求助vasp计算的时候怎样设置让过程不在终端输出

Jalyn

请问可不可不把vasp计算时候的一些输出在终端上的东西放在一个文件里   后台运行的那种  要不然vasp一开始计算  就没法做别的事情了

阿司匹林泡腾片

Jalyn 发表于 2022-7-26 20:51
输出的结果也是ignoring input and appending output to ‘nohup.out’

这个时候敲一下回车就行，之后top一下看看任务有没有在算

Jalyn

abin 发表于 2022-7-26 21:24
如文字所述.
详细解释, 查阅slurm手册.
或者你们自己的使用手册.

好的谢谢

abin

Jalyn 发表于 2022-7-26 20:43
那请问使用scontrol show job之后说的是找到我提交的任务  是这样显示的  这是什么意思呢

如文字所述.
详细解释, 查阅slurm手册.
或者你们自己的使用手册.

Jalyn

阿司匹林泡腾片 发表于 2022-7-26 20:37
试试这个：nohup mpirun -np 核数 vasp_std&

输出的结果也是ignoring input and appending output to ‘nohup.out’

Jalyn

abin 发表于 2022-7-26 20:31
PD状态，是没有跑……
在处于某种等待状态。
具体使用

那请问使用scontrol show job之后说的是找到我提交的任务  是这样显示的  这是什么意思呢

阿司匹林泡腾片

试试这个：nohup mpirun -np 核数 vasp_std&

abin

PD状态，是没有跑……
在处于某种等待状态。
具体使用
scontrol show job就可以查询到。

另，所有的集群，都是高度定制的。

使用之前，为何不看使用手册？

如果没有使用手册？这玩意能通过验收？

Jalyn

含光君 发表于 2022-7-26 19:22
啊我这里不用slurm，你可以Google自学一下。
图一输出没有问题，后台已经在跑了，ctrl+C就可以接着干别 ...

好的好的感谢谢

含光君

Jalyn 发表于 2022-7-26 17:55
请教一下根据学校队列系统的版本写脚本的话具体操作方法是什么呀  我自己模仿的另一个脚本编写如图二这个 ...

啊我这里不用slurm，你可以Google自学一下。
图一输出没有问题，后台已经在跑了，ctrl+C就可以接着干别的了

Jalyn

含光君 发表于 2022-7-26 17:45
那就在你原来用的命令前加 nohup 后加 & 试试看呢

请教一下根据学校队列系统的版本写脚本的话具体操作方法是什么呀  我自己模仿的另一个脚本编写如图二这个是对的吗  虽然能提交上去但是 查看任务进度的时候  运行时间却一直都没有变化 这是什么原因呢 图是job脚本的内容和提交的命令


然后我在最开始没有脚本的命令前加nohup且后面加&输出的结果如图一

含光君

Jalyn 发表于 2022-7-26 17:36
我两个都试了几次  但错误好像一致

那就在你原来用的命令前加 nohup 后加 & 试试看呢

Jalyn

含光君 发表于 2022-7-26 17:30
你把我和3楼的回答看混了吧..

我两个都试了几次  但错误好像一致

含光君

Jalyn 发表于 2022-7-26 15:17
[xufeng2@swarm02 co2c]$ nohup vasp.sh &
[3] 3265683
[2]   Exit 139                mpirun -np 56  ...

你把我和3楼的回答看混了吧..

Jalyn

初夏浅草 发表于 2022-7-26 17:07
如果是学校的集群（集群用的slurm系统），建议你问一下管理员提交任务，感觉你这个不太对。而且你之前说 ...

我之前是没有建立脚本  直接在要计算的文件下输入vasp  就计算了