openMolcas安装后运行报错

wxhwbh · 发表于 Post on 2020-11-23 15:14:38

编译好openmolcas后，运行pymolcas xxx.input会报错
"/home/wbh/soft/openMolcas/build" is not a valid MOLCAS installation
想问问要怎么解决呢？

hebrewsnabla · 发表于 Post on 2024-5-13 19:37:52

jiahui 发表于 2024-5-13 19:34
您好，我也遇到了这个问题，您解决了吗？

见18楼。

jiahui · 发表于 Post on 2024-5-13 19:34:35

hebrewsnabla 发表于 2020-12-1 22:31
俺也编译了一个OpenMolcas，遇到了同样的问题，不知楼主解决没有。

这里的问题在于，不论echo $MOLCAS的 ...

您好，我也遇到了这个问题，您解决了吗？

lijingbai2009 · 发表于 Post on 2022-5-14 21:32:22

wxhwbh 发表于 2020-11-23 16:39

你这个截图中，bin里并没有pymolcas。这是一个常见的安装bug，OpenMolcas会把pymolcas安装到别的默认文件夹里，我记得我之前是在python的bin里找到的。然后把pymolcas移动到molcas的bin里，可能就没问题了。这也印证了直接运行pymolcas要加 --not here

ZZU_SCU · 发表于 Post on 2021-12-21 21:04:34

hebrewsnabla 发表于 2021-12-21 20:21
--not-here 是运行pymolcas测试时候的选项

谢谢您的指导，我的问题可能不是这个，我重新安装试试

hebrewsnabla · 发表于 Post on 2021-12-21 20:21:29

ZZU_SCU 发表于 2021-12-21 17:55
您可以再详细的说一下怎么解决的么？--not-here不能放到bashrc中。我也遇到同样的问题了

--not-here 是运行pymolcas测试时候的选项

ZZU_SCU · 发表于 Post on 2021-12-21 17:55:50

hebrewsnabla 发表于 2020-12-2 16:11
我是最新的OpenMolcas, python 3.8.6, 系统是滚动更新的ArchLinux，内核版本5.9.10。
------------------
...

您可以再详细的说一下怎么解决的么？--not-here不能放到bashrc中。我也遇到同样的问题了

hebrewsnabla · 发表于 Post on 2020-12-2 16:11:54

本帖最后由 hebrewsnabla 于 2020-12-2 16:25 编辑

我是最新的OpenMolcas, python 3.8.6, 系统是滚动更新的ArchLinux，内核版本5.9.10。
------------------
破案了，需要加上--not-here选项，来禁止pymolcas优先在此目录的父目录寻找molcas。因为我是在源码目录中的test运行测试的，所以总是轮不到环境变量。

wxhwbh · 发表于 Post on 2020-12-2 11:51:11

hebrewsnabla 发表于 2020-12-1 22:31
俺也编译了一个OpenMolcas，遇到了同样的问题，不知楼主解决没有。

这里的问题在于，不论echo $MOLCAS的 ...

我也没有解决。我的系统是CentOS 7.6，python版本是3.8.3，molcas版本不知道在哪里看，不过就是最近下的。

zjxitcc · 发表于 Post on 2020-12-1 23:27:06

楼上和题主不如说说自己的OpenMolcas版本，linux系统版本，python版本，说不定有共通之处。

hebrewsnabla · 发表于 Post on 2020-12-1 22:31:16

俺也编译了一个OpenMolcas，遇到了同样的问题，不知楼主解决没有。

这里的问题在于，不论echo $MOLCAS的结果为何，pymolcas认为的MOLCAS环境变量的值始终不变，而且并不是等于“以往“的设置，而是等于OpenMolcas源代码所在目录。。。重启也没用
然后我看了一下pymolcas源码里面的逻辑，发现就是一个简单的os.environ.get()
这就非常令人费解了……

zjxitcc · 发表于 Post on 2020-11-23 19:59:58

wxhwbh 发表于 2020-11-23 19:52
谢谢，不过echo还是build的地址，重新登录也是老样子。

有没试过把build下的内容全删掉，重新编译一遍？因为如果之前有编译失败的话，产生的Makefile文件里会含有以往的路径信息，不知道对你有没影响。

wxhwbh · 发表于 Post on 2020-11-23 19:52:42

zjxitcc 发表于 2020-11-23 17:06
你再echo $MOLCAS看看，或者退出节点再登录试试，我目前只能这么猜了。

谢谢，不过echo还是build的地址，重新登录也是老样子。

zjxitcc · 发表于 Post on 2020-11-23 17:06:30

wxhwbh 发表于 2020-11-23 16:39

你再echo $MOLCAS看看，或者退出节点再登录试试，我目前只能这么猜了。

wxhwbh · 发表于 Post on 2020-11-23 16:39:44

zjxitcc 发表于 2020-11-23 16:22
说实话，得看ls /home/public/wbh/soft/OpenMolcas/build/bin的截图，和你export MOLCAS的截图，有图有证据 ...

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[Molcas] openMolcas安装后运行报错

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