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[新手求助] DLPNO-CCSD(T)与DFT能量相差太大

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本帖最后由 yuyangzap 于 2022-4-25 11:02 编辑

各位老师好,我计算一个纯有机反应的自由能垒。各种泛函B3LYP-D3BJ,PBE0-D3BJ,M062X-D3计算的自由能垒都大概为7.5 kcal/mol,随后我使用ORCA的DLPNO-CCSD(T)/def2-TZVP想把这个自由能垒最终确定下,最终的G(DLPNO_CCSDT)=E(DLPNO_CCSDT)+G(solv)+G(coor),其中G(solv)是在PBE0-D3BJ/6-311++G**级别下计算,G(coor)是PBE0-D3BJ/6-31G*计算得到,最终DLPNO-CCSD(T)计算得到自由能垒为15kcal/mol,比起DFT的结果高了几乎两倍。我又考虑到是否是溶剂化和自由能校正的影响,单独计算电子能垒。DFT的电子能垒为9kcal/mol左右,而DLPNO-CCSD(T)的电子能垒为20kcal/mol,这让我很困惑,因为DFT的结果更是复合我的预期,反而DLPNO-CCSD(T)的结果高的很多,我最终应该选择哪一种方法的结果呢?DLPNO-CCSD(T)/def2-TZVP使用的是def2-TZVP/C辅助基组配合normalPNO,我换成tightPNO会好一点么?不太理解为什么DLPNO-CCSD(T)会给出那么高的结果。

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发表于 Post on 2025-4-26 19:28:06 | 只看该作者 Only view this author
lycheeho 发表于 2025-4-26 15:18
你好,我用gaussian算完casscf后,想知道分子基态各组态的比例,请教您该怎么分析呢?谢谢!

参考北京科音高级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KAQC)讲Gaussian做CASSCF的幻灯片:

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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发表于 Post on 2025-4-26 15:18:30 | 只看该作者 Only view this author
Freeman 发表于 2022-4-27 16:20
我最近也遇到了这样的情况:DFT的结果合理,且是闭壳层;闭壳层DLPNO-CCSD(T)的能量不合理,RHF波函数不稳 ...

你好,我用gaussian算完casscf后,想知道分子基态各组态的比例,请教您该怎么分析呢?谢谢!

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发表于 Post on 2022-12-7 22:06:18 | 只看该作者 Only view this author
gauss98 发表于 2022-12-7 21:25
请问你的问题解决了吗?
我也遇到了类似问题
困扰好久了

该贴前面诸多楼层中有可能的详细原因介绍,强烈建议按前已介绍的原因 先自行分析;若你已分析过,应告诉大家你排除了哪些原因。
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发表于 Post on 2022-12-7 21:25:19 | 只看该作者 Only view this author
yuyangzap 发表于 2022-4-25 11:12
PBE0-D3BJ        DLPNO-CCSD(T)
complex(a.u.)        -4669.30         -4664.91
TS(a.u.)            -4669.28         -4664 ...

请问你的问题解决了吗?
我也遇到了类似问题
困扰好久了

一个多步反应,DFT结果跟实验基本正确, dlpno-ccsd(t)有定量改进,但是对其中一步的TS不正常的偏高(6-8kcal//mol)导致整个反应曲线决速步都变了,整个机理都走不通了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-27 17:56:57 | 只看该作者 Only view this author
Freeman 发表于 2022-4-27 16:24
这个orca的输入文件运行起来没报错吗?def2/jk和rijcosx是互斥的,应该不能写在一块儿;而且第一行既然写 ...

不会报错,你可以试试,辅助基组可以选择其他的jk基组比j基组大一点,我想这样误差会小一点。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-27 17:56:07 | 只看该作者 Only view this author
Freeman 发表于 2022-4-27 16:20
我最近也遇到了这样的情况:DFT的结果合理,且是闭壳层;闭壳层DLPNO-CCSD(T)的能量不合理,RHF波函数不稳 ...

嗯,我用开壳算一下试试

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发表于 Post on 2022-4-27 16:31:13 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2022-4-27 16:24
C18应该不能用RHF的“HOMO和LUMO为活性空间”。。。即使硬要算CAS(2,2),至少也得用UNO的HONO,LUNO作为 ...

嗯,严谨一些。

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发表于 Post on 2022-4-27 16:24:54 | 只看该作者 Only view this author
yuyangzap 发表于 2022-4-25 11:12
PBE0-D3BJ        DLPNO-CCSD(T)
complex(a.u.)        -4669.30         -4664.91
TS(a.u.)            -4669.28         -4664 ...

这个orca的输入文件运行起来没报错吗?def2/jk和rijcosx是互斥的,应该不能写在一块儿;而且第一行既然写了def2/jk,后面就不用%basis里的aux了。

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发表于 Post on 2022-4-27 16:24:26 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2022-4-27 16:26 编辑
Freeman 发表于 2022-4-27 16:20
我最近也遇到了这样的情况:DFT的结果合理,且是闭壳层;闭壳层DLPNO-CCSD(T)的能量不合理,RHF波函数不稳 ...

C18应该不能用RHF的“HOMO和LUMO为活性空间”。。。即使硬要算CAS(2,2),至少也得用UNO的HONO,LUNO作为活性轨道。不过CAS(2,2)当然是不够的,往上一个选择是CAS(8,8),比较完美的话就上DMRG-CASSCF(36,36)。
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发表于 Post on 2022-4-27 16:20:31 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Freeman 于 2022-4-27 16:38 编辑

我最近也遇到了这样的情况:DFT的结果合理,且是闭壳层;闭壳层DLPNO-CCSD(T)的能量不合理,RHF波函数不稳定;开壳层DLPNO-CCSD(T)能量合理,UHF波函数稳定。在别的帖子,@wzkchem5指出自旋极化单重态虽然自旋密度有问题,但能量基本是合理的。建议楼主直接用开壳层DLPNO-CCSD(T)的能量就好了。
HF本来就比DFT容易判定闭壳层波函数不稳定,而且高HF成分的杂化泛函比低HF成分的杂化泛函容易判定闭壳层波函数不稳定,属于常见正常现象,可能是HF本身的问题。比如算18碳环,RDFT是稳定的;RHF波函数却是不稳定的,UHF才稳定;但是用CASSCF,以HOMO和LUMO为活性空间算过之后,发现还是闭壳层组态占比90%以上。真是奇妙的大自然啊。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-25 11:12:48 | 只看该作者 Only view this author
                   PBE0-D3BJ        DLPNO-CCSD(T)
complex(a.u.)        -4669.30         -4664.91
TS(a.u.)            -4669.28         -4664.87
delta E(kcal/mol) 11.38         22.38

使用的关键词:! DLPNO-CCSD(T) tightscf def2-TZVP def2-TZVP/C def2/JK RIJCOSX DEFGRID3
%basis
      aux "def2/jk"
      end

使用程序ORCA5.0.2,使用DLPNO-CCSD(T1)计算过得到相同的结果,采用PBE0的波函数进行初猜,也会得到同样的结果。关于RHF的收敛性,波函数检测后会提示RHF>UHF instability,然后给出C原子交替出现+0.5和-0.5左右spin的open-shell singlet,但是我认为这种波函数是不正确的,就应该是closed-shell。而对于RPBE0进行波函数检测,结果显示是稳定的。现在尝试使用tightPNO试一试,但是体系有点大,计算太慢了。还有一种可能性,我阅读了ORCA论坛后,有人说,可能是DFT和CC方法的势能面本身就不一样,这种情况怎么算也无法达到一致的势能面,也有这种可能性。

complex.gjf

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TS.gjf

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发表于 Post on 2022-4-13 14:18:07 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2022-4-13 14:19 编辑
yuyangzap 发表于 2022-4-13 08:24
进行了波函数稳定性检测,发现RHF的波函数不稳定,会有个能量更低的UHF,但是自旋分布非常离谱,对于single ...

大家之前的回答都是基于你的分子模型和计算过程是合理的,但此次你说“对于singlet的自旋污染高达28”,这说明很有可能:(1)你的分子模型是错的(例如直接拿晶体结构过来,没注意要补氢);(2)你读错了<S**2>值;(3)体系有多参考特征,你却以为是常规有机体系。

这样一来一回效率太低了,强烈建议你晒出你的分子(最好以附件gjf文件形式),你算的HF、DFT、DLPNO-CCSD(T)能量,和HF计算、DLPNO-CCSD(T)计算的关键词,这样大家可以在1~2次内就给出精准、有针对性的建议。如果文章没发表、不想分享坐标文件,至少应给出分子截图,描述各个官能团,提供电子能量数值。精准的提问才能得到精准的回答。
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发表于 Post on 2022-4-13 12:30:33 | 只看该作者 Only view this author
http://sobereva.com/378 各种后HF方法精度简单横测中提到,以DFT波函数为参考态做CCSD(T)结果很差,DLPNO-CCSD(T)估计也不行。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-13 08:24:08 | 只看该作者 Only view this author
进行了波函数稳定性检测,发现RHF的波函数不稳定,会有个能量更低的UHF,但是自旋分布非常离谱,对于singlet的自旋污染高达28。然而我对DFT的波函数进行检测后发现,DFT的RKS波函数是稳定的,现在想用DFT的波函数来做DLPNO-CCSD(T)看看结果怎么样。

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