“第10届量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班将于5月4-8日于北京举办,这是一次性完整、系统学习波函数分析的各种理论知识和全面掌握强大的Multiwfn波函数分析程序使用的最不可错过的机会!请点击此链接查看详情和报名方式,欢迎参加!

“第18届北京科音分子动力学与GROMACS培训班” 将于5月23-26日于北京举办。这是一次性全面、系统学习分子动力学模拟知识和最流行的分子动力学程序GROMACS的关键机会!报名正在进行中,请点击此链接查看详情,欢迎参加!

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 62640|回复 Reply: 37
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 出现Error termination in NtrErr: NtrErr Called from FileIO.错误

[复制链接 Copy URL]

25

帖子

0

威望

1509

eV
积分
1534

Level 5 (御坂)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
#


在做scan的时候算到18步就一直出现Error termination in NtrErr:NtrErr Called from FileIO. 错误,提取结构再算也不行,在网上查了,说可能是磁盘空间不足,然后把scratch里边的东西删掉了也不行,出错的部分如下:
Rotational constants (GHZ):      0.2228569      0.1970274      0.1272952
Standard basis: 6-31+G(d) (6D, 7F)
There are   494 symmetry adapted cartesian basis functions of A   symmetry.
There are   494 symmetry adapted basis functions of A   symmetry.
   494 basis functions,   844 primitive gaussians,   494 cartesian basis functions
    85 alpha electrons       85 beta electrons
       nuclear repulsion energy      1897.0962147266 Hartrees.
NAtoms=   43 NActive=   43 NUniq=   43 SFac= 1.00D+00 NAtFMM=   60 NAOKFM=F Big=F
Integral buffers will be    131072 words long.
Raffenetti 2 integral format.
Two-electron integral symmetry is turned on.
One-electron integrals computed using PRISM.
NBasis=   494 RedAO= T EigKep=  1.13D-06  NBF=   494
NBsUse=   493 1.00D-06 EigRej=  9.15D-08 NBFU=   493
Lowest energy guess from the checkpoint file:  "rawC-scan-1.chk"
B after Tr=     0.000000    0.000000    0.000000
         Rot=    0.998896    0.008834    0.003058   -0.046031 Ang=   5.38 deg.
B after Tr=     0.000000    0.000000    0.000000
         Rot=    0.951332   -0.053592   -0.031752    0.301806 Ang= -35.90 deg.
Operation on file out of range.
FileIO: IOper= 1 IFilNo(1)=  -526 Len=      243542 IPos=           0 Q=   46912509846856




dumping /fiocom/, unit = 1 NFiles =    83 SizExt =    524288 WInBlk =       512
                   defal = T LstWrd =    27250176 FType=2 FMxFil=10000


Number              0             0             0             0             0             0
Base         12418969      12426240      10589696      10218496      12293632      10341376
End          12419072      12541440      10706944      10219008      12296704      10345472
End1         12419072      12541440      10706944      10219008      12296704      10345472
Wr Pntr      12418969      12424963      10589184      10218496      12293632      10341376
Rd Pntr      12418969      12424963      10589184      10218496      12293632      10341376
Length            103        115200        117248           512          3072          4096


Number              0             0             0             0             0             0
Base          8604160        182784       9827840      12420096      13402112      23677706
End           8605184        183808       9828352      12425216      23429584      27250176
End1          8605184        183808       9828352      12425216      23429584      27250176
Wr Pntr       8604160        182784       9827840      12422144      13645654      23677706
Rd Pntr       8604160        182784       9827840      12422144      13444102      23677706
Length           1024          1024           512          5120      10027472       3572470


Number            501           502           503           505           508           511
Base            43520       8588288        180224        335872       8605184        282624
End             44520       8593134        180612        456872       8605214        308051
End1            44544       8593408        180736        457216       8605696        308224
Wr Pntr         43520       8588288        180224        335872       8605184        282624
Rd Pntr         43520       8588288        180224        335872       8605184        282624
Length           1000          4846           388        121000            30         25427


Number            514           515           516           517           518           520
Base          9462272       8972800       8605696      10195968       9828864       8603648
End           9584537       9461860       8972491      10217210      10195659       8603658
End1          9584640       9462272       8972800      10217472      10195968       8604160
Wr Pntr       9462272       8972800       8605696      10195968       9828864       8603648
Rd Pntr       9584537       8972800       8605696      10195968       9828864       8603648
Length         122265        489060        366795         21242        366795            10


Number            521           522           523           524           526           528
Base          8584192      12425216      10217472      10345984       9584640      10706944
End           8584227      12425709      10218458      10589526       9827688      10829209
End1          8584704      12425728      10218496      10589696       9827840      10829312
Wr Pntr       8584192      12425708      10217472      10589526       9584640      10706944
Rd Pntr       8584192      12425216      10217472      10589526       9584640      10706944
Length             35           493           986        243542        243048        122265


Number            530           532           534           536           538           550
Base         10219008      10829312      11195392      11317760      11440128        308224
End          10341273      10951577      11317657      11440025      11562393        335451
End1         10341376      10951680      11317760      11440128      11562496        335872
Wr Pntr      10219008      10829312      11195392      11440025      11562393        308224
Rd Pntr      10219008      10829312      11195392      11317760      11440128        308224
Length         122265        122265        122265        122265        122265         27227


Number            551           552           559           561           562           563
Base          8582144       8581120         74752       8582656       8574464      10345472
End           8582182       8581156         74754       8582657       8580985      10345966
End1          8582656       8581632         75264       8583168       8581120      10345984
Wr Pntr       8582144       8581120         74752       8582656       8574464      10345472
Rd Pntr       8582182       8581120         74752       8582656       8580985      10345472
Length             38            36             2             1          6521           494


Number            565           571           575           577           579           580
Base            76288      12296704        185344         75776       8581632         72192
End             76446      12418969        282425         75828       8581675         73180
End1            76800      12418969        282624         76288       8582144         73216
Wr Pntr         76288      12296704        185344         75776       8581632         72192
Rd Pntr         76288      12296704        185344         75828       8581632         72192
Length            158        122265         97081            52            43           988


Number            581           582           583           584           598           603
Base            73216       8593408         75264       8594944         76800      12419072
End             74276       8594890         75308       8595202         76802      12419073
End1            74752       8594944         75776       8595456         77312      12419584
Wr Pntr         73216       8593408         75264       8594944         76800      12419072
Rd Pntr         73216       8593408         75264       8594944         76800      12419072
Length           1060          1482            44           258             2             1


Number            605           606           619           634           665           670
Base         12419584      12425728       8595456      23429584        180736       8584704
End          12419585      12426221       8601701      23677706        182756       8587930
End1         12420096      12426240       8602112      23677706        182784       8588288
Wr Pntr      12419584      12426221       8595456      23429584        180736       8584704
Rd Pntr      12419584      12425728       8595456      23429584        180736       8587930
Length              1           493          6245        248122          2020          3226


Number            672           674           685           695           698           701
Base            41984        183808      10951680       8602112       8583680        457216
End             42347        184227      11195222       8603473       8583938       8574025
End1            42496        184320      11195392       8603648       8584192       8574464
Wr Pntr         41984        183808      10951680       8602112       8583680        457216
Rd Pntr         41984        183808      11195222       8602112       8583680        457216
Length            363           419        243542          1361           258       8116809


Number            729           742           761           783           989           991
Base         11562496       9828352       8583168      12541440         44544         65536
End          12293122       9828384       8583169      12670816         64544         72098
End1         12293632       9828864       8583680      12670976         65024         72192
Wr Pntr      11562496       9828352       8583168      12541440         44544         65536
Rd Pntr      11562496       9828352       8583168      12541440         44544         72098
Length         730626            32             1        129376         20000          6562


Number            992           993           994           995           996           997
Base            65024         43008         40448         42496         41472        184320
End             65033         43208         40478         42516         41672        185168
End1            65536         43520         40960         43008         41984        185344
Wr Pntr         65024         43008         40448         42496         41472        184320
Rd Pntr         65033         43208         40478         42516         41672        185168
Length              9           200            30            20           200           848


Number            998           999          2551          2556          9999
Base            40960         77312      12670976      12914688      13158400
End             41160        179816      12914518      13158230      13401942
End1            41472        180224      12914688      13158400      13402112
Wr Pntr         40960         77312      12914518      13158230      13401942
Rd Pntr         41160         79816      12914518      13158230      13401942
Length            200        102504        243542        243542        243542




dumping /fiocom/, unit = 2 NFiles =    52 SizExt =         0 WInBlk =       512
                   defal = F LstWrd =    10321920 FType=2 FMxFil=10000


Number              0             0             0             0           501           502
Base           289786       1304868       1312101      10321822        534812        535812
End            290282       1305856       1434411      10321920        535812        540658
End1           290282       1305856       1434411      10321920        535812        540658
Wr Pntr        289786       1304868       1312101      10321822        534812        535812
Rd Pntr        289786       1304868       1312101      10321822        534812        535812
Length            496           988        122310            98          1000          4846


Number            503           505           508           511           520           521
Base          1435193        600572         40448        543884        721572        818737
End           1435581        721572         40478        569311        721582        818772
End1          1435581        721572         40478        569311        721582        818772
Wr Pntr       1435193        600572         40448        543884        721572        818737
Rd Pntr       1435193        600572         40448        543884        721572        818737
Length            388        121000            30         25427            10            35


Number            522           524           526           528           530           532
Base            40678        818772       1061820       9553679       9675944       9798209
End             41662       1061820       1304868       9675944       9798209       9920474
End1            41662       1061820       1304868       9675944       9798209       9920474
Wr Pntr         40678        818772       1061820       9553679       9675944       9798209
Rd Pntr         41662        818772       1061820       9553679       9675944       9798209
Length            984        243048        243048        122265        122265        122265


Number            534           536           538           550           551           552
Base          9920474        290282        412547      10042739        721618        721582
End          10042739        412547        534812      10069966        721656        721618
End1         10042739        412547        534812      10069966        721656        721618
Wr Pntr       9920474        290282        412547      10042739        721618        721582
Rd Pntr       9920474        412547        534812      10042739        721618        721582
Length         122265        122265        122265         27227            38            36


Number            561           562           563           565           575           577
Base           593998        593999      10069966      10070460        721656        600520
End            593999        600520      10070460      10070618        818737        600572
End1           593999        600520      10070460      10070618        818737        600572
Wr Pntr        593998        593999      10069966      10070460        721656        600520
Rd Pntr        593998        593999      10069966      10070460        721656        600520
Length              1          6521           494           158         97081            52


Number            579           580           581           582           583           584
Base          9552648       9552691      10070618      10071678      10073160        571331
End           9552691       9553679      10071678      10073160      10073204        571589
End1          9552691       9553679      10071678      10073160      10073204        571589
Wr Pntr       9552648       9552691      10070618      10071678      10073160        571331
Rd Pntr       9552648       9552691      10070618      10071678      10073160        571331
Length             43           988          1060          1482            44           258


Number            603           605           619           634           665           670
Base           289785        289784       1305856         41662        569311        540658
End            289786        289785       1312101        289784        571331        543884
End1           289786        289785       1312101        289784        571331        543884
Wr Pntr        289785        289784       1305856         41662        569311        540658
Rd Pntr        289785        289784       1305856        289784        569311        543884
Length              1             1          6245        248122          2020          3226


Number            672           674           695           698           701           780
Base          1434411       1434774        571589       1435581       1435839      10073204
End           1434774       1435193        572950       1435839       9552648      10321822
End1          1434774       1435193        572950       1435839       9552648      10321822
Wr Pntr       1434411       1434774        571589       1435581       1435839      10073204
Rd Pntr       1434411       1434774        571589       1435581       1435839      10321822
Length            363           419          1361           258       8116809        248618


Number            989           993           997           998
Base           572950        592950        593150         40478
End            592950        593150        593998         40678
End1           592950        593150        593998         40678
Wr Pntr        572950        592950        593150         40478
Rd Pntr        572950        592950        593150         40678
Length          20000           200           848           200




dumping /fiocom/, unit = 3 NFiles =     1 SizExt =    524288 WInBlk =       512
                   defal = T LstWrd =       65536 FType=2 FMxFil=10000


Number              0
Base            40448
End             65536
End1            65536
Wr Pntr         40448
Rd Pntr         40448
Length          25088
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.

输入文件的开头如下:
%chk=rawC-scan-1.chk
%mem=16GB
%nprocshared=16
# opt=modredundant b3lyp/6-31+g(d) MaxDisk=60GB geom=connectivity

没有加MaxDisk=60GB 的也试过,都不行
之前计算的时候也出现过这样的错误,然后再接着算就没问题了,感觉是稀里糊涂的就好了,这次试了很多方法都不好,希望大家不吝赐教,谢谢!

30

帖子

0

威望

684

eV
积分
714

Level 4 (黑子)

37#
发表于 Post on 2020-11-19 18:35:19 | 只看该作者 Only view this author
我新安装了g09 e.01也遇到了这个问题,提交了只读取了方法基组,不做任何计算就出现错误,log中就是题目中红色标注的:Operation on file out of range.和Error termination in NtrErr: NtrErr Called from FileIO.
segmentation violation。
ssh界面出现的是:
   rax 0000000000000000, rbx 0000000000751190, rcx ffffffffffffffff
   rdx 0000000000007c4b, rsp 00007ffe7ebc0a88, rbp 00007ffe7ebc0ab0
   rsi 000000000000000b, rdi 0000000000007c4b, r8  00002b32bad012c0
   r9  0000000000000000, r10 00007ffe7ebc04e0, r11 0000000000000206
   r12 00007ffe7ebc2c70, r13 00007ffe7ebc0ce0, r14 00007ffe7ebc0ce8
   r15 00007ffe7ebcceb0
  /lib64/libpthread.so.0(+0xf630) [0x2b32baeef630]
  /lib64/libc.so.6(kill+0x7) [0x2b32bb434657]
  /home/qq/g09/l1.exe() [0x49c797]
  /home/qq/g09/l1.exe() [0x4b47b0]
  /home/qq/g09/l1.exe() [0x4abef3]
  /home/qq/g09/l1.exe() [0x40635e]
  /home/qq/g09/l1.exe() [0x403bc1]
  /home/qq/g09/l1.exe() [0x40365c]
  /home/qq/g09/l1.exe() [0x4035dd]
  /lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xf5) [0x2b32bb420555]
  /home/qq/g09/l1.exe() [0x4034d9]
感觉大家都出类似的问题,搜来搜去没解决。后来我把文件夹下之前g03计算的.chk文件删掉,同一个gjf再用g09算就可以算了...
这个回帖作为参考吧

9

帖子

0

威望

101

eV
积分
110

Level 2 能力者

36#
发表于 Post on 2018-11-29 21:44:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-20 11:27
别写一堆乱七八糟关键词,基组用得完全不靠谱
怎么算RESP电荷在这里写得极其清楚
RESP拟合静电势电荷的 ...

谢谢sob老师,刚开始就是照葫芦画瓢照搬师兄的gjf文件,画得四不像了:(  其实对基组啥的都还不了解,先去补补基础知识

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
126225

管理员

公社社长

35#
发表于 Post on 2018-11-20 11:27:50 | 只看该作者 Only view this author
lucies123 发表于 2018-11-19 21:00
老师,同遇到类似的问题,对有机分子结构进行优化用于动力学,初学都还不太懂
请问下老师我的这个 ...

别写一堆乱七八糟关键词,基组用得完全不靠谱
怎么算RESP电荷在这里写得极其清楚
RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/441
先用像样的级别做几何优化,再把fch文件弄到Multiwfn里算RESP电荷
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

9

帖子

0

威望

101

eV
积分
110

Level 2 能力者

34#
发表于 Post on 2018-11-19 21:00:33 | 只看该作者 Only view this author
老师,同遇到类似的问题,对有机分子结构进行优化用于动力学,初学都还不太懂
请问下老师我的这个可以怎么解决呢?
out文件:
PGFIO/stdio: No such file or directory
PGFIO-F-/OPEN/unit=11/error code returned by host stdio - 2.
File name = /home/gromacs/wyt/scratch/Gau-17488.inp
In source file ml0.f, at line number 195
  ---trace back not available
Error: segmentation violation.
rax.......rbx........
r15......
  ---traceback not available

Log文件:
(...)
Operation on file out of range.
FileIO: IOper= 1 IFilNo(1)=  -526 Len=      212982 IPos=           0 Q=   47864166835528
(...)
Error termination in NtrErr: NtrErr Called from FileIO.

输入文件的开头是:
%nprocshared=16
%mem=30GB
%chk=1_para_H.chk
# opt b3lyp/6-31+g geom=connectivity iop(6/33=2,6/41=10,6/42=17) pop=mk
...

62

帖子

0

威望

559

eV
积分
621

Level 4 (黑子)

33#
发表于 Post on 2018-7-2 17:33:32 | 只看该作者 Only view this author
我将软件从D.01换到C.01,就没有再出现如题所述的报错

31

帖子

0

威望

242

eV
积分
273

Level 3 能力者

32#
发表于 Post on 2018-6-26 21:36:53 | 只看该作者 Only view this author
社长大人,我也出现了类似错误。输入:
#P B3LYP/6-311+G** em=GD3 opt freq=raman scrf=SMD  114个原子(两个分子的络合),几何优化了五步之后报错。输出文件的结尾部分: Number            670           672           674           695           698           701
Base          4828704      11699644      11700007       5074418      11701563      11702247
End           4837090      11700007      11700821       5077980      11702247      12171476
End1          4837090      11700007      11700821       5077980      11702247      12171476
Wr Pntr       4828704      11699644      11700007       5074418      11701563      11702247
Rd Pntr       4837090      11699644      11700007       5074418      11701563      11702247
Length           8386           363           814          3562           684        469229

Number            710           711           780           989           993           997
Base          5701697      10500602       5707005       5077980       5090480       5090580
End           5706970      11238802       8111801       5090480       5090580       5092232
End1          5706970      11238802       8111801       5090480       5090580       5092232
Wr Pntr       5701697      10500602       5707005       5077980       5090480       5090580
Rd Pntr       5701697      10500602       8111801       5077980       5090480       5090580
Length           5273        738200       2404796         12500           100          1652

Number            998
Base            20495
End             20695
End1            20695
Wr Pntr         20495
Rd Pntr         20695
Length            200


dumping /fiocom/, unit = 3 NFiles =     1 SizExt =    524288 WInBlk =       512
                   defal = T LstWrd =       67072 FType=2 FMxFil=10000

Number              0
Base            20480
End             67072
End1            67072
Wr Pntr         20480
Rd Pntr         20480
Length          46592
Error termination in NtrErr:    我也往前翻了,中间过程没有提示错误。  请社长大人指教!

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
126225

管理员

公社社长

31#
发表于 Post on 2017-7-28 09:03:49 | 只看该作者 Only view this author
Faye 发表于 2017-7-27 16:40
老师,我在做IRC运行时,刚运行就出现了error termination in ntrerr: ntrerr called from fileio的问题, ...

别从chk读信息,或者确保%chk指定的文件确实已经存在。另外路径里不要带空格
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

32

帖子

0

威望

379

eV
积分
411

Level 3 能力者

30#
发表于 Post on 2017-7-27 16:40:13 | 只看该作者 Only view this author
老师,我在做IRC运行时,刚运行就出现了error termination in ntrerr: ntrerr called from fileio的问题,输出文件如下:
Entering Link 1 = C:\G09W\l1.exe PID=      6092.
  
Copyright (c) 1988,1990,1992,1993,1995,1998,2003,2009, Gaussian, Inc.
                  All Rights Reserved.
  
This is part of the Gaussian(R) 09 program.  It is based on
the Gaussian(R) 03 system (copyright 2003, Gaussian, Inc.),
the Gaussian(R) 98 system (copyright 1998, Gaussian, Inc.),
the Gaussian(R) 94 system (copyright 1995, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 92(TM) system (copyright 1992, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 90(TM) system (copyright 1990, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 88(TM) system (copyright 1988, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 86(TM) system (copyright 1986, Carnegie Mellon
University), and the Gaussian 82(TM) system (copyright 1983,
Carnegie Mellon University). Gaussian is a federally registered
trademark of Gaussian, Inc.
  
This software contains proprietary and confidential information,
including trade secrets, belonging to Gaussian, Inc.
  
This software is provided under written license and may be
used, copied, transmitted, or stored only in accord with that
written license.
  
The following legend is applicable only to US Government
contracts under FAR:
  
                    RESTRICTED RIGHTS LEGEND
  
Use, reproduction and disclosure by the US Government is
subject to restrictions as set forth in subparagraphs (a)
and (c) of the Commercial Computer Software - Restricted
Rights clause in FAR 52.227-19.
  
Gaussian, Inc.
340 Quinnipiac St., Bldg. 40, Wallingford CT 06492
  
  
---------------------------------------------------------------
Warning -- This program may not be used in any manner that
competes with the business of Gaussian, Inc. or will provide
assistance to any competitor of Gaussian, Inc.  The licensee
of this program is prohibited from giving any competitor of
Gaussian, Inc. access to this program.  By using this program,
the user acknowledges that Gaussian, Inc. is engaged in the
business of creating and licensing software in the field of
computational chemistry and represents and warrants to the
licensee that it is not a competitor of Gaussian, Inc. and that
it will not use this program in any manner prohibited above.
---------------------------------------------------------------
  

Cite this work as:
Gaussian 09, Revision A.02,
M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria,
M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci,
G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H. P. Hratchian,
A. F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada,
M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima,
Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J. A. Montgomery, Jr.,
J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers,
K. N. Kudin, V. N. Staroverov, R. Kobayashi, J. Normand,
K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi,
M. Cossi, N. Rega, J. M. Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross,
V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann,
O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski,
R. L. Martin, K. Morokuma, V. G. Zakrzewski, G. A. Voth,
P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels,
O. Farkas, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, J. Cioslowski,
and D. J. Fox, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2009.

******************************************
Gaussian 09:  IA32W-G09RevA.02 11-Jun-2009
                27-Jul-2017
******************************************
%chk=C:\Users\Administrator\Desktop\RT-IM TS1 OPT FRE IRC.chk
----------------------------------------------------------------------
# irc=calcfc b3lyp/6-31++g(d,p) scrf=check guess=tcheck geom=(connecti
vity,allcheck) genchk
----------------------------------------------------------------------
1/10=4,14=-1,18=20,26=3,29=7,38=1,40=1,44=3,57=2/1,23;
2/9=110,12=2,29=1,40=1/2;
3/5=1,6=6,7=1111,11=2,14=-4,16=1,25=1,30=1,70=2,71=2,74=-5,116=-2/1,2,3;
4/5=101/1;
5/5=2/2;
8/6=4,10=90,11=11/1;
11/6=1,8=1,9=11,15=111,16=1/1,2,10;
10/6=1,7=6,13=1/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;
7/10=1,18=20,25=1/1,2,3,16;
1/10=4,14=-1,18=20,44=3/23(3);
2/9=110,29=1/2;
7/9=1,25=1,44=-1/16;
99//99;
2/9=110,29=1/2;
3/5=1,6=6,7=1111,11=2,14=-2,16=1,25=1,30=1,70=5,71=2,74=-5/1,2,3;
4/5=5,16=3/1;
5/5=2,38=5/2;
8/6=4,10=90,11=11/1;
11/6=1,8=1,9=11,15=111,16=1/1,2,10;
10/6=1,7=6,13=1/2;
7/10=1,18=20,25=1/1,2,3,16;
1/14=-1,18=20,44=3/23(-8);
2/9=110,29=1/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,19=2,28=1/1;
7/9=1,25=1,44=-1/16;
99/9=1/99;
FileIO operation on non-existent file.
FileIO: IOper= 2 IFilNo(1)=-20502 Len=          50 IPos=           2 Q=         13505360


dumping /fiocom/, unit = 1 NFiles =    14 SizExt =    524288 WInBlk =       512
                   defal = T LstWrd =      622080 FType=2 FMxFil=10000

Number           0        501        502        598        989        991        992        993
Base         96256      23552      41472      44032      24576      37888      37376      23040
End         622080      24552      43525      44035      37076      41169      37381      23140
End1        622080      24576      44032      44544      37376      41472      37888      23552
Wr Pntr      96256      23552      41472      44032      24576      37888      37376      23040
Rd Pntr      96256      23552      41472      44032      24576      41169      37381      23140
Length      525824       1000       2053          3      12500       3281          5        100

Number         994        995        996        997        998        999
Base         20480      22528      21504      22016      20992      44544
End          20510      22538      21604      22071      21192      95796
End1         20992      23040      22016      22528      21504      96256
Wr Pntr      20480      22528      21504      22016      20992      44544
Rd Pntr      20510      22538      21604      22069      21192      45796
Length          30         10        100         55        200      51252


dumping /fiocom/, unit = 2 NFiles =     1 SizExt =         0 WInBlk =       512
                   defal = F LstWrd =       67072 FType=2 FMxFil=10000

Number           0
Base         20480
End          67072
End1         67072
Wr Pntr      20480
Rd Pntr      20480
Length       46592


dumping /fiocom/, unit = 3 NFiles =     1 SizExt =    524288 WInBlk =       512
                   defal = T LstWrd =       67072 FType=2 FMxFil=10000

Number           0
Base         20480
End          67072
End1         67072
Wr Pntr      20480
Rd Pntr      20480
Length       46592
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.
请问老师,这个问题出在哪里?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
126225

管理员

公社社长

29#
发表于 Post on 2016-12-18 22:30:54 | 只看该作者 Only view this author
whtu 发表于 2016-7-8 14:16
谢谢sob老师。我生成cosmo文件就是要用于COSMO-RS的计算,照老师这么说,阳离子也就没必要加弥散了。另外 ...


以“描述质量”作为水平的衡量标准时,阴离子加弥散,中性和阳离子不加弥散,这叫做同一级别
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

67

帖子

0

威望

265

eV
积分
332

Level 3 能力者

28#
发表于 Post on 2016-12-18 21:42:51 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 落花飘雨679 于 2016-12-18 21:44 编辑

你好,我在扫描的时候也遇到了同样的问题,请问您是怎样解决的,谢谢

24

帖子

0

威望

459

eV
积分
483

Level 3 能力者

27#
发表于 Post on 2016-9-25 09:46:59 | 只看该作者 Only view this author
哦,谢谢老师

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
126225

管理员

公社社长

26#
发表于 Post on 2016-9-24 22:23:07 | 只看该作者 Only view this author
ztl1978 发表于 2016-9-24 20:42
sob老师您的意思是这个版本只能买是吗?网上没有吗?



要么你在windows下装个vmware linux虚拟机跑linux 64bit版Gaussian。速度和linux实体系统没什么差别。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

24

帖子

0

威望

459

eV
积分
483

Level 3 能力者

25#
发表于 Post on 2016-9-24 20:42:44 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您的意思是这个版本只能买是吗?网上没有吗?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
126225

管理员

公社社长

24#
发表于 Post on 2016-9-24 20:28:39 | 只看该作者 Only view this author
ztl1978 发表于 2016-9-24 20:07
sob老师您好,我看别人的内存设置达到60G,我想请教一下,是不是只有LINUX版本的高斯才可以设置这么大的内 ...


看Gaussian的位数,和windows还是linux无关。
如果是64bit windows版Gaussian,设多大都行。但是网上没这个版本
如果是32bit windows版Gaussian,一般最多也就1.5GB~1.6GB,目前网上的Gaussian Windows版都是这个版本。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

24

帖子

0

威望

459

eV
积分
483

Level 3 能力者

23#
发表于 Post on 2016-9-24 20:07:54 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好,我看别人的内存设置达到60G,我想请教一下,是不是只有LINUX版本的高斯才可以设置这么大的内存,当然内存设置也取决于体系大小和计算方法及精度,我的是WIN764位旗舰版,高斯也是WINDOWS版本的,这种版本的最大可以用多少内存,我的机子内存是16G,单机版。

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-4-18 08:58 , Processed in 0.244578 second(s), 22 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list