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[波函数分析求助] 用fchk文件绘制静电势图片的问题

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最近在学习绘制静电势着色的分子范德华表面图http://sobereva.com/443。我是在Linux版G16优化计算的,并将chk转换为fchk,因此无法再通过Windows版Gaussian自带的formchk转换fch文件。
如果要继续Sobereva的给出的方法画图,是不是只要将ESPiso.bat、ESPpt.bat、ESPext.bat文件中的fch全部编辑替换为fchk,就行了?
其他的ESPiso.txt、ESPpt.txt、ESPext.txt和vmd文件保持不变。
这么理解与操作,有问题么?

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发表于 Post on 2022-5-27 03:15:27 | 只看该作者 Only view this author
88166953 发表于 2022-5-26 19:28
sob老师,VMD作图不能直接保存为图片,是只能通过截图软件获取吧?

显然能,而且通常都不建议截图
看此文相关部分
用Multiwfn+VMD做RDG分析时的一些要点和常见问题
http://sobereva.com/291http://bbs.keinsci.com/thread-1206-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-26 19:28:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-26 03:51
fch和fchk是一码事,下文明确说了
详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
http://sobe ...

sob老师,VMD作图不能直接保存为图片,是只能通过截图软件获取吧?

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发表于 Post on 2022-5-26 03:51:47 | 只看该作者 Only view this author
88166953 发表于 2022-5-25 15:35
怎么用formchk的命令转为fch后缀?
出来的应该是fchk后缀吧?

fch和fchk是一码事,下文明确说了
详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
http://sobereva.com/379http://bbs.keinsci.com/thread-6020-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-5-26 01:23:52 | 只看该作者 Only view this author
更改脚本中.fch为fchk或者直接右键重命名为.fch文件就行

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发表于 Post on 2022-5-25 15:40:32 | 只看该作者 Only view this author
88166953 发表于 2022-5-25 15:35
怎么用formchk的命令转为fch后缀?
出来的应该是fchk后缀吧?

/[瓜丝目录]/formchk 文件名.chk 文件名.fch

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-25 15:35:31 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-5-25 12:31
我也是用Linux版G16计算的,那个fchk和fch只是后缀不一样,你把后缀改一下就行。或者formchk的命令行里就转 ...

怎么用formchk的命令转为fch后缀?
出来的应该是fchk后缀吧?

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发表于 Post on 2022-5-25 13:34:33 | 只看该作者 Only view this author
自己把fchk改成fch就行

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88166953 + 1 谢谢

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发表于 Post on 2022-5-25 12:31:06 | 只看该作者 Only view this author
我也是用Linux版G16计算的,那个fchk和fch只是后缀不一样,你把后缀改一下就行。或者formchk的命令行里就转换成fch后缀的文件。
ORCA大法好!CP2K大法好!
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