求助：如何用VMD看原子坐标

Jus · 发表于 Post on 2022-10-19 13:51:23

如何用VMD看原子的坐标

luogaoyang123 · 发表于 Post on 2023-6-16 14:58:54

naoki 发表于 2022-10-19 15:44
可视化界面上，按键盘上p键，点选你要查看的原子，terminal里有坐标

请问怎么得到一个原子的index 我这原子太多很乱

Jus · 发表于 Post on 2022-10-21 17:20:50

naoki 发表于 2022-10-19 15:44
可视化界面上，按键盘上p键，点选你要查看的原子，terminal里有坐标

好的，非常感谢

Jus · 发表于 Post on 2022-10-21 17:20:13

highlight 发表于 2022-10-19 15:15
选择 Mouse-Label-Atoms 模式
打开 Graphics-Labels 窗口，左上角用默认的 Atoms
用此时十字状的鼠标指针 ...

谢谢，已解决

Jus · 发表于 Post on 2022-10-21 17:19:45

liucw 发表于 2022-10-19 14:37
确定你的原子的index，然后在tcl中这样输入就可以

好的，谢谢你

naoki · 发表于 Post on 2022-10-19 15:44:54

可视化界面上，按键盘上p键，点选你要查看的原子，terminal里有坐标

highlight · 发表于 Post on 2022-10-19 15:15:13

选择 Mouse-Label-Atoms 模式
打开 Graphics-Labels 窗口，左上角用默认的 Atoms
用此时十字状的鼠标指针选中你要查看的原子
读取 Labels 窗口中 Picked Atom 选项卡下的 XYZ

liucw · 发表于 Post on 2022-10-19 14:37:32

确定你的原子的index，然后在tcl中这样输入就可以

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