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[Gaussian/gview] 求助:石墨烯表面吸附分子模型应该怎么搭建?

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请问一下各位老师,用gaussian计算石墨烯吸附(AlF6)3-离子时,石墨烯与吸附离子的相对大小应该怎么确定呢?6X6的石墨烯表面足够吗?

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发表于 Post on 2021-4-27 14:35:54 | 只看该作者 Only view this author
壹零壹室掃地僧 发表于 2021-4-27 10:23
我之前看很多文献,石墨化氮(1个氮直接替换1个碳)都是自旋多重度为2来处理的,认为有一对孤对电子没成 ...

实验上带自由基的N和带正电荷的N应该可以从XPS区分开。而且这两者没法比较哪个能量更低,因为电子数不同。只能谈论在给定外电势下哪个能量更低。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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发表于 Post on 2021-4-27 10:23:34 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-4-26 19:10
查实验对于氮杂石墨烯的表征结果,每种氮分别有多大比例,然后画共振式确定每种氮的电荷

我之前看很多文献,石墨化氮(1个氮直接替换1个碳)都是自旋多重度为2来处理的,认为有一对孤对电子没成键,整体带电还是为0。那这种结果和带1个正电的基态都有可能吧,计算时似乎可以取能量低的,实验上怎么证明是哪个是对的
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发表于 Post on 2021-4-26 19:10:54 | 只看该作者 Only view this author
壹零壹室掃地僧 发表于 2021-4-26 11:06
请教一下,怎么知道实验上制备的氮掺杂石墨烯带多少电荷呢?这个和计算中设置的带1个电荷如何对应起来?

查实验对于氮杂石墨烯的表征结果,每种氮分别有多大比例,然后画共振式确定每种氮的电荷

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Zikuan Wang
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发表于 Post on 2021-4-26 11:06:43 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-4-25 15:37
正常石墨烯掺杂N是中性的。我指的是把石墨烯的一个C换成N,其他什么都不变,然后这个N带一个正电荷。这样 ...

请教一下,怎么知道实验上制备的氮掺杂石墨烯带多少电荷呢?这个和计算中设置的带1个电荷如何对应起来?
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发表于 Post on 2021-4-25 15:37:13 | 只看该作者 Only view this author
jiangning198511 发表于 2021-4-25 11:30
掺杂了一个N后带一个正电荷 ,是说掺杂后N带正电荷,附件的C带负电荷,发生了电子转移,整体仍是电中性, ...

正常石墨烯掺杂N是中性的。我指的是把石墨烯的一个C换成N,其他什么都不变,然后这个N带一个正电荷。这样理论上可以让石墨烯带一个正电荷,但是反正我没见过有人做出来过,你第一反应想得跟我不一样也印证了一般没有这种掺杂的石墨烯。。。
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发表于 Post on 2021-4-25 11:30:32 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-4-25 01:53
你考虑的是掺杂的石墨烯吗?如果是pristine的石墨烯,不可能吸附的,真空里可以吸附,一考虑溶剂水,吸附自 ...

掺杂了一个N后带一个正电荷 ,是说掺杂后N带正电荷,附件的C带负电荷,发生了电子转移,整体仍是电中性,这里不应该是表述为石墨烯带正电荷吧,石墨烯带正电荷意味着从石墨烯体系拿走一个电子

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发表于 Post on 2021-4-25 01:53:02 | 只看该作者 Only view this author
你考虑的是掺杂的石墨烯吗?如果是pristine的石墨烯,不可能吸附的,真空里可以吸附,一考虑溶剂水,吸附自由能肯定是不利的,因为表面是疏水的,而高价离子很亲水。
如果石墨烯带正电荷,比如掺杂了一个氮然后带一个正电荷,那还有戏。但是这种石墨烯实验上不好做,你算出来很可能是屠龙术,算的好像能吸附,但是几乎不可能有人在实验上做出来。
从实用角度讲,不如算石墨烯-阳离子表面活性剂-(AlF6)3-三元体系,阳离子表面活性剂的亲水端捕捉(AlF6)3-,疏水端吸附在石墨烯上。
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发表于 Post on 2021-4-23 00:09:42 | 只看该作者 Only view this author
gch123 发表于 2021-4-21 22:31
老师,我建好后发现矩形石墨烯层原子有260多个,会不会太多了,计算太费时间?不知道为什么上传不了图片 ...

仔细看置顶的新社员必读贴了解怎么贴图

260个不算多
再小一圈也不是不可以
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-21 22:31:49 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 gch123 于 2021-4-23 09:28 编辑
sobereva 发表于 2021-4-21 21:50
边界的碳与(AlF6)3-的最近距离应当不小于8埃

老师,我建好后发现矩形石墨烯层原子有260多个,会不会太多了,计算太费时间?不知道为什么上传不了图片了,不好直观显示我的模型

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-21 21:58:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-4-21 21:50
边界的碳与(AlF6)3-的最近距离应当不小于8埃

好的  谢谢老师

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发表于 Post on 2021-4-21 21:50:14 | 只看该作者 Only view this author
边界的碳与(AlF6)3-的最近距离应当不小于8埃

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