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[综合交流] 请教关于酶的活化能活化自由能

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本帖最后由 azero 于 2022-8-10 10:58 编辑

为什么突变后会降低△G,应该只会改变Ea才对,酶只是改变可反应路径啊(表中是酶的水解反应)
但从公式上看,Kcat改变了,△G是会改变
很不解,求解答

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发表于 Post on 2022-8-10 15:00:34 | 只看该作者 Only view this author
图2画错了,同一张图要么是活化能和能变,要么是活化自由能和自由能变,不可能纵坐标标的是Energy、图上却画出deltaG,更不可能Ea(rev)-Ea这两个能量能减出一个自由能。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-10 10:58:28 | 只看该作者 Only view this author
sylar 发表于 2022-8-10 10:51
表格Ea在图二没有表示,实际上对应的应该是是图二Ea中电子能的部分,表格的Ea对应图三的Ea
个人理解

嗯嗯,这样子,我再翻翻文献,简直把我搞炸了。谢谢你~

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发表于 Post on 2022-8-10 10:51:56 | 只看该作者 Only view this author
azero 发表于 2022-8-10 10:49
哦哦,那表格的Ea该对应的是图二哪个

表格Ea在图二没有表示,实际上对应的应该是是图二Ea中电子能的部分,表格的Ea对应图三的Ea
个人理解

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-10 10:49:14 | 只看该作者 Only view this author
sylar 发表于 2022-8-10 10:47
我的理解是,△G≠对应图二的Ea,图三的△Ga

哦哦,那表格的Ea该对应的是图二哪个

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发表于 Post on 2022-8-10 10:47:18 | 只看该作者 Only view this author
azero 发表于 2022-8-10 10:35
能不能解释一下公式中的△G≠和Ea表示的图二的哪个

我的理解是,△G≠对应图二的Ea,图三的△Ga

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-10 10:45:25 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-8-10 10:35
Ea在文献中似乎有点混,其实原理上把Ea中的E理解成自由能、焓、内能都没问题。活化能和能垒/势垒严格上也 ...

唉,查了很多文献,公式是一样的,但是Ea和△G≠的说明是不一样的,快炸了。我只是想知道Ea和△G≠指的是图二曲线中的哪一段

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发表于 Post on 2022-8-10 10:35:59 | 只看该作者 Only view this author
azero 发表于 2022-8-10 10:29
其实上面表格是别人发的SCI,公式是他的博士论文
我是搞不清Ea和△G≠ 有什么区别,指的都是啥

Ea在文献中似乎有点混,其实原理上把Ea中的E理解成自由能、焓、内能都没问题。活化能和能垒/势垒严格上也不一样,但有些文章也混了。
谈谈如何通过势垒判断反应是否容易发生 http://sobereva.com/506
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-10 10:35:00 | 只看该作者 Only view this author
sylar 发表于 2022-8-10 10:26
公式中的△Ga是不是指的自由能垒对应表的△G≠,图中是△G,所以两个不一样
图二是哪本书吗? ...

能不能解释一下公式中的△G≠和Ea表示的图二的哪个

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-10 10:31:37 | 只看该作者 Only view this author
sylar 发表于 2022-8-10 10:26
公式中的△Ga是不是指的自由能垒,图中是△G,所以两个不一样
图二是哪本书吗?想找来看看

谷歌搜的一个PDF,Foundation of chemistry

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-10 10:29:29 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-8-10 10:24
ΔG≠应该是活化自由能(看文献原文),你用了催化剂,反应路径变了,活化自由能肯定变。

其实上面表格是别人发的SCI,公式是他的博士论文
我是搞不清Ea和△G≠ 有什么区别,指的都是啥

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发表于 Post on 2022-8-10 10:26:18 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 sylar 于 2022-8-10 10:32 编辑

公式中的△Ga是不是指的自由能垒对应表的△G≠,图中是△G,所以两个不一样
图二是哪本书吗?想找来看看

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发表于 Post on 2022-8-10 10:24:21 | 只看该作者 Only view this author
azero 发表于 2022-8-10 10:22
指的是表中的ΔG≠

ΔG≠应该是活化自由能(看文献原文),你用了催化剂,反应路径变了,活化自由能肯定变。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-10 10:22:32 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-8-10 10:20
你说的“降低ΔG”是表中哪一项ΔG?通常ΔG≠的上标≠是指过渡态或者活化能(焓、熵)

指的是表中的ΔG≠

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发表于 Post on 2022-8-10 10:20:15 | 只看该作者 Only view this author
你说的“降低ΔG”是表中哪一项ΔG?通常ΔG≠的上标≠是指过渡态或者活化能(焓、熵)
ORCA大法好!CP2K大法好!
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山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
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