笼状氨基酸八聚物的topology文件的书写

wweng

最近用gaussview构建了一氨基酸八聚物的笼状分子结构，160个原子左右，现在想用NAMD做下分子动力学模拟，只有gaussview的到的pdb文件，想请教各位这种结构的大分子该如何写topology文件？

ruanyang

使用这个工具试试https://cgenff.paramchem.org/

wweng

谢谢啦。