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[CP2K] 求助 在centos8内下载cp2k出错

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各位老师,我在centos8上安装cp2k 2022.2版本,在输入“./install_cp2k_toolchain.sh --with-sirius=no --with-openmpi=install --with-plumed=install”时显示:
WARNING: (./install_cp2k_toolchain.sh, line 332) No MPI installation detected (ignore this message in Cray Linux Environment or when MPI installation was requested).
Compiling with 4 processes.
==================== Finding GCC from system paths ====================
path to gcc is /usr/bin/gcc
ERROR: (./scripts/stage0/install_gcc.sh) Cannot find g++, please check if the package gcc is installed or in system search path
[root@localhost build]#


(可是这个新版本的不是自带适用的gcc吗?)

然后我下载了gcc后 在激活时又显示:
[root@localhost gcc_install]# source ~/softwares/gcc9/env.sh
bash: /root/softwares/gcc9/env.sh: 没有那个文件或目录


(我看了路径是正确的,为什么一直显示没有文件呢?
此时我按下面路径看了一下是有gcc的
ERROR: (./scripts/stage0/install_gcc.sh) Cannot find g++, please check if the package gcc is installed or in system search path
[root@localhost build]#


各位老师,我现在应该如何处理这个问题呢?


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发表于 Post on 2023-8-1 09:16:25 | 只看该作者 Only view this author
highlight 发表于 2022-11-26 20:00
首先 ~/softwares/gcc9/env.sh 肯定是写教程的人自行安装后写的,你加载不到很正常
其次,提示的是你缺少  ...

按照您的提示,确实能启动安装gcc,没出现楼主提示的情况,但会出现一大堆类似这样的error:
getarch_2nd.c:22:35: error: ‘SGEMM_DEFAULT_UNROLL_M’ undeclared (first use in this function); did you mean ‘SBGEMM_DEFAULT_UNROLL_M’?
   22 |     printf("SGEMM_UNROLL_M=%d\n", SGEMM_DEFAULT_UNROLL_M);

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-28 17:11:03 | 只看该作者 Only view this author
3969832 发表于 2022-11-28 12:11
感觉你啥都不懂 建议你重装系统 按照一个完整的教程从头到尾做 你每次遇到错误自己不想直接到这儿问 一次两 ...

好的 谢谢您 我重新装一下

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-28 17:10:40 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2022-11-28 12:12
估计不少人都被这个问题搞得高血压了,这个问题循环了几天了
好好照着喂饭式的教程操作不好吗??http://b ...

好的,谢谢您

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-28 16:18:40 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2022-11-28 12:12
估计不少人都被这个问题搞得高血压了,这个问题循环了几天了
好好照着喂饭式的教程操作不好吗??http://b ...

好的 谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-28 16:17:26 | 只看该作者 Only view this author
3969832 发表于 2022-11-28 12:11
感觉你啥都不懂 建议你重装系统 按照一个完整的教程从头到尾做 你每次遇到错误自己不想直接到这儿问 一次两 ...

好的老师 我重装系统

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发表于 Post on 2022-11-28 12:12:14 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 牧生 于 2022-11-28 12:18 编辑

估计不少人都被这个问题搞得高血压了,这个问题循环了几天了
好好照着喂饭式的教程操作不好吗??http://bbs.keinsci.com/thread-21608-1-1.html




如果你在安装centos时,选择了带GUI以后,不知道右边的部分选什么,那就无脑全部选上。


如果实在太菜了,看这个帖子,把网盘中的文件下回来,按照教程进行。已经足够足够傻瓜了,一键操作,根本不需要动脑。
http://bbs.keinsci.com/thread-33603-1-1.html
又菜又爱玩

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发表于 Post on 2022-11-28 12:11:45 | 只看该作者 Only view this author
感觉你啥都不懂 建议你重装系统 按照一个完整的教程从头到尾做 你每次遇到错误自己不想直接到这儿问 一次两次还行 每个错误都直接复制过来 没人会理你的

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-28 11:33:54 | 只看该作者 Only view this author

==================== Installing ScaLAPACK ====================
scalapack-2.1.0.tgz: 成功
Checksum of scalapack-2.1.0.tgz Ok
Installing from scratch into /root/下载/cp2k-2022.2/cp2k-2022.2/tools/toolchain/install/scalapack-2.1.0
ERROR: (./scripts/stage4/install_scalapack.sh, line 51) Non-zero exit code detected.
老师,现在显示这个要怎么处理呀?

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发表于 Post on 2022-11-28 10:14:16 | 只看该作者 Only view this author
han- 发表于 2022-11-28 09:58
老师 这个中文目前还能改成英文吗?还是需要重新安装?
老师 我输入了yum install make,目前显示如下  ...

目前没问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-28 09:58:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-11-28 09:45
路径别有中文,自找麻烦
系统也别装成中文的。否则遇到报错提示都不好用google搜

老师 这个中文目前还能改成英文吗?还是需要重新安装?
老师 我输入了yum install make,目前显示如下 是正确的吗?:
[root@localhost toolchain]# ./install_cp2k_toolchain.sh --with-sirius=no --with-openmpi=install
WARNING: (./install_cp2k_toolchain.sh, line 332) No MPI installation detected (ignore this message in Cray Linux Environment or when MPI installation was requested).
Compiling with 4 processes.
==================== Finding GCC from system paths ====================
path to gcc is /usr/bin/gcc
path to g++ is /usr/bin/g++
path to gfortran is /usr/bin/gfortran
Found include directory /usr/include
Found lib directory /usr/lib64
Step gcc took 0.00 seconds.
Step intel took 0.00 seconds.
==================== Getting proc arch info using OpenBLAS tools ====================
OpenBLAS detected LIBCORE = haswell
OpenBLAS detected ARCH    = x86_64
==================== Installing CMake ====================
cmake-3.22.1-linux-x86_64.sh: 成功
Checksum of cmake-3.22.1-linux-x86_64.sh Ok
Installing from scratch into /root/下载/cp2k-2022.2/cp2k-2022.2/tools/toolchain/install/cmake-3.22.1
Step cmake took 14.00 seconds.
==================== Installing OpenMPI ====================
openmpi-4.1.1.tar.gz: 成功
Checksum of openmpi-4.1.1.tar.gz Ok
Installing from scratch into /root/下载/cp2k-2022.2/cp2k-2022.2/tools/toolchain/install/openmpi-4.1.1
Found directory /root/下载/cp2k-2022.2/cp2k-2022.2/tools/toolchain/install/openmpi-4.1.1/bin
Found directory /root/下载/cp2k-2022.2/cp2k-2022.2/tools/toolchain/install/openmpi-4.1.1/lib
Found directory /root/下载/cp2k-2022.2/cp2k-2022.2/tools/toolchain/install/openmpi-4.1.1/include
mpirun is installed as /root/下载/cp2k-2022.2/cp2k-2022.2/tools/toolchain/install/openmpi-4.1.1/bin/mpirun
mpicc is installed as /root/下载/cp2k-2022.2/cp2k-2022.2/tools/toolchain/install/openmpi-4.1.1/bin/mpicc
mpicxx is installed as /root/下载/cp2k-2022.2/cp2k-2022.2/tools/toolchain/install/openmpi-4.1.1/bin/mpicxx
mpif90 is installed as /root/下载/cp2k-2022.2/cp2k-2022.2/tools/toolchain/install/openmpi-4.1.1/bin/mpif90
Step openmpi took 506.00 seconds.
==================== Installing OpenBLAS ====================
OpenBLAS-0.3.20.tar.gz is found
Installing from scratch into /root/下载/cp2k-2022.2/cp2k-2022.2/tools/toolchain/install/openblas-0.3.20

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发表于 Post on 2022-11-28 09:45:55 | 只看该作者 Only view this author
han- 发表于 2022-11-28 09:43
老师 都安装了,然后:
[root@localhost toolchain]# ./install_cp2k_toolchain.sh --with-sirius=no -- ...

路径别有中文,自找麻烦
系统也别装成中文的。否则遇到报错提示都不好用google搜

yum install make


当初要是按我博文说的装系统,根本就不需要后来再自己装这些
(PS:常有人问我装CentOS 8的时候应该选什么,建议Base Environment选Workstation,组件选GNOME Applications、Legacy UNIX Compatibility、Development Tools、Scientific Support)




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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-28 09:43:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-11-28 09:33
yum install gcc-c++
另外,gfortran没装的话也用yum install gcc-gfortran装上

老师 都安装了,然后:
[root@localhost toolchain]# ./install_cp2k_toolchain.sh --with-sirius=no --with-openmpi=install --with-plumed=install
WARNING: (./install_cp2k_toolchain.sh, line 332) No MPI installation detected (ignore this message in Cray Linux Environment or when MPI installation was requested).
Compiling with 4 processes.
==================== Finding GCC from system paths ====================
path to gcc is /usr/bin/gcc
path to g++ is /usr/bin/g++
path to gfortran is /usr/bin/gfortran
Found include directory /usr/include
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Step gcc took 0.00 seconds.
Step intel took 0.00 seconds.
==================== Getting proc arch info using OpenBLAS tools ====================
/root/下载/cp2k-2022.2/cp2k-2022.2/tools/toolchain/scripts/get_openblas_arch.sh:行51: make: 未找到命令
ERROR: (/root/下载/cp2k-2022.2/cp2k-2022.2/tools/toolchain/scripts/get_openblas_arch.sh, line 51) Non-zero exit code detected.
ERROR: (./scripts/stage0/setup_buildtools.sh, line 44) Non-zero exit code detected.
这个如何处理呀 老师

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发表于 Post on 2022-11-28 09:33:25 | 只看该作者 Only view this author
han- 发表于 2022-11-28 09:14
老师,显示这个:
[root@localhost toolchain]# yum install gcc
上次元数据过期检查:1 day, 16:45:24 ...

yum install gcc-c++
另外,gfortran没装的话也用yum install gcc-gfortran装上
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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-28 09:26:55 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2022-11-26 19:58
仅仅是下载没用,你要先安装 gcc ,然后才能激活啊。

老师 已经下载完了呀 就是激活的时候显示没有文件

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