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北科大,计算机化学,教学内容,请提意见

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本帖最后由 yjcmwgk 于 2016-4-22 08:26 编辑

北科大化生学院,试图搞个《计算机在化学中的应用》,任务交给我了。
这是一门面对大三的,化学化工类本科生,专选课。

我拟了个教学大纲,各位提提意见?
谢谢哦!

还有几个问题啊,设想,你就是大三的本科生。现在开始选择:

(1) 设想,你就是大三的本科生。站在这个角度上看问题,教学内容是否合适?
A 内容太多了
B 内容有点多啊
C 刚刚好
D 内容有些单薄啊
E 内容太单薄了,都不够我一周的量

(2) 作为一个大三的本科生,你觉得:
A 内容挺偏啊,大部分内容不是我感兴趣的
B 内容有点偏啊,部分内容不是我感兴趣的
C 我对这些内容都很感兴趣

(3) 作为一个大三的本科生,你觉得:
A 我有百分之百的概率选择这门课程
B 百分之七八十的概率选这门课吧
C 百分之五十左右吧,看情况
D 百分之二三十吧,毕竟太多数学和计算机内容了,我怕我上不成
E 除非没别的课可选了,我才会选这门课
F 打死我也不选这门课

(4) 假设有一个一百人的化学班儿,这个班儿里:
B 我觉得会有七八十人选这门课
B 我觉得会有五十人左右选这门课
C 别想了,顶多三十人选这门课
D 这门课根本开不出来,因为选课人数肯定会低于十人

Ø  开课院系:化学与生物工程学院。
Ø  课程类别:专业选修课。
Ø  适用专业:化学相关专业。
Ø  考核方式:考查。
Ø  课内总学时:32。
Ø  学分:2。
Ø  理论授课学时:16。
Ø  实验学时:0。
Ø  设计学时:0。
Ø  上机学时:16。
Ø  先修课程:高等数学、线性代数、概率论与数理统计、有机化学、无机化学、分析化学、物理化学、结构化学、大学计算机基础。

一、教学目的

随着计算机科学与技术的高速发展及其与化学、应用化学、化工等学科的不断交叉、渗透与整合, 现代计算机技术正在上述专业的科研、生产、教学中起到日益重要的作用。计算机在化学、应用化学、化工专业的应用已不仅局限于传统的办公、图形处理等范围。在化学品开发、反应机理研究、设备设计、过程控制、工艺优化、辅助教学等领域,计算化学和计算化学工程的重要作用日益凸显。对于化学、应用化学、化工专业的学生和科研人员,熟练应用计算机解决学习、科研、 工作中面临的各种问题己成为必备的基本技能。
本门课程以实际应用例子为对象,在叙述和分析中将文献检索与管理、实验设计与数据处理、化学化工图形与图像处理、化学化工相关计算等内容紧密结合,通过学习,使学生应用计算机解决化学、化工领域一些常见问题的能力在实践中得到培养和提高,并对化学化工类常用软件有较好的了解和掌握,是化学类各专业的专业选修课程。

二、教学基本要求

1.课程重点:

Ø  掌握化学数据处理方式。主要让学生化学计量学主要内容。
Ø  掌握二维和三维化学绘图技术和科学制表技术。
Ø  了解量子化学计算基本原理。
Ø  了解分子力学计算基本原理。
Ø  掌握用计算机解决化学问题的方法和技巧。

2.课程难点:

Ø  数理统计在本课程中的应用。
Ø  亲自动手编程解决化学问题。

3.能力培养要求:

Ø  通过本课程学习,使学生对计算机在化学化工中的应用有较深入的认识和掌握,对计算机化学中的科研发展前沿领域有所了解,培养计算机化学的方法论,独立分析问题、解决问题。

三、教学学时与内容

绪论课,占用1学时;相关数学知识和计算机知识的复习,占用6学时;化学计量学相关的课程,占用11学时;化学图文设计,占用2学时;量子化学和分子模拟计算相关课程,占用10学时;最后有考查,占用2学时。具体如下:

1. 绪论 (理论课1学时,上机课0学时

Ø  了解计算机化学的研究对象、研究方法。
Ø  了解相关科研前沿。
Ø  了解本学科与专业及生产的关系。
Ø  掌握学习方法和要求。

2. 相关数学知识准备与计算机知识准备(理论课4学时,上机课2学时)

Ø  常微分方程与偏微分方程。
Ø  迭代法解方程。
Ø  矩阵运算。
Ø  数学模型简介。
Ø  Fortran简介。
Ø  Matlab简介。
Ø  SPSS简介。

3. 化学实验数据的采集、分析与计算(理论课2学时,上机课2学时)

Ø  数理统计与统计分析在化学中的应用。
Ø  简单相关分析。
Ø  相关关系与函数关系。
Ø  复相关分析。
Ø  化学中的典型相关分析案例。
Ø  用计算机进行化学实验数据处理。

4. 回归分析及应用(理论课1.5学时,上机课2学时)

Ø  回归分析在化学中的应用。
Ø  一元线性回归分析。
Ø  多元线性回复分析。
Ø  可以化简成多元线性回归的问题。
Ø  相关分析与回归分析的区别。
Ø  用计算机实现化学实验数据的回归分析。

5. 主成分分析及其在回归分析中的应用(理论课1.5学时,上机课2学时)

Ø  主成分分析在化学中的应用。
Ø  主成分回归。
Ø  偏最小二乘回归。
Ø  用计算机实现化学实验数据的主成分分析。

6. 化学图文设计(理论课0学时,上机课2学时)

Ø  绘制平面分子式。
Ø  搭建立体分子模型。
Ø  科学制表。
Ø  从表格到图像。

7. 量子化学计算简介(理论课4学时,上机课4学时)

Ø  量子化学计算简介。
Ø  分子构型的优化和振动频率简介。
Ø  分子电子结构与电子跃迁分析简介。
Ø  波函数分析简介。
Ø  量子化学模拟反应历程简介。

8. 分子模拟计算简介(理论课1学时,上机课1学时)

Ø  分子模拟原理简介。
Ø  分子力场简介。
Ø  分子动力学简介。

9. 考察(2学时)

Ø  在教师监督下,独立完成一份课程论文(用纸笔完成)或课程设计(在计算机上完成)。

四、考核方式

本课程采用考查课的考核方式。
Ø  平时成绩:平时作业与课堂互动,占50%。
Ø  课程论文或课程设计:俗称“大作业”,要求独立完成,占50%。

五、参考书

Ø  倪力军、张立国编,《基础化学计量学及其应用》,华东理工大学出版社,2011年出版。
Ø  聂长明、廖立夫主编,《计算化学》,北京理工大学出版社,2010年出版。
Ø  刘江燕、武书彬编,《化学图文设计与分子模拟计算》,华南理工大学出版社,2009年出版。
Ø  丛培盛、朱仲良、许新华、曹同成、柴晓兰编,《计算机化学》,化学工业出版社,2014年出版。
Ø  叶卫平主编,《Origin9.1科技绘图及数据分析》,机械工业出版社,2015年出版。
Ø  范波涛、张瑞生编,《计算机化学与分子设计》,高等教育出版社,2009年出版。
Ø  张若愚编,《Python科学计算》,清华大学出版社,2012年出版。
Ø  白海波编,《Fortran程序设计权威指南》,机械工业出版社,2013年出版。
Ø  张志刚、刘丽梅、朱婧、王兵团编,《Matlab与数学实验》,中国铁道出版社,2005年出版。

一出生响亮登场,十几岁快乐成长,
二十岁天天向上,三十岁基本定向,
四十岁拼命打创,五十岁回首一望,
六十岁告老还乡,七十岁搓搓麻将,
八十岁躺在床上,九十岁挂在墙上,
人生一世,匆匆忙忙,生得嘹亮,走得凄凉!
生活就像五味瓶,酸甜苦辣难消停!
该吃吃,该喝喝,遇事别去心里搁,
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发表于 Post on 2016-6-21 20:09:37 | 只看该作者 Only view this author
太多了

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发表于 Post on 2016-5-9 20:28:49 | 只看该作者 Only view this author
内容太多,简单的介绍几个软件的使用即可,上理论一次课,至少连续2次课

重点要让学生掌握使用方法
努力学习,认真工作

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发表于 Post on 2016-5-9 17:43:52 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lonelycvavc 于 2016-5-9 17:46 编辑

作为一个大四的学生我揣摩一下一年前的我的意图。
整体来讲我对于这门课的所有内容都很感兴趣,可惜不是开在我的学校TAT。但是对于第二部分的内容, 常微分方程与偏微分方程。  迭代法解方程。矩阵运算。学过高数和线代都应该有一点了解了,短短一两个课时的时间也不太可能能讲得很细,反而可能在课程一开始的时候导致学生产生畏难情绪。不如直接从下一节(Ø  数学模型简介)开始?课程难点里有自己编程的内容,但授课部分只有 Fortran简介。应该也不足以做到教会学生编程,简单提一下推荐几本参考书应该就很好了。  Matlab简介和  SPSS简介 以及后面的3,4,5章是我觉得现在大学本科化学教学最缺乏的东西,我自己现在就因为缺乏这方面的知识非常困扰,这一定是非常精彩的部分。如果老师课件做出来了跪求一份……
最后的考察是随堂的吗?这样的形式学生不一定愿意接受。至少我身边的很多同学选课首先看课程名称,然后看授课老师,最后看的就是考核方式……甚至有的是倒过来的。也许改成课外两周时间完成会更好。

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发表于 Post on 2016-5-5 08:41:01 | 只看该作者 Only view this author

这水灌的

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发表于 Post on 2016-5-2 07:44:40 | 只看该作者 Only view this author
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发表于 Post on 2016-4-27 07:40:33 | 只看该作者 Only view this author
我的个人上课经验,上课内容面面俱到,效果往往面面难到。
建议以下内容移出,可以对专业需要较强的学生另外开课。
Ø  Fortran简介。
Ø  Matlab简介。
Ø  SPSS简介。
7. 量子化学计算简介(理论课4学时,上机课4学时)
8. 分子模拟计算简介(理论课1学时,上机课1学时)
大三学生学习了编程的基本知识,建议增加一门简单易学的编程语言,用编程来解决前期课程中一些问题。这对学生分析问题、解决问题及数理逻辑思维的训练是非常重要的,不是学习一些内容简介所能比拟。

一家之言,不当之处,请海涵。

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发表于 Post on 2016-4-26 14:16:14 | 只看该作者 Only view this author
yjcmwgk 发表于 2016-4-25 15:43
非常感谢你的意见!
这么说吧,这个课,在我的预想中,就是 化学计量学初步 + 计算化学初步。
文献检索 ...

额~
舰娘是啥?
请指教!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-4-25 15:43:20 | 只看该作者 Only view this author
nunup5 发表于 2016-4-25 10:01
上过类似课的出来冒泡!
楼主应该知道的吧,本科生上选修课的首要目的是为了拿学分,其次是课程有意思,老 ...

非常感谢你的意见!
这么说吧,这个课,在我的预想中,就是 化学计量学初步 + 计算化学初步。
文献检索课在北科大本科有啦
你提的“看图”的概念特别好 特别感谢
又及:也玩舰娘?
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发表于 Post on 2016-4-25 10:01:53 | 只看该作者 Only view this author
上过类似课的出来冒泡!
楼主应该知道的吧,本科生上选修课的首要目的是为了拿学分,其次是课程有意思,老师有魅力,最次是能学到点东西。
大三的学生是一群没什么基础,只上过化学基础课的萌新们。
我当时上这个课时,课程大概是由两部分组成,一是chemdraw,chem3D, Origin等制图数据处理软件使用,二是文献检索。作为选修课来讲,课程轻松有趣而且挺受用!
楼主的课程大纲,我觉得软件介绍和实际操作设计的很好,就是理论部分太高深,据我了解,大三的本科生大部分觉得物化和结构已经是他们最难的科目了,你再搞个量子化学,估计他们要疯了,哈哈哈。但是如果从一些量化软件入手,能够从图形化的角度揭示物化和结构化学中的一些内容,估计学生们会爱死你,然后再深入讲解,学生们有了兴趣,你想怎样就怎样咯!
文献检索还是很有必要讲的,不要认为他们都会,这个技能在本科毕业和研究生初期及其重要!我原来就以为所有人都会,结果上了研究生,我小导还严肃兮兮的召集了一票研究生新生来讲文献检索,那个时候我才知道,原来不是所有人都会的!
分子模拟初步可以讲一下,讲讲DS,学生们就会觉得高大上!
其实本科生的选修课,大部分的作用是为了让学生见识一下各个领域具体研究的是啥,老师长啥样,然后好方便他们以后的就业选择和考研选择,小卒大人你这么腻害,把学生们的兴趣都激发起来,他们就颠颠的去找你了!

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发表于 Post on 2016-4-24 20:03:46 | 只看该作者 Only view this author
内容是有点多啊
不过既然是跟生物有点关系,那么介绍pdb数据库应该是少不了的

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发表于 Post on 2016-4-24 13:44:47 | 只看该作者 Only view this author
楼主可以招研究生吗
通过忠实地映射宇宙来隐藏自我,是融入永恒的唯一途径。

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发表于 Post on 2016-4-24 12:34:22 | 只看该作者 Only view this author
Excel,Origin和Chemdraw必须掌握,基本上做毕业论文都会用到,不是特别难,而且和具体的课题方向没太大关系,而是化学系学生普遍需要的基本软件技能。
至于理论化学的软件,则不是每位化学系学生都必须掌握。
以及有些软件需要较好数学功底,会增大学生负担,除非将来很可能用到,否则最好不要作为本课程主要内容。

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yjcmwgk + 5 谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-4-24 11:51:50 | 只看该作者 Only view this author
北纬18° 发表于 2016-4-24 01:21
两年?………
两个月还差不多。

我突然明白你说的是什么了!我先前理解错了。
你说的是:有个人告诉你要做什么性质的模拟(紫外?红外?核磁?荧光?……等等),告诉你要用什么方法和基组,告诉你应该怎么去计算,然后呢,你只管计算的操作,至于计算结果是不是合理的也不用你去管,是这样吗?
如果这样,8学时就够了。我在北科大就教这个,这是一个研究生课的一小部分内容,就8学时,讲述4学时上机4学时,让你在最短时间内学会Gaussian/gaussview的基本操作。
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发表于 Post on 2016-4-24 01:21:02 | 只看该作者 Only view this author
yjcmwgk 发表于 2016-4-23 21:12
切!跟我混两年,自己独立做计算,重复那些东西应该没啥太大问题吧。指望32学时的课?

两年?………
两个月还差不多。

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