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[综合交流] oniom与普通方法的准确度比较

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在看gaussian网站对oniom的介绍的时候按照例子提示针对CH3-CH2-CHO进行oniom下的优化结构算频率计算,得到最低能量值-114.516,我又用不分层的方法计算,得到的能量居然是-193.143,为什么两者相差这么大呢,哪一种更准确,还是说这个例子选的不好?
输入文件分别贴一下:
# opt freq oniom(b3lyp/6-31g(d):pm3:amber)

# opt freq b3lyp/6-31g(d)

谢谢老师!

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发表于 Post on 2016-4-3 14:02:15 | 只看该作者 Only view this author
doris 发表于 2016-3-26 11:13
老师您好
如果用混合基组算频率的话,不同原子选用不同基组,选择的原则是什么?混合基组算频率的谐振频 ...

不重要的,和反应、相互作用区域远的原子用小基组,比如3-21G,而重要区域用大基组,比如TZVP。中间区域可以用中等基组,比如6-31G*。这要凭直觉和经验。
混合基组下没有直接能用的频率校正因子。

勾了那个就是做非谐振计算,这要通过有限差分算能量的4阶导数,会很耗时,稍大点的体系都很难做得动。此时就不用考虑频率校正因子了。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-3-26 11:13:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-3-25 21:21
1误差极大
2 根本不能节约耗时
3 不理想

老师您好
如果用混合基组算频率的话,不同原子选用不同基组,选择的原则是什么?混合基组算频率的谐振频率校正因子应该怎么考虑?
另一个问题是,在用gaussian09 D01计算OPT+FREQ时有一个选项是Anharmonic Corrections,如果勾选这个的话,计算结果分析时是否还需要加入校正因子?

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发表于 Post on 2016-3-25 21:21:13 | 只看该作者 Only view this author
doris 发表于 2016-3-25 20:08
sob老师,我想问下对于大的分子团簇,1.oniom分层计算,2.freeze一部分外层原子,3.整体选用低精度的基组 ...

1误差极大
2 根本不能节约耗时
3 不理想
想节约耗时用混合基组就完事了
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发表于 Post on 2016-3-25 20:08:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-12-4 00:31
ONIOM这东西能不用尽量不用,用混合基组是比ONIOM明显更优雅的做法。用了ONIOM会导致很多任务和分析没法做 ...

sob老师,我想问下对于大的分子团簇,1.oniom分层计算,2.freeze一部分外层原子,3.整体选用低精度的基组计算   哪个方法结果更可靠,误差更小。谢谢

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发表于 Post on 2015-12-4 00:32:59 | 只看该作者 Only view this author
万卷书万里路 发表于 2015-12-4 00:01
恩,谢谢!懂了,那这样说的话,我能不能引申到半导体材料的计算上,比如,如果对某一个分子算homo、lumo ...

同一个计算级别对不同分子算的HOMO、LUMO能量是有可比性的,因为这是有化学意义的数据,凡是有化学意义的数据就有可比性。绝对能量没有化学意义,不同级别得到的结果完全没有可比性。
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发表于 Post on 2015-12-4 00:31:30 | 只看该作者 Only view this author
ONIOM这东西能不用尽量不用,用混合基组是比ONIOM明显更优雅的做法。用了ONIOM会导致很多任务和分析没法做,而且不同层之间的电子结构的相互影响无法表现得很理想,ONIOM这种洋葱计算方式本身也会引入误差。
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发表于 Post on 2015-12-4 00:15:17 | 只看该作者 Only view this author
双层ONIOM做一次单点 实际上是做了三次不同的单点计算,每一次计算的准确度都会影响最后的准确度。
这个还是比较蛋疼的,如果你想算gap,感觉不是很好。
有的时候还是大基组+小基组混合比较实用。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-12-4 00:01:10 | 只看该作者 Only view this author
zjutwbai 发表于 2015-12-3 23:47
对同一个分子,不同基组下计算出的能量值不具有可比性;
oniom 三层不同的基组,计算出的值与单层的值也不 ...

恩,谢谢!懂了,那这样说的话,我能不能引申到半导体材料的计算上,比如,如果对某一个分子算homo、lumo,不同的方法没有可比性,也就是用不同方法算出的homo值lumo的绝对大小差得多不重要,重要的是homo与lumo之间的能极差如果相似那就可以是吗?还是我的理解不对?

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发表于 Post on 2015-12-3 23:47:21 | 只看该作者 Only view this author
对同一个分子,不同基组下计算出的能量值不具有可比性;
oniom 三层不同的基组,计算出的值与单层的值也不具有可比性

只有相对值本身具有可比性,比如化学反应A+B->C, 优化构型后算能量差就是一个相对值,它是具有准确性分析的意义的

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