计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 3632|回复 Reply: 9
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[VMD] 求助:如何在VMD里改变特定原子的大小

[复制链接 Copy URL]

48

帖子

0

威望

662

eV
积分
710

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
如题,想在VMD中改变特定原子的大小,但是不知道该怎么改

1

帖子

0

威望

37

eV
积分
38

Level 2 能力者

10#
发表于 Post on 2024-6-1 17:44:30 | 只看该作者 Only view this author
xiuyan 发表于 2022-10-17 15:54
老师,我看到了2楼和3楼的回答,但我用2楼的方法遇到了困难,因为我想改原子大小和原子颜色。发现用2楼的方 ...

您好,我想请问下用3楼方法改变了原子半径,原子颜色如何改变呢

11

帖子

0

威望

55

eV
积分
66

Level 2 能力者

9#
发表于 Post on 2022-10-17 15:54:37 | 只看该作者 Only view this author
老师,我看到了2楼和3楼的回答,但我用2楼的方法遇到了困难,因为我想改原子大小和原子颜色。发现用2楼的方法改了原子大小后改不了原子的颜色。用3楼的方法完美的解决了问题。

1061

帖子

0

威望

3271

eV
积分
4332

Level 6 (一方通行)

8#
发表于 Post on 2022-10-17 15:39:40 | 只看该作者 Only view this author
xiuyan 发表于 2022-10-17 14:16
您好,请问您会在VDM里改变特定原子的大小了的嘛?

这孩子真是懒到家了……

点开链接往下翻,2楼,3楼的回答就是啊。

评分 Rate

参与人数
Participants 2
eV +3 收起 理由
Reason
七尺贱 + 1 233333
lyj714 + 2 233333,喂到嘴里都不知道吃

查看全部评分 View all ratings

11

帖子

0

威望

55

eV
积分
66

Level 2 能力者

7#
发表于 Post on 2022-10-17 14:16:06 | 只看该作者 Only view this author
您好,请问您会在VDM里改变特定原子的大小了的嘛?

312

帖子

2

威望

2306

eV
积分
2658

Level 5 (御坂)

6#
发表于 Post on 2022-8-31 10:04:01 | 只看该作者 Only view this author
如果只是为了作图,我习惯将特定原子替换成别的原子,比如C换成N,然后直接改N的颜色

48

帖子

0

威望

662

eV
积分
710

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-31 08:36:46 | 只看该作者 Only view this author
Frozen-Penguin 发表于 2022-8-30 17:24
新建一个rep并选中原子,drawing method选CPK,然后调整sphere scale

谢谢,帮大忙了

48

帖子

0

威望

662

eV
积分
710

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-31 08:36:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-8-30 18:34
还有一种不用建立新的rep的做法是直接修改原子的半径属性,文本窗口输入
[atomselect top "serial 原子序 ...

好的好的,谢谢sob老师

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112486

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2022-8-30 18:34:55 | 只看该作者 Only view this author
还有一种不用建立新的rep的做法是直接修改原子的半径属性,文本窗口输入
[atomselect top "serial 原子序号"] set radius 半径值
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

309

帖子

0

威望

1461

eV
积分
1770

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2022-8-30 17:24:52 | 只看该作者 Only view this author
新建一个rep并选中原子,drawing method选CPK,然后调整sphere scale

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-26 19:33 , Processed in 0.571188 second(s), 29 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list