castep输出文件.geom格式转换的问题

lpz · 发表于 Post on 2022-10-11 17:01:04

Linux系统下运行castep结构优化文件为.geom格式，看到论坛中有人推荐的网站里面有格式转换perl脚本，可以将其转换为.xyz格式，下载脚本运行后一直没有反应，请问是什么原因呢？脚本已经上传至附件。

lpz · 发表于 Post on 2023-12-21 14:05:22

lwang2016 发表于 2023-12-21 08:44
这还是第一次听说。

请问加上这条参数之后，会把几何优化最后的那个结构输出为cif是么

对，最后会多输出一个cif文件

lwang2016 · 发表于 Post on 2023-12-21 08:44:12

lpz 发表于 2023-12-21 02:38
可以，但不用这么麻烦了，在param文件加一行write_cif_structure : true就可以输出cif文件了

这还是第一次听说。

请问加上这条参数之后，会把几何优化最后的那个结构输出为cif是么

lpz · 发表于 Post on 2023-12-21 02:38:08

lwang2016 发表于 2023-7-9 09:29
您好，请问使用perl脚本将geom文件能够转化成cif文件么？

可以，但不用这么麻烦了，在param文件加一行write_cif_structure : true就可以输出cif文件了

lwang2016 · 发表于 Post on 2023-7-9 09:29:11

您好，请问使用perl脚本将geom文件能够转化成cif文件么？

lpz · 发表于 Post on 2022-10-11 22:22:46

乐平发表于 2022-10-11 17:50
你在 Linux 系统下用 vi 打开看看脚本就能看到原因……

这个脚本默认打开的是 D 盘 Users/Administrato ...

这是我的输入文件，您能帮忙看下是哪里的问题吗？

lpz · 发表于 Post on 2022-10-11 20:01:12

乐平发表于 2022-10-11 17:50
你在 Linux 系统下用 vi 打开看看脚本就能看到原因……

这个脚本默认打开的是 D 盘 Users/Administrato ...

谢谢您的回复，代码中路径就是我的文件路径，如果不是的话会报错"file '' not found"，我用过Linux运行过，没有反应。然后我下载了strawberry perl，在win下运行，也没有反应。我只是修改了输入文件的路径，其他的没有动，不知道后面是否需要改变一下呢？

乐平 · 发表于 Post on 2022-10-11 17:50:42

本帖最后由乐平于 2022-10-11 17:52 编辑

你在 Linux 系统下用 vi 打开看看脚本就能看到原因……

这个脚本默认打开的是 D 盘 Users/Administrator/Desktop 目录下的 Ni.geom 文件…… 显然你需要指定你的路径，你的文件啊

open(GEOM, "D:/Users/Administrator/Desktop/Ni.geom") || die ("File '$filename' not found!\n");

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[CASTEP/Dmol3/MS] castep输出文件.geom格式转换的问题