用MS建模之后。更改原子名称后，pdb文件报错

随风 · 发表于 Post on 2020-12-15 15:15:40

在MS中画好分子之后，导入VMD可以直接观看（图1)。将其上传至ATB，得到优化的pdb及itp文件，在VMD中依然可以打开（图2）.当我把MS中的原子类型改为ATB中的原子类型时，VMD文件就打不开了（图3）.谢谢各位老师了。

随风 · 发表于 Post on 2020-12-15 20:29:52

Lacrimosa 发表于 2020-12-15 17:14
打开pdb把connect的字段删掉

谢谢老师了，我可能是原子类型不对。

随风 · 发表于 Post on 2020-12-15 20:29:07

Kangtor 发表于 2020-12-15 19:38
会不会是你改了原子类型时把格式弄错了？

对，就是我改原子类型弄错了，谢谢老师

Kangtor · 发表于 Post on 2020-12-15 19:38:44

会不会是你改了原子类型时把格式弄错了？

Lacrimosa · 发表于 Post on 2020-12-15 17:14:59

打开pdb把connect的字段删掉

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