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[辅助/分析程序] mess计算分子内氢转移疑问

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楼主
本帖最后由 lm1997 于 2022-7-18 09:38 编辑

各位老师好我在使用mess计算速率常数时候,在计算双分子的时候按照手册进行没遇到什么问题,但是我再计算分子内氢转移的时候遇到了问题。mess能计算分子内氢转移吗?我在手册“The master equation calculations proceed by first constructing the global relaxation matrix that describes both chemical transformations (bimolecular-to-complex reactions and internal isomerizations) and collisional energy relaxation, then finding the eigenstates of the relaxation matrix, and finally extracting from those the full set of phenomenological chemical rate coefficients.”了解mess应该是可以计算异构化的,我再此问一下各位老师mess 能计算氢转移吗?还是说并不能计算。只是我的理解问题.如果可以我应该该哪个部分的关键字呢?希望各位老师点拨一下。谢谢。我的输入文件如下

m2.inp

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-9 15:48:38 | 只看该作者 Only view this author
Elatesan 发表于 2022-10-7 20:31
分子内H转移反应应该是反应物跟产物都是单分子吧,用不到双分子的关键词,直接用well关键词应该就可以。这 ...

十分感谢 问题我已经解决了

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发表于 Post on 2022-10-7 20:31:29 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Elatesan 于 2022-10-7 20:36 编辑

分子内H转移反应应该是反应物跟产物都是单分子吧,用不到双分子的关键词,直接用well关键词应该就可以。这类反应应该能扫出来过渡态,参照安装包内的输入例子自己更改对应文件内的参数即可。安装包可以直接去github下载,我发的帖子里有地址的。随回复贴上要用的计算文件example

mess.inp

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-18 09:41:35 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-7-17 22:37
具体遇到了什么问题?
肯定得把你遇到的问题描述清楚,别人才能回答

抱歉老师可能我描述有点模糊,mess能计算分子内氢转移吗,如果可以双分子(Bimolecular)的关键词应该改成什么呢?恕我愚钝,我看手册暂时没有发现

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发表于 Post on 2022-7-17 22:37:36 | 只看该作者 Only view this author
具体遇到了什么问题?
肯定得把你遇到的问题描述清楚,别人才能回答
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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