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[新手求助] 跑gaussian出现的blank line 报错

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本帖最后由 lisanoid 于 2022-4-26 10:00 编辑

我跑一个肿瘤相关蛋白质的分子动力学(PDBID:2OH4),其中涉及到1个非标准氨基酸(缩写:PTR),想使用社长的sobtop来生成拓扑文件。
我按照操作将氨基酸乙酰化和甲胺化以后,用win版高斯做优化和振动分析。结果出现报错:
Input section not terminated by blank line.
Error termination via Lnk1e in C:\G09W\l9999.exe at Tue Apr 26 02:21:45 2022.
Job cpu time:   
我想请问一下,这个gjf文件写的有问题吗?请方家指教


PTR.gjf

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发表于 Post on 2022-4-26 10:26:21 | 只看该作者 Only view this author
Input section not terminated by blank line写的很清楚了,结尾少个空行。
一般没必要输出wfn文件,对于你这种任务要是做波函数分析,把fch给Multiwfn就行了。另外如果你没改Default.Rou,你这么写是单核计算。
另外建议不要用这么老版本的Gaussian,如果是G09 D版本,连BJ阻尼的D3的Hessian都有bug。

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发表于 Post on 2022-4-26 10:24:26 | 只看该作者 Only view this author
有可能输入文件最后没空两行。
ORCA大法好!算得快,还免费,我爷爷的爷爷都说不赖!
山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔᵊ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ。

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