求助：gmx energy导出的各压力分量怎么看？

haichang · 发表于 Post on 2020-12-14 15:48:32

如图，gmx energy里面压力分量有9个方向的分量，分别是什么含义呢？Pres-XX是不是X方向的分量？那么Pres-XY 和Pres-YX又分别指什么呢？

sobereva · 发表于 Post on 2024-5-31 09:39:25

牧生发表于 2024-5-30 09:06
请教一下，看了一阵ppt，但我还是没看的太懂，有三个疑问

①XYZ方向对应的是Pxx，Pyy，Pzz，那么Pxy， ...

1 没法简单地理解，只能理解为相应两个方向间的耦合项
2 前者
3 就是那么定义的

牧生 · 发表于 Post on 2024-5-30 09:06:16

本帖最后由牧生于 2024-5-30 09:09 编辑

sobereva 发表于 2020-12-14 19:04
那个是压力张量的不同分量

请教一下，看了一阵ppt，但我还是没看的太懂，有三个疑问

①XYZ方向对应的是Pxx，Pyy，Pzz，那么Pxy，Pyz, Pxz又是对应什么方向呢？
②总压力对应它们的平均值，是指Pxx，Pyy，Pzz三个的平均值吗？还是Pxx，Pyy，Pzz，Pxy，Pyz, Pxz六个的平均值？
③总压力为什么是平均值，而不是他们的总和？

limen · 发表于 Post on 2023-12-18 20:55:05

你好，请问vir-XY代表什么含义？

haichang · 发表于 Post on 2020-12-15 15:46:51

sobereva 发表于 2020-12-14 19:04
那个是压力张量的不同分量

谢谢sob老师

haichang · 发表于 Post on 2020-12-15 15:46:24

柠檬好酸发表于 2020-12-14 16:20
这个应该是在不同方向上的压力，因为统计力学上压力是力*坐标算出来的（具体公式你自己百度吧），所以XX YY ...

谢谢

sobereva · 发表于 Post on 2020-12-14 19:04:06

那个是压力张量的不同分量

参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）的ppt：

柠檬好酸 · 发表于 Post on 2020-12-14 16:20:59

这个应该是在不同方向上的压力，因为统计力学上压力是力*坐标算出来的（具体公式你自己百度吧），所以XX YY XY 应该是指不同的方向

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