笼状氨基酸八聚物的topology文件的书写

wweng · 发表于 Post on 2016-4-11 15:26:57

最近用gaussview构建了一氨基酸八聚物的笼状分子结构，160个原子左右，现在想用NAMD做下分子动力学模拟，只有gaussview的到的pdb文件，想请教各位这种结构的大分子该如何写topology文件？

wweng · 发表于 Post on 2016-4-12 10:48:07

谢谢啦。

ruanyang · 发表于 Post on 2016-4-11 17:04:49

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[NAMD] 笼状氨基酸八聚物的topology文件的书写