Gaussian 能做出核磁氟谱的谱图吗？

LZLLLL · 发表于 Post on 2020-8-13 17:18:07

我的师姐做反应的产物有同分异构体，但是里面有过渡金属铁且做氢谱出现的峰很乱很杂没有办法积分，然后老师让她去做氟谱看看。
所以我想问一下可以用高斯得到氟谱的谱图吗？

jingetiema6112 · 发表于 Post on 2023-8-16 18:18:26

wzkchem5 发表于 2023-8-16 17:38
1. 按http://sobereva.com/314的方法计算
2. 一般必须考虑
3. 优化时建议加色散校正（除非有明确理由不 ...

谢谢，老师。感谢您的详细解答。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-8-16 17:38:34

jingetiema6112 发表于 2023-8-16 09:56
老师您好，还有几个问题向您请教下。1.这个问题是关于计算NMR的。如果模拟化合物的紫外可见吸收光谱，是 ...

1. 按http://sobereva.com/314的方法计算
2. 一般必须考虑
3. 优化时建议加色散校正（除非有明确理由不加），优化完了要做频率计算确定有没有虚频，此外检查你的体系有没有CT态，如果有的话可能要改用HF比例更高的泛函或范围分离泛函。另外如果有条件的话，尽量做振动分辨光谱或振动平均光谱，如今用单一构象算垂直吸收的光谱，容易被审稿人问为什么不做振动分辨/振动平均，虽然一般不至于因此被拒，但是做振动分辨/振动平均绝对是加分项

jingetiema6112 · 发表于 Post on 2023-8-16 16:56:08

wzkchem5 发表于 2023-8-15 19:15
1. sob老师指的是：TMS计算的优化级别必须和你的分子的优化级别相同，TMS计算的NMR级别必须和你的分子的N ...

老师您好，还有几个问题向您请教下。1.这个问题是关于计算NMR的。如果模拟化合物的紫外可见吸收光谱，是不是也是如您解答的这个步骤? 2.必须考虑溶剂化效应吗？3. 优化用opt b3lyp/6-311g(d,p) scrf(SMD,solvent=chloroform)，计算紫外用b3lyp/6-311g(d,p) td(nstate=50) scrf(SMD,solvent=chloroform)，这么写有问题吗？恳请老师指导。

jingetiema6112 · 发表于 Post on 2023-8-15 19:57:15

wzkchem5 发表于 2023-8-15 19:15
1. sob老师指的是：TMS计算的优化级别必须和你的分子的优化级别相同，TMS计算的NMR级别必须和你的分子的N ...

好的老师，感谢您的详细解答。明白了

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-8-15 19:15:48

jingetiema6112 发表于 2023-8-15 12:06
卢老师您好，借这个帖子请教几个问题。学习了文章“使用Multiwfn绘制NMR谱“（http://sobereva.com/565） ...

1. sob老师指的是：TMS计算的优化级别必须和你的分子的优化级别相同，TMS计算的NMR级别必须和你的分子的NMR级别相同。但优化和NMR的级别可以不同，且大部分情况下都不同
2. 反了，应该是结构优化时应该把溶剂模型加上。固然用气相结构算溶解自由能有一定合理性（http://sobereva.com/327），但这个逻辑只适用于溶解自由能以及任何需要用到溶解自由能的量（反应自由能变、自由能垒等），溶剂里的其他性质（包括但不限于核磁）不适用这个逻辑，只要该加显式溶剂的地方已经加了显式溶剂，且实验是在溶剂里做的，那么加隐式溶剂模型一般总是比不加好，只不过有时改善很小可以忽略而已

jingetiema6112 · 发表于 Post on 2023-8-15 19:06:56

sobereva 发表于 2020-8-15 09:57
一个NMR关键词就搞定了

卢老师您好，借这个帖子请教几个问题。学习了文章“使用Multiwfn绘制NMR谱“（http://sobereva.com/565）。文中有这么一个描述“按照常规方法计算1H和13C NMR的话，需要先计算四甲基硅烷(TMS)的氢和碳的磁屏蔽值，并且其优化的级别和计算NMR的级别，包括方法、基组、溶剂模型，必须和计算自己的物质完全相同”。产生两个疑问向您确认一下：1.假设做结构优化和频率分析用的基组是B3LYP/6-311G**,是否意味着算碳、氢磁屏蔽值时也应该用B3LYP/6-311G**，而不应该用示例中的B972/def2TZVP基组？2. 做化合物结构优化时，没有考虑溶剂模型，是否意味着算碳、氢磁屏蔽值时应该把“scrf(SMD,solvent=chloroform)”去掉？谢谢老师。

snljty2 · 发表于 Post on 2022-5-20 14:00:20

kaier 发表于 2022-5-20 13:17
sob老师，氟谱NMR计算完成后，是不是还要计算参照物比如一氟三氯甲烷的核磁结果，才能与实验结果参考

是，具体看你实验用的基准物质。

kaier · 发表于 Post on 2022-5-20 13:17:24

sobereva 发表于 2020-8-15 09:57
一个NMR关键词就搞定了

sob老师，氟谱NMR计算完成后，是不是还要计算参照物比如一氟三氯甲烷的核磁结果，才能与实验结果参考

LZLLLL · 发表于 Post on 2020-8-15 14:08:44

sobereva 发表于 2020-8-15 09:57
一个NMR关键词就搞定了

好的，多谢sob老师，哈哈我还以为很麻烦呢

sobereva · 发表于 Post on 2020-8-15 09:57:23

LZLLLL 发表于 2020-8-14 10:28
好的，谢谢sob老师，我去查查如何计算F的磁屏蔽值

一个NMR关键词就搞定了

LZLLLL · 发表于 Post on 2020-8-14 10:28:41

sobereva 发表于 2020-8-13 18:08
Gaussian只能计算磁屏蔽值，获得谱图是之后的事，需要利用Multiwfn或GaussView等程序
Gaussian算F的磁屏蔽 ...

好的，谢谢sob老师，我去查查如何计算F的磁屏蔽值

sobereva · 发表于 Post on 2020-8-13 18:08:23

Gaussian只能计算磁屏蔽值，获得谱图是之后的事，需要利用Multiwfn或GaussView等程序
Gaussian算F的磁屏蔽值是没问题的

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[Gaussian/gview] Gaussian 能做出核磁氟谱的谱图吗？