计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 5360|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 求助gaussian计算电荷出现错误

[复制链接 Copy URL]

14

帖子

0

威望

193

eV
积分
207

Level 3 能力者


错误的log文件:
"/home/hipeson/data/g09/g09" "/home/hipeson/data/zhuxin/gv/t_oz7.com"
Gaussian Submission Complete.
  File: /home/hipeson/data/zhuxin/gv/t_oz7.com
Gaussian Job Completed (PID = 37d7e, status = 256)
Can't execute file editor

202109081646447594..png (305.26 KB, 下载次数 Times of downloads: 22)

202109081646447594..png

4289

帖子

4

威望

9550

eV
积分
13919

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

6#
发表于 Post on 2021-9-9 10:16:59 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2021-9-9 10:23 编辑
iueh 发表于 2021-9-9 09:56
gaussian输出的log文件,上面没有显示任何报错信息,只是突然中止了,希望各位老师帮忙看一下。

不知道你是否清楚自己用hf/3-21G水平是出于什么目的。hf/3-21G水平做计算,这连本科生做作业的级别都不够,别说发表了,测试程序能否正常运行是可以的。看一些基本入门博文再做实际计算
《简谈量子化学计算中DFT泛函的选择》http://sobereva.com/272
《谈谈量子化学中基组的选择》http://sobereva.com/336

你贴的输出文件没有用,信息量为零。先学会书写合理的高斯输入文件(gjf)文件,然后直接向高斯提交计算,有报错的话,届时再将gjf和out文件上传之(未发表的工作,可以将坐标隐去,不过这也让别人没法检查你结构的合理性)。我这里举一个例子,仅供检测你的高斯有没装好,其中计算级别不能用于实际体系的计算
%nprocshared=1
%mem=200MB
%chk=h2.chk

#p RHF/STO-3G

title

0 1
H   0.0   0.0   0.0
H   0.0   0.0   0.6
[空行]
记得gjf文件末尾要放空行。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

14

帖子

0

威望

193

eV
积分
207

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-9-9 09:56:53 | 只看该作者 Only view this author
snljty 发表于 2021-9-8 17:24
报错信息没贴完整。
没必要用Gaussian算电荷,用Gaussian算个单点,把chk转成fchk,然后用Multiwfn载入fch ...

gaussian输出的log文件,上面没有显示任何报错信息,只是突然中止了,希望各位老师帮忙看一下。

202109090955439791..png (58.6 KB, 下载次数 Times of downloads: 23)

202109090955439791..png

cof-test.log

4.08 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

gaussian输出文件

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125156

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2021-9-8 18:08:31 | 只看该作者 Only view this author
既不要用M$的界面也不要用gview的界面提交Gaussian任务
Gaussian用户必须明白怎么自己用Gaussian进行计算,输入文件是什么、输出文件是什么,这种最基本的常识都不会根本没法做任何计算。

另建议好好看看
谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355http://bbs.keinsci.com/thread-4447-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

1187

帖子

5

威望

2876

eV
积分
4163

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2021-9-8 17:24:33 | 只看该作者 Only view this author
报错信息没贴完整。
没必要用Gaussian算电荷,用Gaussian算个单点,把chk转成fchk,然后用Multiwfn载入fchk就能很方便算十几种不同定义下的原子电荷了。看
http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/10.3866/PKU.WHXB2012281

http://sobereva.com/multiwfn/res/brief_intro.pdf
第64页后面
以及
http://sobereva.com/multiwfn/misc/Multiwfn_3.8_dev.pdf
的3.9节。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +2 收起 理由
Reason
sobereva + 2

查看全部评分 View all ratings

1万

帖子

0

威望

9888

eV
积分
22133

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2021-9-8 17:21:05 | 只看该作者 Only view this author
上传完整的高斯输出文件,而不是MS的输出文件,真正的错误信息都在高斯输出文件里。
如果不知道高斯输出文件是哪个,先谷歌搞清楚
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-24 17:07 , Processed in 0.174807 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list