求助cp2k运行时出现WARNING

zhukangg

大家好：
我尝试了编译CP2K9.1，通过openmpi/4.1.1以及GCC/9.3.0编译的，toolchain和make全部正常结束，test也是0error全过。但是在运行的时候总是会报错：
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By default, for Open MPI 4.0 and later, infiniband ports on a device
are not used by default.  The intent is to use UCX for these devices.
You can override this policy by setting the btl_openib_allow_ib MCA parameter
to true.

  Local host:              node268
  Local adapter:           mlx4_0
  Local port:              1

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WARNING: There was an error initializing an OpenFabrics device.

  Local host:   node268
  Local device: mlx4_0
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[node268:24113] 23 more processes have sent help message help-mpi-btl-openib.txt / ib port not selected
[node268:24113] Set MCA parameter "orte_base_help_aggregate" to 0 to see all help / error messages
[node268:24113] 23 more processes have sent help message help-mpi-btl-openib.txt / error in device init

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作业提交脚本为：
#!/bin/bash
module purge
module load openmpi/4.1.1/gcc/9.3.0   

bsub -J cp2ktest -q test -n 24  -o %J.out -e %J.err   mpirun -np 24 cp2k.psmp  cp2k.inp


请问这是什么原因呢？会对计算速度甚至结果产生什么影响呢，以及需要如何改进？
谢谢各位老师！

LittlePupil

记得这个问题在OpenMPI官方的Q&A里有提到，具体会对计算有什么影响不太清楚。

可以在mpirun后面加入--mca btl '^openib', 实测可以解决这个Warning.
也可以试试在bsub前加一行export OMPI_MCA_btl_openib_allow_ib=1.