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[新手求助] 求助片段组合波函数、自旋多重度的设置

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楼主
我想采用片段组合波函数计算金属配合物(二价体系,自旋多重度为6)过渡态产生自由基片段,输入文件第一部分设置0,2 a,第二部分设置2,5,a,输出文件总是第一部分0 2 a  第二部分总是0 1 a,请问怎么解决这个问题呢?片段组合波函数可以计算多重度的带电体系吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-16 21:53:44 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2022-9-15 12:35
这里面问题很多,有比“log文件查看是2 4 0 2 0 1”这种次要问题 重要的多得多的问题:

(1)关键词那 ...

谢谢老师的指导

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发表于 Post on 2022-9-15 12:35:19 | 只看该作者 Only view this author
ZH123456 发表于 2022-9-15 10:15
拿GaussView设置的atom group 然后保存gjf文件提交在linux系统计算的,a指Alpha电子,我看这个文章写的是 ...

这里面问题很多,有比“log文件查看是2 4 0 2 0 1”这种次要问题 重要的多得多的问题:

(1)关键词那行没写guess(fragment=片段数目),底下无论怎么写都没用,都不是片段组合波函数,再次强烈建议反复、仔细阅读《谈谈片段组合波函数与自旋极化单重态》http://sobereva.com/82

(2)一般来讲不建议使用scf=qc,除非你很清楚自己在干什么。如果你是想防止scf不收敛,scf=qc是优先级十分靠后的一种手段,绝不应该作为首选。

(3)过渡金属用B3LYP不是明智的行为,强烈建议阅读《简谈量子化学计算中DFT泛函的选择》http://sobereva.com/272

(4)复杂体系应先正确计算单点、检验波函数稳定性,然后再读取轨道进行结构优化。强烈建议阅读这个帖子11L的回复http://bbs.keinsci.com/thread-31621-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-15 10:15:26 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 ZH123456 于 2022-9-19 09:18 编辑
sobereva 发表于 2022-9-15 05:14
总要把问题交代清楚,最起码让别人知道拿什么程序算的。说不清楚就上传输入文件

a指什么说清楚

拿GaussView设置的atom group 然后保存gjf文件提交在linux系统计算的,a指Alpha电子,我看这个文章写的是中性体系自旋多重度1的,我要算的是2+体系自旋多重度为4,分层设置然后计算过渡态产生自由基片段,所以我不知道可以算不,这方面的介绍很少,下面是我输入文件,log文件查看是2 4 0 2 0 1, 感谢您的解答,新手这方面有很多不懂得
#p opt=(calcfc,ts,noeigentest,gdiis,maxcycle=300) freq ub3lyp/6-31+g(d,p)
scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm scf=qc int=ultrafine

TS-1-3

2 4 0 2 2 3
H(Fragment=1)     000
H(Fragment=1)     000
S(Fragment=2)    000
O(Fragment=2)    000
O(Fragment=2)     000
F(Fragment=1)    000
F(Fragment=1)    000
F(Fragment=1)   000
F(Fragment=1)    000
O(Fragment=2)   000
Fe(Fragment=2)  000
F(Fragment=1)   000

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-15 09:50:36 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2022-9-15 00:33
我猜你是用GaussView划分片段,然后保存gjf再打开发现不是你想要的片段划分方式。GaussView划分片段是一种 ...

谢谢您,我的体系是2+,自旋多重度为6,我要设计一部分生成自由基,用gaussview设置好片段(0 2 a 和 2 3 a),提交Linux系统计算完成后查看log文件,用GaussView打开查看了atom groups 发现不是我当时设计的电荷和自旋多重度,变成了0 2 a 和 0 1 a,怎么计算这个体系肯定不会变成0价,不知道应该加什么关键词解决这个问题,这方面的介绍也很少

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发表于 Post on 2022-9-15 05:14:07 | 只看该作者 Only view this author
总要把问题交代清楚,最起码让别人知道拿什么程序算的。说不清楚就上传输入文件

a指什么说清楚

“片段组合波函数可以计算多重度的带电体系吗?”明显是病句

把此文看了
谈谈片段组合波函数与自旋极化单重态
http://sobereva.com/82
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-9-15 00:33:52 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2022-9-15 00:37 编辑

我猜你是用GaussView划分片段,然后保存gjf再打开发现不是你想要的片段划分方式。GaussView划分片段是一种辅助手段,但不是必须手段,如果你觉得你的划分是合理的,直接使用文本编辑器(如Sublime Text3, UltraEdit)打开gjf文件编辑片段电荷和自旋多重度即可。例如这个帖子里11L我的回复,[Fe(H2O)6]^(3+)片段组合波函数输入文件我就是手动添加片段信息的。
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