求助，关于伞形采样PMF计算的参数设定问题？

kadbuhao · 发表于 Post on 2022-6-16 16:09:57

各位老师，请问计算PMF时，得到的PMF值是牵引组和参考组之间的自由能吗？如果我牵引的是一个原子，但是需要计算的能力实际一个分子，该如何设置？有人说在计算PMF时，建立新的索引组，那牵引的质心不就由原子变成了分子吗？可能问题过于简单了，脑子一时没转过弯，大家不要见笑啊

fhh2626 · 发表于 Post on 2022-6-17 15:06:22

你说的每个词我都能看懂，就是连在一起我不知道是什么意思

建议你弄明白PMF的基本概念，然后确定你要研究的问题是否可以通过PMF计算确定

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[GROMACS] 求助，关于伞形采样PMF计算的参数设定问题？