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[Gaussian/gview] 求助:想求大佬测试这个linux版本的gaussian16安装包是否可用

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问题:严格按照老师http://sobereva.com/439的步骤安装后,却发现g16 xxx.gjf 后,只是几秒钟后便只出现了log文件。想请教一下原因(在两个终端安装后都是不能正常运行,尝试了很多,未能独自解决,故怀疑是我这破解版安装包的问题),命令行及系统回复内容如下:
  1. (base) [learning@rtx2 h2o]$ g16 HP24.gjf
  2. Error: segmentation violation
  3.    rax 0000000000000000, rbx 0000000001f9ef40, rcx 000015290d7b0a0b
  4.    rdx 0000000000000000, rsp 00007ffec1af8fb8, rbp 00007ffec1af9010
  5.    rsi 000000000000000b, rdi 00000000000d2b5b, r8  000015290db37820
  6.    r9  000015290e2e86c0, r10 0000000000000007, r11 0000000000000206
  7.    r12 00007ffec1afb080, r13 0000000000000013, r14 0000000001fa0010
  8.    r15 0000000000000001
  9.   /lib64/libpthread.so.0(+0x12dd0) [0x15290decfdd0]
  10.   /lib64/libc.so.6(kill+0xb) [0x15290d7b0a0b]
  11.   /home/learning/hsw/app/gaussian16/g16/l1.exe() [0x4f4ea9]
  12.   /home/learning/hsw/app/gaussian16/g16/l1.exe() [0x50e790]
  13.   /home/learning/hsw/app/gaussian16/g16/l1.exe() [0x5087bf]
  14.   /home/learning/hsw/app/gaussian16/g16/l1.exe() [0x50cc80]
  15.   /home/learning/hsw/app/gaussian16/g16/l1.exe() [0x50ca45]
  16.   /home/learning/hsw/app/gaussian16/g16/l1.exe() [0x512128]
  17.   /home/learning/hsw/app/gaussian16/g16/l1.exe() [0x46ddd7]
  18.   /home/learning/hsw/app/gaussian16/g16/l1.exe() [0x44fe05]
  19.   /home/learning/hsw/app/gaussian16/g16/l1.exe() [0x44fd37]
  20.   /home/learning/hsw/app/gaussian16/g16/l1.exe() [0x44fc84]
  21.   /lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xf3) [0x15290d79c6a3]
  22.   /home/learning/hsw/app/gaussian16/g16/l1.exe() [0x44fb79]
复制代码


日志文件内容如下:
  1. Entering Gaussian System, Link 0=g16
  2. Input=HP24.gjf
  3. Output=HP24.log
  4. Initial command:
  5. /home/learning/hsw/app/gaussian16/g16/l1.exe "/home/learning/hsw/app/gaussian16/g16/scratch/Gau-856450.inp" -scrdir="/home/learning/hsw/app/gaussian16/g16/scratch/"
复制代码


.bashrc文件相关内容如下:
  1. <span style="background-color: rgb(249, 249, 250);">export g16root=/home/learning/hsw/app/gaussian16</span>
  2. <span style="background-color: rgb(249, 249, 250);">export GAUSS_SCRDIR=/home/learning/hsw/app/gaussian16/g16/scratch</span>
  3. <span style="background-color: rgb(249, 249, 250);">source /home/learning/hsw/app/gaussian16/g16/bsd/g16.profile</span>
复制代码

20V~XZTZCL1WY%3T0OU4IAG.png (87.88 KB, 下载次数 Times of downloads: 39)

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发表于 Post on 2024-6-19 10:10:03 | 只看该作者 Only view this author

推荐一下ChimeraX。安装好之后下载一个SEQCROW就可以可视化ORCA的输出文件了,常见的需求都能满足(振动频率,优化过程,IRC轨迹等等)。软件比这俩好用而且自带的可视化效果预设就很不错

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发表于 Post on 2024-6-18 16:08:01 | 只看该作者 Only view this author
XZDZ 发表于 2024-6-18 07:21
老师,请问哪些软件可以看ORCA的输出呢?比如想看振动频率、relax scan以及IRC这些的输出呢?

Avogadro或Chemcraft
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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25#
发表于 Post on 2024-6-18 14:21:35 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-8-22 15:25
用orca吧,orca是免费的,大部分功能和高斯差不多或者比高斯好,而且还支持DLPNO-CCSD(T)等很多高斯做不 ...

老师,请问哪些软件可以看ORCA的输出呢?比如想看振动频率、relax scan以及IRC这些的输出呢?

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发表于 Post on 2022-8-22 21:24:11 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2022-8-22 18:07
那就是一个搜索引擎,随便搜搜你想要的信息。

好的谢谢

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23#
发表于 Post on 2022-8-22 18:07:43 | 只看该作者 Only view this author
RES 发表于 2022-8-22 18:01
请问直接在那个网站里面搜的内容也是二楼说的吗。您发的那个帖子我权限不够进。

那就是一个搜索引擎,随便搜搜你想要的信息。
又菜又爱玩

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22#
发表于 Post on 2022-8-22 18:03:49 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-8-22 15:25
用orca吧,orca是免费的,大部分功能和高斯差不多或者比高斯好,而且还支持DLPNO-CCSD(T)等很多高斯做不 ...

这个是因为的前面的计算都是用的Gaussian,用的是学校的机子,现在要在自己电脑上装,但是又找不到给学校装的那个人,所以只能这样了

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21#
发表于 Post on 2022-8-22 18:01:32 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2022-8-22 13:52
第一个方法:第二楼的网站里面,搜
第二个方法:http://bbs.keinsci.com/thread-29314-1-1.html

请问直接在那个网站里面搜的内容也是二楼说的吗。您发的那个帖子我权限不够进。

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发表于 Post on 2022-8-22 16:09:35 | 只看该作者 Only view this author

你要打广告啊,买点之一不是免费吗,你哪一个帖子没说免费?
ORCA大法好!算得快,还免费,我爷爷的爷爷都说不赖!
山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔᵊ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ。

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发表于 Post on 2022-8-22 16:08:04 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-8-22 09:04
直接加:

ORCA大法好!免费!

估计没啥效果吧
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2022-8-22 16:04:43 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 chands 于 2022-8-22 16:08 编辑
wzkchem5 发表于 2022-8-22 16:02
有道理,我加上了。不过估计还是不能代替发广告就是。。。

直接加:

ORCA大法好!免费量子化学软件!
[链接] [论坛]
ORCA大法好!算得快,还免费,我爷爷的爷爷都说不赖!
山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
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发表于 Post on 2022-8-22 16:02:51 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-8-22 08:31
我都叫你直接加签名档,就不用天天发广告了。

有道理,我加上了。不过估计还是不能代替发广告就是。。。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2022-8-22 15:34:17 | 只看该作者 Only view this author
RES 发表于 2022-8-22 13:33
老哥,Gaussian16要到哪里下载呀,我是真的找不到了,不能公开链接,能否给个线索

如果学校/学院/课题组没有购买Gaussian软件使用许可,后续没法用于发文章,顶多私下做练习。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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15#
发表于 Post on 2022-8-22 15:31:54 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-8-22 15:25
用orca吧,orca是免费的,大部分功能和高斯差不多或者比高斯好,而且还支持DLPNO-CCSD(T)等很多高斯做不 ...

我都叫你直接加签名档,就不用天天发广告了。
ORCA大法好!算得快,还免费,我爷爷的爷爷都说不赖!
山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
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发表于 Post on 2022-8-22 15:25:08 | 只看该作者 Only view this author
RES 发表于 2022-8-22 06:33
老哥,Gaussian16要到哪里下载呀,我是真的找不到了,不能公开链接,能否给个线索

用orca吧,orca是免费的,大部分功能和高斯差不多或者比高斯好,而且还支持DLPNO-CCSD(T)等很多高斯做不了的方法。
既然可以合法用一个免费软件,就没必要非法用一个盗版的收费软件。正常情况下我不会轻易给高斯用户安利orca,毕竟我有利益相关;但是碰到求盗版高斯的,我一定要说这么一句,因为即使高斯公司也不希望你用盗版高斯。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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