求助 [PV14O42]12-结构优化过程中出现了变形

果果123 · 发表于 Post on 2022-7-3 17:00:18

多金属氧酸盐：初始结构 [PV14O42]12- 计算细节：泛函B3LYP 基组：P O 6-31G（d,p） V LANL2DZ

优化后的结构 [PV14O42]13- 在红色方框里面出现了变形

应该怎样才能优化出不变形的结构呢（文献中表明得到电子之后键长会发生变化但是在0.1A左右）

果果123 · 发表于 Post on 2022-7-4 15:38:11

本帖最后由果果123 于 2022-7-4 16:08 编辑

原文的doi在这里：10.1021/acs.jpcc.0c04169
我使用的是隐式溶剂化模型他在分析结构变化的时候时使用的是显式溶剂化模型进行 QM/MM 动力学模拟计算细节为 PBE泛函，def2-TZVP基组，def2-ECP ，CPCM溶剂化模型

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-7-4 15:18:06

果果123 发表于 2022-7-4 08:05
好的我这就去试试

把计算的理论级别细节贴出来

果果123 · 发表于 Post on 2022-7-4 15:05:49

好的我这就去试试

chands · 发表于 Post on 2022-7-4 14:58:45

果果123 发表于 2022-7-4 14:55
我想着把图贴在最上面的问题里面字数限制只能这样发出来实在抱歉
我试过了可以把地址复制粘贴到 ...

我看不到，因为图片在你的硬盘里，不是在网上。直接选高级模式，然后上传附件。

果果123 · 发表于 Post on 2022-7-4 14:55:37

chands 发表于 2022-7-4 10:55
图都没帖出来捏。

我想着把图贴在最上面的问题里面字数限制只能这样发出来实在抱歉
我试过了可以把地址复制粘贴到网址栏就可以看到图片了

chands · 发表于 Post on 2022-7-4 10:55:09

果果123 发表于 2022-7-4 10:48
这个是计算文章当中其计算的化学键长在还原前后的变化变化的键长并没有十分大

图都没帖出来捏。

果果123 · 发表于 Post on 2022-7-4 10:48:10

wzkchem5 发表于 2022-7-4 00:40
文献的不变形的结果是怎么得到的，是计算的还是实验测的？有可能你这个结构本来就应该是变形的

file:///C:/Users/Administrator/Documents/Tencent%20Files/1464325689/FileRecv/MobileFile/Image/2LD0V%7BS7T%5D6N@LLI$BAG9BB.png
这个是计算文章当中其计算的化学键长在还原前后的变化变化的键长并没有十分大

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-7-4 00:40:39

果果123 发表于 2022-7-3 13:55
有加溶剂实验文献中有提到是 pH=2左右我把溶剂设成水也加了抗衡离子（质子）先试着加了四个但是出 ...

文献的不变形的结果是怎么得到的，是计算的还是实验测的？有可能你这个结构本来就应该是变形的

果果123 · 发表于 Post on 2022-7-3 20:55:27

wzkchem5 发表于 2022-7-3 20:29
计算加溶剂了吗？可能这个结构只有在存在溶剂或抗衡离子时才是你想的那样

有加溶剂实验文献中有提到是 pH=2左右我把溶剂设成水也加了抗衡离子（质子）先试着加了四个但是出现了比这个还夸张的严重变形我在思考是否需要加更多的质子或者质子是否会影响优化过程中的结构变化

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-7-3 20:29:58

计算加溶剂了吗？可能这个结构只有在存在溶剂或抗衡离子时才是你想的那样

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