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[综合交流] 优化苯dimer两个平行时,优化出来有虚频,调整后优化发现不完全平行,改怎么调整

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优化苯dimer两个平行时,优化出来有虚频,调整后优化发现不完全平行,改怎么调整

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发表于 Post on 2021-5-3 03:15:21 | 只看该作者 Only view this author
402104120002 发表于 2021-4-24 10:34
如果二聚体可以共平面的话,优化没有共平面,那我应该如何设置使其共平面

这种设置没有任何实际意义,实际中本来就不是共平面的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2021-4-25 01:28:22 | 只看该作者 Only view this author
402104120002 发表于 2021-4-24 10:34
如果二聚体可以共平面的话,优化没有共平面,那我应该如何设置使其共平面

调整到共平面很简单,但单纯的调整成共平面可能不是你需要的。你要明确一下你需要的到底是:
(1)只要共平面就行,其他都不重要;还是
(2)在共平面的限制下能量最低
前者很好做,后者不是太容易做,但是后者更有物理意义
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2021-4-24 11:42:07 | 只看该作者 Only view this author
402104120002 发表于 2021-4-24 10:34
如果二聚体可以共平面的话,优化没有共平面,那我应该如何设置使其共平面

GView有调整二面角的选项,利用这个就可以调整两个苯环到平行或者共平面
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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发表于 Post on 2021-4-24 10:34:56 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2021-4-23 19:48
苯二聚体本来就不是平行的

如果二聚体可以共平面的话,优化没有共平面,那我应该如何设置使其共平面

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发表于 Post on 2021-4-23 21:15:33 | 只看该作者 Only view this author
平行是指近似平行,不可能严格平行,平行位错的苯二聚体构型的无虚频的实际极小点结构又不是D6h对称性的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-23 19:58:06 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2021-4-23 19:48
苯二聚体本来就不是平行的

那没有办法优化到平行结构吗?文献有提到平行结构的

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发表于 Post on 2021-4-23 19:48:16 | 只看该作者 Only view this author
苯二聚体本来就不是平行的

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