PCM模型下找到的过渡态在SMD模型中找不到

songweiwei · 发表于 Post on 2022-1-10 21:19:15

本帖最后由 songweiwei 于 2022-1-11 23:56 编辑

老师们，我用M05-2X/6-31+g(d,p) 找一个羟基自由基提取氢的过渡态，溶剂是PCM的条件下有过渡态，但是将PCM换成SMD的情况下就找不到过渡态（没有虚频），这种情况应该怎么处理呢？
PS：找过渡态的时候是用"guess=read geom=check" 读取了溶剂为PCM过渡态的.chk文件。

sobereva · 发表于 Post on 2022-1-12 02:53:51

你是在默认的水溶剂下做的计算，然而这种情况下羧基应当是COO-的状态

你在PCM下找到的那个过渡态也不像是羟基自由基抽氢的过渡态，可以跑IRC看看，说不定只是OH朝向旋转的过渡态

WaterMirror · 发表于 Post on 2022-1-12 01:29:59

songweiwei 发表于 2022-1-12 00:07
SMD下没有虚频，但是收敛了。我用的是用SMD做的优化，同时也是在SMD下用双杂化泛函计算的能量。是因为这 ...

溶剂化模型不一样，尤其是SMD考虑了非极性部分，那势能面形状肯定会有所不同把

songweiwei · 发表于 Post on 2022-1-12 00:07:52

WaterMirror 发表于 2022-1-11 00:24
SMD下没有虚频，那么收敛到了什么？你是直接拿着PCM下的几何去做优化的吗？是否考察了SMD下的势能面？

SMD下没有虚频，但是收敛了。我用的是用SMD做的优化，同时也是在SMD下用双杂化泛函计算的能量。是因为这个过渡态在SMD下找不到，所以采用了PCM打算找一下过渡态，再读取.chk文件，找SMD下的过渡态。请教一下，这里的SMD势能面指的是什么呢？

songweiwei · 发表于 Post on 2022-1-12 00:02:57

wzkchem5 发表于 2022-1-11 00:15
用PCM的时候，过渡态虚频有多大？活化能有多大？

虚频是-317.55，活化能我没有计算，因为我在计算的过程中用的都是SMD模型，是在找过渡态的时候找不到才用了一下PCM模型找一下过渡态初猜。

songweiwei · 发表于 Post on 2022-1-11 23:58:25

sobereva 发表于 2022-1-11 03:12
两次输出文件压缩后上传，别人一看就知道怎么回事，盲猜不可能给你准确的回复，你还得在别人的不断提示下反 ...

谢谢老师提醒，文件已经上传

sobereva · 发表于 Post on 2022-1-11 03:12:26

两次输出文件压缩后上传，别人一看就知道怎么回事，盲猜不可能给你准确的回复，你还得在别人的不断提示下反复打字描述

WaterMirror · 发表于 Post on 2022-1-11 00:24:33

SMD下没有虚频，那么收敛到了什么？你是直接拿着PCM下的几何去做优化的吗？是否考察了SMD下的势能面？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-1-11 00:15:35

用PCM的时候，过渡态虚频有多大？活化能有多大？

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[新手求助] PCM模型下找到的过渡态在SMD模型中找不到