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[ORCA] 求助MacOS版ORCA并行计算报错问题

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您好,我的ORCA版本是5.0.3,使用了对应的Open MPI 4.1.1版本。Open MPI的编译和安装正常结束,但在进行并行计算的时候报错(串行计算无问题)。环境变量设置如下:
通过which mpirun、mpirun --version检查了一下Open MPI的安装,没有问题。同时按照之前论坛里一些讨论的方法检查了gfortran、gcc的版本,同时使用echo检查了一下当前的环境变量,如下:

然而运行ORCA的时候报错如下:

发现程序根本没有在应该寻找“libmpi.40.dylib”的目录(即/Users/weida_feng/openmpi411/lib,此目录已加入环境变量)下去寻找此文件,因此提示找不到该文件。请问这种情况要如何解决呢?感谢您的解答!

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发表于 Post on 2022-6-19 21:32:35 | 只看该作者 Only view this author
在macOS下,变量名有变化:
export DYLD_LIBRARY_PATH=${OPENMPI_LIB}:${DYLD_LIBRARY_PATH}

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发表于 Post on 2022-6-19 21:22:06 | 只看该作者 Only view this author
BLL130 发表于 2022-6-19 21:10
问题已解决,解决方式如下:

ORCA网站上现在已经有支持ARM64的版本可以下载了,M1芯片的MacBook下载的时 ...

也可能是 /opt 下的 homebrew arm 路径没有添加到环境变量里,可以再试试排查一下

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发表于 Post on 2022-6-19 21:21:19 | 只看该作者 Only view this author
BLL130 发表于 2022-6-19 21:10
问题已解决,解决方式如下:

ORCA网站上现在已经有支持ARM64的版本可以下载了,M1芯片的MacBook下载的时 ...

可以直接软链接 ln -s 过去,这样更少占空间

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-19 21:10:21 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 BLL130 于 2022-6-19 21:15 编辑

问题已解决,解决方式如下:

ORCA网站上现在已经有支持ARM64的版本可以下载了,M1芯片的MacBook下载的时候选择带“Arm64”字样的即可,我选的是“ORCA 5.0.3, MacOS X, Arm64(Accelerate), .tar.xz Archive”。之后Open MPI可以不自行编译,我是直接命令行输入的“brew install openmpi”即自动下载了Arm64版的Open MPI。版本为4.1.4,但是ORCA 5.0.3可以正常运行。
之后最关键的一步是将自动下载的位于/opt/homebrew/Cellar/open-mpi/4.1.4/的文件移至/usr/local/下,不知道为甚么ORCA不能识别/opt/下的Open MPI,我用的命令如下:
sudo cp -r /opt/homebrew/Cellar/open-mpi/4.1.4/bin/ /usr/local/bin/
sudo cp -r /opt/homebrew/Cellar/open-mpi/4.1.4/lib/ /usr/local/lib/
随后就可以正常运行了,不知道这样会不会有什么隐患,可能也是歪打正着

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-19 21:05:24 | 只看该作者 Only view this author
mizu-bai 发表于 2022-6-19 19:27
可以试试通过 arm 版本的 homebrew 下载 openmpi,相比自己编译能少处理点依赖问题。这边是 Intel Mac 使用 ...

感谢,问题已解决。

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发表于 Post on 2022-6-19 19:27:46 | 只看该作者 Only view this author
可以试试通过 arm 版本的 homebrew 下载 openmpi,相比自己编译能少处理点依赖问题。这边是 Intel Mac 使用 ORCA 5.0.3,openmpi 使用 homebrew 安装的 4.1.4 版,也能正常运行,似乎对 openmpi 的版本要求没有太死。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-19 19:15:53 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2022-6-19 19:00
ORCA针对x86平台。

你的苹果电脑,是Apple silicon ,也就是ARM64架构。

感谢您的回复!我最近研究研究。

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发表于 Post on 2022-6-19 19:00:42 | 只看该作者 Only view this author
ORCA针对x86平台。

你的苹果电脑,是Apple silicon ,也就是ARM64架构。

一个简单的方案是,
安装x86的brew,并使用homebrew安装所需要的所有相关的x86库文件。

然后,就能用了。

总之,所有相关的组件,都使用x86就可以了。

仅供参考。
自己动手吧。

祝好。
苹果会自动帮您转换x86的二进制文件。
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http://tophpc.top:8080
电邮: ask@hpc4you.top

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