以模拟的材料是由沥青和一种液体分子共混的制备而成的。该材料常温下是固体凝凝胶,类 ...

做非谐振计算试试
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-10 10:32:25 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 dakedidi 于 2020-7-11 12:47 编辑
sobereva 发表于 2020-7-10 05:30
我问的是实验条件,你并没有回答实验条件如何。不说实验条件,别人就无从知道你的计算到底和实验有没有可 ...

感谢sob老师!我用以模拟是一种固体凝凝胶,我是在常温下采用溴化钾压片法透射方式测试的红外。

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发表于 Post on 2020-7-10 05:30:56 | 只看该作者 Only view this author
dakedidi 发表于 2020-7-9 09:57
感谢sob老师回复,我就是对298K下的结构进行优化,是个单纯一个有机分子,无溶液,关键词是#p opt freq 6 ...

我问的是实验条件,你并没有回答实验条件如何。不说实验条件,别人就无从知道你的计算到底和实验有没有可比性
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本帖最后由 dakedidi 于 2020-7-9 10:24 编辑
bomsaude 发表于 2020-7-7 15:41
你单独计算一个分子的话,是不能反映分子的真实情况的。测定实际分子的红外时,脲基是通过之间的氢键键合的 ...

非常感谢bom老师的回复!!我重新编辑了下帖子,把分析模型和红外的结果粘上了。我用gv查看vibration的时候能够看到明显的C=O伸缩振动及对应的强度值,这里的C=O振动只对应了一个独立而且很的的强度,没有分峰。bom老师,我知道高斯计算的值偏大,但是问题是,就算调整缩减比例以后也对不上。请问bom老师,后续我应该如何操作,麻烦给支个招!感谢感谢感谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-9 09:57:40 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 dakedidi 于 2020-7-9 10:23 编辑
sobereva 发表于 2020-7-8 03:25
问题的细节不够充分
实验是在什么状态下测的,液态、晶体还是溶液需要说明,而且没有你的计算的关键词也不 ...

感谢sob老师回复,我就是对298K下的结构进行优化,是个单纯一个有机分子,无溶液,关键词是#p opt freq 6-31g(d) b97d,想要分析红外的结构见我原始提问下面的脲羰基所示。实测脲羰基C=O震动红外位置在1650 cm-1左右的位置,可是频率计算得到的是在1710cm-1位置,请问有什么解决办法吗。sob老师,我知道高斯计算的值偏大,但是问题是,就算调整缩减比例以后也对不上。

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发表于 Post on 2020-7-8 03:25:16 | 只看该作者 Only view this author
问题的细节不够充分
实验是在什么状态下测的,液态、晶体还是溶液需要说明,而且没有你的计算的关键词也不好说是否计算上有问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2020-7-7 15:41:38 | 只看该作者 Only view this author
你单独计算一个分子的话,是不能反映分子的真实情况的。测定实际分子的红外时,脲基是通过之间的氢键键合的,反映在红外上1650波数的位置是amide I 区域,是个大鼓包,可以分成几个峰,根据氢键键合的程度从大到小,波数由低到高。你如果就拿一个单独分子计算的话,波数应该偏大。

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