8375c的配置好，还是7T83的好？

hgyhgy

主要使用VASP.   8375c好像降价了，预算足够买4台，加一台i5作为登录节点和存储节点。预算不足够全部购买32G内存。因此两台32G，两台16G。千兆网连接。两台32G之间用ib线直连。两台16G的一样。采用56 的ib卡。
大家看看这样是否有问题？





另外也考虑7T83的机器。这个只足够买两台。还在考虑有什么便宜一点的，可以作为登录节点和存储节点。8375c会超预算。


是否可以考虑把版主推荐的
CPU：2* XEON Platinum 8175M正式版（24核2.5G，全核睿频到3.1G，散，无集显）2*4200
散热器：2* 金钱豹LGA3647 散热器  2*210
主板：永擎EP2C621D12 WS 3500
机械硬盘：希捷 企业级 银河Exos 4TB 256MB 7200rpm SATA3 (ST4000NM000A) 990
固态硬盘：三星PM981a 2TB 1500
内存：12* 三星DDR4-2666 ECC REG 16GB  12*450
电源：振华LEADEX HG 750W 820  
机箱：追风者614PC 550
键盘鼠标：罗技MK200 多媒体套装  90
总价：约21700


作为登录节点和存储节点，也能用于计算？

hgyhgy

biogon 发表于 2022-3-30 12:46
那纯粹就是vasp的问题，定制版和普通版本除了频率没有区别，跑别的程序都好好的

这个其实主要是因为预算买不了3台。2台对4台，怎么也不划算。这个和个人买电脑有一点不一样。个人买电脑，可以因为性价比更高一点，提高一点预算。如果恰巧能买3台，那么显然3台就比4台8375c要好了。

gog

biogon 发表于 2022-3-30 12:46
那纯粹就是vasp的问题，定制版和普通版本除了频率没有区别，跑别的程序都好好的

AMD的cpu跑VASP，可能还有些问题。
AMD的优势是cpu自带的缓存大，计算效能比intel的略高点。整些其他计算都还好。
很想更新到AMD平台跑计算呢

biogon

hgyhgy 发表于 2022-3-28 09:11
我看到有说法是vasp6.3才支持三代。但实际上并没后续说明，没说清楚用了vasp.3后，速度是否正常了。

...

那纯粹就是vasp的问题，定制版和普通版本除了频率没有区别，跑别的程序都好好的

abin

hgyhgy 发表于 2022-3-30 10:37
多节点并行，每个mpi所需内存就会减少。

一个节点的情况，是因为总内存不会增加，你只能减少核数跑来 ...

合理使用 MPI + OpenMP混合并行方案, 才能有效降低内存占用....
要么就买内存条....

hgyhgy

KiritsuguPapa 发表于 2022-3-29 13:55
主要是每核内存不够 即使跨节点并行每核内存也不会变多 除非减少核数跑……（但是就浪费一些cpu空闲着了

多节点并行，每个mpi所需内存就会减少。

一个节点的情况，是因为总内存不会增加，你只能减少核数跑来增加每个mpi可用的内存。

你用两个节点跑，每个mpi所需内存就会减少，虽然不会按比例减少。vasp不可能内存效率那么低，把完全相同的内存复制许多份的。你想一下就明白，比如机器有128核，难道真的把内存复制128份吗？然后每一核需要的内存相对于单核运行时的不会减少？它只是把某些共用数据会复制多份，不可能把所有内存数据复制那么多份。

你可以试试。我看使用说明，都是内存不足，可以减少核数来跑，或者增加节点来跑。

KiritsuguPapa

hgyhgy 发表于 2022-3-29 09:29
那双节点并行呀。就算千兆网，双节点并行的效率也不太差的。3节点就不行。
如果是一个64g，其他是16g,  ...

主要是每核内存不够 即使跨节点并行每核内存也不会变多 除非减少核数跑……（但是就浪费一些cpu空闲着了

hgyhgy

KiritsuguPapa 发表于 2022-3-28 18:13
不是啊 单条64G、128G都可以用（指X12+8375）
少用一些核当然是可以但是浪费啊（

那双节点并行呀。就算千兆网，双节点并行的效率也不太差的。3节点就不行。
如果是一个64g，其他是16g, 那么就算你想平行，效果也不行呀。只能每个节点最多使用16g。

KiritsuguPapa

hgyhgy 发表于 2022-3-28 09:08
这个机器最多支持32G的吧？

如果你内存不够用，可以这样做：使用比节点数少的核心数，或者多节点并行 ...

不是啊 单条64G、128G都可以用（指X12+8375）
少用一些核当然是可以但是浪费啊（

KingHPC

预算充足用7T83  其次用8375C

hgyhgy

KiritsuguPapa 发表于 2022-3-27 15:01
跑vasp不要用7t83 速度慢很多 试过很多办法编译都不行

我看到有说法是vasp6.3才支持三代。但实际上并没后续说明，没说清楚用了vasp.3后，速度是否正常了。

但我也怀疑定制版，是否削减了某些方面，导致不太适合科学计算。7t83的频率和7663的相同，价格却相差那么多。

hgyhgy

KiritsuguPapa 发表于 2022-3-27 15:09
另外建议弄一台64Gx16，剩下的都用16Gx16，因为算vasp经常是如果256G内存不够用，那么512G也不会够用，最好 ...

这个机器最多支持32G的吧？

如果你内存不够用，可以这样做：使用比节点数少的核心数，或者多节点并行计算（可以适当减少核心数）。

Vasp并行的过程中，内存数据并非只有一份的，多份拷贝就容易内存不足。比如你64个核，然后你只用32个核，每一个mpi能用的内存就多。

KiritsuguPapa

主节点可以考虑用8175，支持avx512编译程序方便，如果用e5你还得去计算节点编译

KiritsuguPapa

另外建议弄一台64Gx16，剩下的都用16Gx16，因为算vasp经常是如果256G内存不够用，那么512G也不会够用，最好还是搞个1T内存的节点。

KiritsuguPapa

跑vasp不要用7t83 速度慢很多 试过很多办法编译都不行