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[Gaussian/gview] 关于LC-ωPBE计算的几个问题

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大家好,
          请问谁用过LC-ωPBE泛函计算,它的特点是什么,适合于什么样的分子结构,关键词是什么?在写输入文件时应该注意什么问题。有实例最好,有链接也请告诉我。

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发表于 Post on 2016-1-27 17:35:32 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-1-27 17:17
都有lc-wpbe关键词,还写那些IOp干嘛
有那个提示说明那个泛函在g09里有局限性,没法得到解析梯度。要优 ...

恩,明白了,谢谢sob老师。
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发表于 Post on 2016-1-27 17:17:39 | 只看该作者 Only view this author
小范范1989 发表于 2016-1-27 15:12
咨询一下两位老师, @sobereva  @卡开发发  这个LC-wpbe泛函怎么在高斯09d01中实现,
我使用:#p lc-wpbe/ ...

都有lc-wpbe关键词,还写那些IOp干嘛
有那个提示说明那个泛函在g09里有局限性,没法得到解析梯度。要优化只能用数值梯度了,会很慢。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-1-27 15:12:28 | 只看该作者 Only view this author
咨询一下两位老师, @sobereva  @卡开发发  这个LC-wpbe泛函怎么在高斯09d01中实现,
我使用:#p lc-wpbe/6-31g(d) iop(3/107=0203600000,3/108=0203600000)  opt TDA scrf=(solvent=toluene)
结果:
The selected state is a singlet
CISAX will form     1 AO SS matrices at one time.
NMat=     1 NSing=     1 JSym2X= 0.
No func 3rd derivs with HSE.
Error termination via Lnk1e in /home/software/g09D01/g09/l914.exe at Wed Jan 27 15:17:00 2016.
Job cpu time:       0 days  0 hours 30 minutes 24.2 seconds.
No func 3rd derivs with HSE.
Error termination via Lnk1e in /home/software/g09D01/g09/l914.exe at Wed Jan 27 15:17:00 2016.
No func 3rd derivs with HSE.
Error termination via Lnk1e in /home/software/g09D01/g09/l914.exe at Wed Jan 27 15:17:00 2016.
No func 3rd derivs with HSE.
Error termination via Lnk1e in /home/software/g09D01/g09/l914.exe at Wed Jan 27 15:17:00 2016.
File lengths (MBytes):  RWF=    249 Int=      0 D2E=      0 Chk=      6 Scr=      1

也就是这个方法不能来做s1的优化?那文章中的s1-t1的能差是咋找的嫩?谢谢老师
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发表于 Post on 2015-11-28 16:09:13 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2015-11-28 11:53
1、只是人为划分为远近而已,可以认为是erf函数性质本身导致的,选取这个erf的目的也是如此,至于远或近对r ...

谢谢老师的指点。
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发表于 Post on 2015-11-28 11:53:07 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 卡开发发 于 2015-11-28 11:54 编辑

1、只是人为划分为远近而已,可以认为是erf函数性质本身导致的,选取这个erf的目的也是如此,至于远或近对r12贡献的大小是通过omega调整的,你自己可以使用Excel看看,也内置了erf函数;
2、(Gaussian的iop我不熟悉,就不班门弄斧了);
3、范围分离泛函其实也就是把长程项和短程项用不同的泛函描述,如果使用两种局域或半局域泛函,一般对计算通常没改善,所以基本上也就是一种杂化泛函,杂化泛函这样就能够分成全局和范围分离的。全局的杂化泛函长程短程HF比例都是一样的,这个你的理解没问题;
4、LC-GGA一般LR的部分是100%的HF,能修改的只有omega项。

当然,长程短程的形式也不是绝对纯粹erf,比如CAM-B3YP,短程项就是[1-α+β·erf(μr12)]/r12,长程则是[α+β·erf(μr12)]/r12。其实2#李大师分享的那份ppt当中Scuseria对三类如LC-wpbe、HISS、HSE泛函还是做了些详尽的介绍。

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谢谢sob老师的指点。谢谢老师
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发表于 Post on 2015-11-28 09:20:37 | 只看该作者 Only view this author
小范范1989 发表于 2015-11-27 16:24
@卡开发发 @sobereva  两位老师好。
首先说明一下自己的背景:自己量化基础不是很好,最近看到这种LC-wpbe ...



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liyuanhe211 发表于 2015-11-27 17:34
我的理解(可能不对,仅供讨论):

Range Separated Functional 不是说我在什么地方切一刀,这是近程 ...

是的,只是正好erf那个函数形式比较合用所以才用的。另外还有一点就是作为switching function引入算符后,到最后必须容易做电子积分,erf也满足这一点。
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发表于 Post on 2015-11-27 18:28:47 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2015-11-27 17:34
我的理解(可能不对,仅供讨论):

Range Separated Functional 不是说我在什么地方切一刀,这是近程 ...

谢谢李老师的指点,你前面说的 1 = erf(r_12) + (1 - erf(r_12))之一部分,我差不多明白点了。谢谢指点。
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发表于 Post on 2015-11-27 17:34:04 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 liyuanhe211 于 2015-11-27 17:35 编辑
小范范1989 发表于 2015-11-27 16:24
@卡开发发 @sobereva  两位老师好。
首先说明一下自己的背景:自己量化基础不是很好,最近看到这种LC-wpbe ...

我的理解(可能不对,仅供讨论):

Range Separated Functional 不是说我在什么地方切一刀,这是近程这是远程,这样显然容易造成各种性质在空间上不连续/不可微。只是把1/r_12这一项分母上的“1”,用erf(r_12)函数拆成 1 = erf(r_12) + (1 - erf(r_12))。由于erf(r) 在 r 变大的时候很快趋于1,使得第二项(1 - erf(r_12))在距离增大时很快趋于0,成为近程项,第一项相反,为远程项,赋予不同的HF比例。变化是平滑的,没有clear cut说这以近是近程,否则是远程。

erf(r)的自变量不一定是r_12,可以乘上一个系数,比如erf(μ·r_12),对这个函数压缩或拉伸,就改变了近程和远程的分布,可以对这个伸缩的系数进行优化。

另外我一直不知道 erf(r) 是如何被引进来的,或许只是一个arbitrary的挑了一个正好满足要求的函数而已?

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发表于 Post on 2015-11-27 16:24:32 | 只看该作者 Only view this author
@卡开发发 @sobereva  两位老师好。
首先说明一下自己的背景:自己量化基础不是很好,最近看到这种LC-wpbe以及LC-BLYP这两种泛函,自己很感兴趣,同时也下载了文献正在看。我想可否自己也造一个LC-....泛函,来计算?所以我想咨询一下几个问题:(问题比较low,基础差,老师不要见笑)
1:范围分离泛函,分为进程和远程部分,这个远和近是怎么区分的,物理意义是什么?能否和我们普通的理解方式一样,大约多少是远,小于多少是进。
2:我看了帖子,说可以通过3/107和3/108来确定进程和远程的HF以及DFT成分。但是您说:
3/107和3/108都设为MMMMM00000,就相当于用了ω参数为MMMMM/10000的范围分离泛函。同时进程的是用标准的HF和标准的DFT是吧?这个标准的HF和DFT是什么意思?
3:这个范围分离泛函和杂化泛函有什么不同?杂化泛函里面对全部都是一样的比例?比如说:b3lyp,都是20%的HF成分?我感觉我应该是不理解范围分离和杂化泛函的区别。
4:可否对杂化泛函进行长程或者远程的修改。比如说我看到了LC-wpbe和LC-BLYP这样的泛函,他是不是在杂化泛函的基础上,设置长程或者远程的部分?
可否自己造一个泛函,比如说通过iop(3/76)来自己定义杂化泛函的HF成分,然后通过3/107和3/108来确定进程和远程的HF以及DFT成分?
这是我的一个小小的假想,不知道可否。

5:谢谢老师的耐心指点。量化确实是自己的一个短板。
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发表于 Post on 2015-10-29 16:24:11 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 卡开发发 于 2015-10-29 16:31 编辑
小范范1989 发表于 2015-10-29 15:17
卡开发发大牛你好,很高兴能和你讨论这个问题。
1:你说和这个能量为什么相等,当时我问过,ppt中那段话 ...

关于第一个问题,个人觉得对于相互作用体系的Koopmans定理得到的电离能应该基于under the constraint of the wave functions being fixed at the initial state的情形,也就是电离前后轨道弛豫的部分并未考虑,该等式并非完全严格。

鄙人窃以为可以从Janak定理出发(Koopmans定理的微分形式,写成积分形式应该与Koopmans定理差一个常数),对前线电子自作用与电离势同时修正。

之前有一些Generalized Koopmans来确定DFT+U的方式,也有通过线性响应的方法,都可以做些借鉴。关于DFT+U和杂化泛函,本身还是能够找一些联系的。不妨一块儿讨论一下。

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发表于 Post on 2015-10-29 15:17:57 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2015-10-29 11:55
想一块儿讨论下:

按说非独立粒子体系电离能应该和HOMO能量是有点差距的?(轨道弛豫)


卡开发发大牛你好,很高兴能和你讨论这个问题。
1:你说和这个能量为什么相等,当时我问过,ppt中那段话,我是借用sob老师的。具体的我也没去思考。
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=1663&extra=
2:你说的第二个问题,想通过另外的一个思路来找一种泛函是吧?我尽快看看这个文章,然后在和大牛来讨论。
我觉得,现在能单独地找一种泛函来适应体系计算并且符合,应该很有意义。我看了这LC-wpbe和LC-blyp的发在了JCTC和JPCC上,这样是我当时的一个想法,但是没有思虑。幸好你给我指明了一下,我会尽快看看,然后和你讨论来,谢谢你,也感谢这个平台
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发表于 Post on 2015-10-29 11:55:29 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 卡开发发 于 2015-10-29 11:57 编辑
小范范1989 发表于 2015-10-28 21:45
这是我当时看过这个泛函,然后在组会报告中总结的一个ppt

想一块儿讨论下:

按说非独立粒子体系电离能应该和HOMO能量是有点差距的?(轨道弛豫)

我觉得可以考虑其中一种类似于构造Dudarev’s DFT+U的原理的方案(PHYSICAL REVIEW B 80, 085202 2009):d^2E/dN^2=0,即E(N+n)=(1-n)E(N)+nE(N+1)
不知道会不会有好的结果。按说a也应该做些调整。
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