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[新手求助] Open molcas安装求助

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楼主
电脑小白,自己用ubantu系统装open molcas好多次了。但是到icc那段代码就会报错。有大佬能教一下吗?如果能帮忙安装就更好了,有偿(不熟悉行情,请大佬带价。联系方式qq:1850946273)挺急的,万分感谢

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发表于 Post on 2024-4-18 10:31:33 | 只看该作者 Only view this author
yellow233 发表于 2022-6-23 13:09
谢谢各位老师的帮助,已经安装好了,但是在测试自带的100个示例时,所有示例都显示failed。现在电脑不在身 ...

你好,请问你解决这个问题了吗?我运行这个验证套件也显示了很多套件都失败了
standard:000 Failed! ([none])     
standard:001 Failed! ([none])     
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standard:862 Failed! ([none])

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-6 09:22:43 | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2022-7-5 16:20
那你直接问作者本人吧。

好的,谢谢您的建议

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发表于 Post on 2022-7-5 16:20:27 | 只看该作者 Only view this author
yellow233 发表于 2022-7-5 15:40
老师您好,我的确需要了解这方面的一个运算。这个head文件是从一个晶胞中取出的一个分子做的运算吗,embe ...

那你直接问作者本人吧。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-5 15:40:26 | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2022-7-5 15:05
这不属于常见类型的计算,如果你只是学习openmolcas的话,不需要看这个。除非你是要重复文献的计算

老师您好,我的确需要了解这方面的一个运算。这个head文件是从一个晶胞中取出的一个分子做的运算吗,embedding文件是取出分子后的剩余晶胞(或者说是head文件的一个分子周围的环境吗?)

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发表于 Post on 2022-7-5 15:05:07 | 只看该作者 Only view this author
yellow233 发表于 2022-7-5 09:40
老师您好,这个其实是有2个有关seward的文件,一个是input.head,一个是input.embedding。主要是不知道emb ...

这不属于常见类型的计算,如果你只是学习openmolcas的话,不需要看这个。除非你是要重复文献的计算

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-5 09:40:09 | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2022-7-4 21:31
你这个输入从哪里学来的?我猜这只是个示例,实际计算中基本不会出现全电子基组和ecp混用的情况。你给所 ...

老师您好,这个其实是有2个有关seward的文件,一个是input.head,一个是input.embedding。主要是不知道embedding文件是怎么来的。所以只传了head文件。下面这个是seward的原文件

seward.zip

20.81 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-5 09:27:51 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2022-7-4 21:12
不知道。这种情况我平时都是这样的:写个gjf文件
#p RHF genecp nosymm int(DKH2,nobasistransform) gue ...

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 2022-7-4 21:31:01 | 只看该作者 Only view this author
yellow233 发表于 2022-7-4 10:20
各位老师好,我在运行seward模块时遇到一些问题。下面input文件是借用了Seijo Luis写的input的内容。但是运 ...

你这个输入从哪里学来的?我猜这只是个示例,实际计算中基本不会出现全电子基组和ecp混用的情况。你给所有原子都用ANO-RCC系列就行了。

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发表于 Post on 2022-7-4 21:12:36 | 只看该作者 Only view this author
yellow233 发表于 2022-7-4 19:49
好的,谢谢老师。按照您的代码没有keyword报错了。但还是运行错误。我对照了一下 Basis set的基集。发现 ...

不知道。这种情况我平时都是这样的:写个gjf文件
#p RHF genecp nosymm int(DKH2,nobasistransform) guess(only,save)

title

0 1
[坐标]
[空行]
[基组和赝势]
[空行]
[空行]

把gjf提交给高斯,一两秒后算完,获取fch文件
formchk a.chk a.fch

获取OpenMolcas输入文件(会生成.input和.INPORB文件)
fch2inporb a.fch
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-4 19:49:50 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2022-7-4 10:28
仅就R02O而言,这个是因为旧版OpenMolcas开启DKH2哈密顿关键词确实是R02O,但最近两年的版本改了,是RELA ...

好的,谢谢老师。按照您的代码没有keyword报错了。但还是运行错误。我对照了一下 Basis set的基集。发现了一些问题。Pr和F的primitive的电子排布对不上。Ba的基集完全没有。(Seijo Luis用的是molcas,有没有可能基集有修改?)

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发表于 Post on 2022-7-4 10:28:54 | 只看该作者 Only view this author
yellow233 发表于 2022-7-4 10:20
各位老师好,我在运行seward模块时遇到一些问题。下面input文件是借用了Seijo Luis写的input的内容。但是运 ...

仅就R02O而言,这个是因为旧版OpenMolcas开启DKH2哈密顿关键词确实是R02O,但最近两年的版本改了,是RELAtivistic = R02O

其他基组、赝势和坐标部分我看不懂,不知道有没问题。我自己平时都是用fch2iporb小程序从fch文件生成OpenMolcas输入文件的。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-4 10:20:00 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,我在运行seward模块时遇到一些问题。下面input文件是借用了Seijo Luis写的input的内容。但是运行时显示R02O不是关键词。我也试过改成R02O02,但还是显示no keyword。然后我还试着删除了R02O这个关键词,又显示了以下问题。(附带图和input文件)。所有内容都是自己摸索的,还望老师们不吝赐教。

2022-07-04 09-33-12 的屏幕截图.png (251.88 KB, 下载次数 Times of downloads: 54)

2022-07-04 09-33-12 的屏幕截图.png

seward.input

613 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 4

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-24 09:42:42 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2022-6-23 14:52
非也,分清楚内存和硬盘。“只给了linux系统100个G然后分了50个G给根目录”这说的是硬盘,不是内存。运行 ...

谢谢老师,改了运行内存后可以运行了。感谢您这段时间的帮助

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发表于 Post on 2022-6-23 14:52:40 | 只看该作者 Only view this author
yellow233 发表于 2022-6-23 14:37
谢谢老师,主要只给了linux系统100个G然后分了50个G给根目录。还有50g是空出来的,所以我以为是够用的。 ...

非也,分清楚内存和硬盘。“只给了linux系统100个G然后分了50个G给根目录”这说的是硬盘,不是内存。运行free -h或free -g查看当前Linux系统内存情况
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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