如何回复审稿人意见

47615182 · 发表于 Post on 2021-3-6 06:08:32

本帖最后由 47615182 于 2021-3-6 06:13 编辑

老师，您好，我研究的一个甾体化合物A，它目前没有晶体结构。我搭建初始结构的时候，是先从CCDC上下载了一个化合物B的晶体文件（A是B的衍生物），然后添加了一些衍生基团。这样搭建好初始结构之后，用Gaussian进行了优化。然后用标度法算的核磁，发现实验和计算的核磁数据，误差不大。同时也将红外拉曼紫外的实验和计算光谱进行了对比，吻合较好。就这样确证了结构，并在此构象的基础上做了其他的计算。审稿人提出的几个问题，想听一下卢老师的意见。（现在看到审稿人的意见，才想起，搭建完初始结构之后是不是该用molclus程序先做构象搜索然后再优化）1. Conformational studies (pag. 7). The strategies to find the most stable structure of each compound are not described. The authors should include in the manuscript a clear explanation of this point.
11. Can the authors explain why there is such a difference in the wavenumbers IR and Raman for some IR and Raman bands assigned to the same normal mode?

47615182 · 发表于 Post on 2021-3-7 06:23:09

好的谢谢老师

量化小菜鸡 · 发表于 Post on 2021-3-6 13:29:12

47615182 发表于 2021-3-6 10:51
老师，我在别的贴子中看到您说的刚性结构没有做构象搜索的必要。我这个结构是偏刚性的，是不是可以不做构 ...

这个还是可以搜索一下的，毕竟好多键可以旋转

47615182 · 发表于 Post on 2021-3-6 10:51:45

老师，我在别的贴子中看到您说的刚性结构没有做构象搜索的必要。我这个结构是偏刚性的，是不是可以不做构象搜索呢？

47615182 · 发表于 Post on 2021-3-6 07:52:54

本帖最后由 47615182 于 2021-3-6 08:02 编辑

那请问老师，是先做构象搜索，然后再用高斯优化吗？构象搜索这一步，能否再补充到论文里啊？但是文件一变化，后面全都需要改变，有没有办法独立的补到文章里面去啊？

sobereva · 发表于 Post on 2021-3-6 07:13:51

1 应当做构象搜索，如果发现有其它波尔兹曼分布概率较大的构象，也应当算一下这些谱看看

2 没上下文我不好判断

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