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[新手求助] 含过渡金属的团簇几何优化scf不收敛

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楼主
各位老师好,本人在利用Gaussian16进行PCN-777(MOF)的优化时,遇到了SCF不收敛问题,研读了sob老师的解决SCF不收敛问题的方法 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)这篇博文,尝试了其中几种方法后,依旧难以收敛,考虑是不是截取的片段有问题,请各位老师帮忙检查一下!

PCN-777的单位分子式.jpg (108.32 KB, 下载次数 Times of downloads: 36)

PCN-777的单位分子式.jpg

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发表于 Post on 2022-7-3 18:52:07 | 只看该作者 Only view this author

结构不合理,Zr上两个羟基的氧原子靠得太近了。
去文献里找一下Zr上配了两个羟基、且两个羟基处于邻位的配合物,量一下氧原子之间的距离,然后把你初始结构里的距离也改成那个数值
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-3 18:46:01 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wyqms 于 2022-7-3 18:47 编辑
北大-陶豫 发表于 2022-7-3 17:26
麻烦再贴一下输入输出文件吧

感谢您的回复

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发表于 Post on 2022-7-3 17:26:11 | 只看该作者 Only view this author
麻烦再贴一下输入输出文件吧
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-3 17:02:00 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wyqms 于 2022-7-3 17:03 编辑

老师您好,我调整了电荷和化学键的键长还是无法收敛,收敛限=6的程度都达不到,重新构建了团簇重复以上步骤依旧连收敛限=6都达不到,请问老师我要怎么处理,还望老师指点

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-3 16:50:21 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-7-1 17:30
这种问题自己查IOp手册,http://gaussian.com/iops/

老师您好,我尝试了调整电荷,也调整了团簇化合键长还是无法收敛,就连降低收敛限=6的程度都满足不了,甚至重新选取了团簇重复上面步骤依旧连收敛限为6都做不到。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-1 20:02:38 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-7-1 17:30
这种问题自己查IOp手册,http://gaussian.com/iops/

多谢老师的指点,我马上去优化,谢谢老师了

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发表于 Post on 2022-7-1 17:30:46 | 只看该作者 Only view this author
wyqms 发表于 2022-7-1 10:25
老师,我重新算的是-10,另外,关于计算MK电荷计算的关键词,手册只给了Pop=MK IOp(6/50=1),但是我在本 ...

这种问题自己查IOp手册,http://gaussian.com/iops/
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-1 17:25:48 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-7-1 16:16
这里面所有氧都是-2价的

老师,我重新算的是-10,另外,关于计算MK电荷计算的关键词,手册只给了Pop=MK IOp(6/50=1),但是我在本论坛看到有人用了pop=MK iop(6/33=2,6/41=10,6/42=17),后面的6/33这个代表的意义试什么,想要计算MK不需要加上6/50=1吗?

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发表于 Post on 2022-7-1 16:16:43 | 只看该作者 Only view this author
wyqms 发表于 2022-7-1 09:13
老师,周围有3个Zr-O键的氧是0价吗,应该按照 8个电子计算吗?我算的时候是按照结构式标的-2价算的,是不 ...

这里面所有氧都是-2价的
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-1 16:13:44 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-7-1 14:51
这个结构里有的C-O是单键,有的是双键,此外有的Zr-O键是共价键、有的是配位键,数电子的时候考虑到这两 ...

老师,周围有3个Zr-O键的氧是0价吗,应该按照 8个电子计算吗?我算的时候是按照结构式标的-2价算的,是不是这个地方不能用-2价算?

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发表于 Post on 2022-7-1 14:51:56 | 只看该作者 Only view this author
wyqms 发表于 2022-7-1 05:05
老师您好,电荷我是按照Zr周围36个电子,C-O键中的氧为周围9个电子,周围三个O-Zr键的O为10个电子计算的 ...

这个结构里有的C-O是单键,有的是双键,此外有的Zr-O键是共价键、有的是配位键,数电子的时候考虑到这两个问题了吗
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-1 12:05:00 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wyqms 于 2022-7-1 12:06 编辑
wzkchem5 发表于 2022-7-1 01:51
电荷还是数错了。如果用金属电荷数、配体电荷数加起来的方法数不清楚,那就一个一个数电子,用总核电荷数 ...

老师您好,电荷我是按照Zr周围36个电子,C-O键中的氧为周围9个电子,周围三个O-Zr键的O为10个电子计算的电荷,我建立的体系总核电荷数是710,算出来还是2个正电荷,请问老师是我化合价理解错了还是说其他的原因?

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发表于 Post on 2022-7-1 01:51:13 | 只看该作者 Only view this author
wyqms 发表于 2022-6-30 16:53
老师,您好,实在不好意思,还是需要您来解惑,我按照理解数了电荷,整体是2个正电荷,Delta-E在循环了45 ...

电荷还是数错了。如果用金属电荷数、配体电荷数加起来的方法数不清楚,那就一个一个数电子,用总核电荷数减去总电子数的方法计算。
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-30 23:53:40 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wyqms 于 2022-7-1 00:01 编辑
wzkchem5 发表于 2022-6-29 14:04
是标错了。不要盲目相信结构式里面画的价态,有的时候结构式只是一个示意图,并不是里面每一个字都是准确 ...

老师,您好,实在不好意思,还是需要您来解惑,我按照理解数了电荷,整体是2个正电荷,Delta-E在循环了45次后一直都维持在小数点后4位,目前第99次循环的Delta-E=  -0.000106736803,RMSDP=9.19D-06,始终无法逼近08,麻烦老师帮我看看是我结构设计有问题还是说本身就很难收敛,而且在尝试了sob老师解决SCF不收敛问题的方法 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)中的前4条方案发现每一步相比不加关键词的Delta-E,差别在小数点后9位。这已经困扰我十多天了,麻烦老师解惑了!

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