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[GROMACS] 求助:伞形抽样结果是inf 和Nan

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各位老师好,小弟我最近在使用伞型抽样的方法研究小分子在一维孔道中的扩散势垒,得到的伞型图如下所示,通过GMX自带的WHAM分析得到的结果不是Inf就是nan。对于该结果,小弟这一块理论基础薄弱,因此有如下两个问题
1. 为啥会出现inf和Nan的值。
2. 如何才能避免出现这样的值。

2.png (16.26 KB, 下载次数 Times of downloads: 27)

WHAM分析结果

WHAM分析结果

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伞形图

伞形图
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发表于 Post on 2025-9-1 20:07:37 | 只看该作者 Only view this author
同样的问题,但我是250个文件进行wham分析,最后经过尝试发现可能是文件数目太多,分为40个一组进行分析没有问题

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发表于 Post on 2025-9-1 20:07:32 | 只看该作者 Only view this author
同样的问题,但我是250个文件进行wham分析,最后经过尝试发现可能是文件数目太多,分为40个一组进行分析没有问题

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发表于 Post on 2025-2-4 13:29:12 | 只看该作者 Only view this author
您好,我也遇到了这样的问题,histogram显示采样已经适当覆盖。但是wham计算结果出现inf。请问您是如何解决的?

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