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[新手求助] 用gaussian计算结构优化,60个原子,包含92U原子,求最佳计算方法和基组。

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本帖最后由 丨小桉柠 于 2020-8-17 18:34 编辑

计算结构优化,求推荐比较适合的计算方法和基组。
U原子加雁势,这样添加相对论效应。试过SDD雁势,
其他的原子用过6-31G(d)   6-311G**基组。
def2-TZVP < def2-TZVPP ≈ pcseg-2 正在用着三个基组计算,时间有点长。
计算资源nodes=2:ppn=20,因为不懂还是用过nodes=4:ppn=40也能用。




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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-17 15:29:37 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-8-16 22:54
看你这个结构是个盐,实验应该是在介电常数相对比较高的溶剂里做的吧?记得考虑溶剂效应
另外如果实验用的 ...

感谢指导,由于我是新人,我还需要具体研究一下,对一些概念还不是很清楚。我还需要补一补。老师的建议我会认真考虑一下。

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发表于 Post on 2020-8-16 22:54:30 | 只看该作者 Only view this author
看你这个结构是个盐,实验应该是在介电常数相对比较高的溶剂里做的吧?记得考虑溶剂效应
另外如果实验用的溶剂里ClO4-会完全电离开,那么去掉ClO4-单算那个阳离子会比较靠谱,结构优化收敛也会快一些
再就是不知道这个体系是不是强相关体系,留意一下DFT的HOMO-LUMO gap,如果特别小的话,说明可能是强相关体系,DFT结果未必靠谱
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-16 15:41:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-8-11 06:35
没有特殊前提的情况下,U用SDD,其它用6-31G*,更好点用6-311G*。泛函用PBE0-D3(BJ)
是赝势不是雁势

十分感谢老师的指导。赝势,之前是输入法找不到先用雁代替了一下。

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发表于 Post on 2020-8-11 06:35:42 | 只看该作者 Only view this author
没有特殊前提的情况下,U用SDD,其它用6-31G*,更好点用6-311G*。泛函用PBE0-D3(BJ)
是赝势不是雁势
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-10 12:54:32 | 只看该作者 Only view this author

好。十分感谢。

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发表于 Post on 2020-8-10 12:48:01 | 只看该作者 Only view this author
丨小桉柠 发表于 2020-8-10 12:42
好的,谢谢。那节点设置为1,是不是核数越大算的越快?还有单个节点的核数是不是受计算机限制呀?

是,是

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-10 12:42:20 | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2020-8-10 12:39
高斯不要跨节点并行,效率比较低

好的,谢谢。那节点设置为1,是不是核数越大算的越快?还有单个节点的核数是不是受计算机限制呀?

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发表于 Post on 2020-8-10 12:39:42 | 只看该作者 Only view this author
高斯不要跨节点并行,效率比较低

认真阅读: 谈谈量子化学中基组的选择 http://sobereva.com/336

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