计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 2053|回复 Reply: 15
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[硬件相关] CPU并行,一个满载,一个偷懒

[复制链接 Copy URL]

125

帖子

0

威望

1198

eV
积分
1323

Level 4 (黑子)


各位大佬,两个CPU这样工作正常吗?是不是在并行?

119

帖子

2

威望

1855

eV
积分
2014

Level 5 (御坂)

naïve

16#
发表于 Post on 2023-1-6 21:35:40 | 只看该作者 Only view this author
lurensan 发表于 2023-1-6 19:48
这cpu躺平的不是一点点啊。 还是关了超线程吧

准备趁春节放假我再多做几个测试对比看看
单从现在的数据看跟sob老师文章(http://sobereva.com/392)中的描述不太相符啊
too young, too simple, sometimes naïve

125

帖子

0

威望

1198

eV
积分
1323

Level 4 (黑子)

15#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-1-6 19:48:13 | 只看该作者 Only view this author
anson 发表于 2023-1-6 14:49
刚刚算完,感觉挺离谱的。算的是57个原子体系的单点能,关键词wB97XD def2TZVPP scrf=smd。
开HT是2d4h4 ...

这cpu躺平的不是一点点啊。 还是关了超线程吧

119

帖子

2

威望

1855

eV
积分
2014

Level 5 (御坂)

naïve

14#
发表于 Post on 2023-1-6 14:49:30 | 只看该作者 Only view this author
lurensan 发表于 2023-1-6 10:15
计算时间上呢,感觉大点的体系时间差距也会不小,毕竟有个躺平的cpu在拖后腿

刚刚算完,感觉挺离谱的。算的是57个原子体系的单点能,关键词wB97XD def2TZVPP scrf=smd。
开HT是2d4h46min,关HT是11h40min。
too young, too simple, sometimes naïve

125

帖子

0

威望

1198

eV
积分
1323

Level 4 (黑子)

13#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-1-6 10:15:01 | 只看该作者 Only view this author
anson 发表于 2023-1-6 00:56
目前看到开HT时节点0基本全部占用都在90%以上,节点1只有一两个线程50%左右(可能是其他程序占用的)剩下 ...

计算时间上呢,感觉大点的体系时间差距也会不小,毕竟有个躺平的cpu在拖后腿

119

帖子

2

威望

1855

eV
积分
2014

Level 5 (御坂)

naïve

12#
发表于 Post on 2023-1-6 00:56:30 | 只看该作者 Only view this author
lurensan 发表于 2023-1-5 18:10
👍👍看看偷懒能偷懒到啥水平。

目前看到开HT时节点0基本全部占用都在90%以上,节点1只有一两个线程50%左右(可能是其他程序占用的)剩下的都是10%以下,整体CPU占用率在56%左右;关了HT看到两个节点占用都是90%以上,整体占用顶着100%。


too young, too simple, sometimes naïve

125

帖子

0

威望

1198

eV
积分
1323

Level 4 (黑子)

11#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-1-5 18:10:37 | 只看该作者 Only view this author
anson 发表于 2023-1-5 15:36
刚刚试了一下,机器是2×2699v3
用ORCA算异丙醇的ZPE,开HT平均57s左右(1U满载,1U睡觉,频率2.7 ...

👍👍看看偷懒能偷懒到啥水平。

119

帖子

2

威望

1855

eV
积分
2014

Level 5 (御坂)

naïve

10#
发表于 Post on 2023-1-5 15:36:22 | 只看该作者 Only view this author
lurensan 发表于 2023-1-5 11:06
这倒没有,把HT关了就再也没管过了

刚刚试了一下,机器是2×2699v3
用ORCA算异丙醇的ZPE,开HT平均57s左右(1U满载,1U睡觉,频率2.7左右),关HT平均45s(2U都是100%满载,频率干到了3.1),但是我感觉这么小的体系可能实际参考意义不大。
现在扔了个以前开HT的要2.5d的进G16里,看看关了HT得要多久
too young, too simple, sometimes naïve

125

帖子

0

威望

1198

eV
积分
1323

Level 4 (黑子)

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-1-5 11:06:58 | 只看该作者 Only view this author
anson 发表于 2023-1-4 23:22
楼主有没有对比过关HT的2U工作和开HT的1U偷懒1U满载的计算时间呢

这倒没有,把HT关了就再也没管过了

119

帖子

2

威望

1855

eV
积分
2014

Level 5 (御坂)

naïve

8#
发表于 Post on 2023-1-4 23:22:57 | 只看该作者 Only view this author
楼主有没有对比过关HT的2U工作和开HT的1U偷懒1U满载的计算时间呢
too young, too simple, sometimes naïve

320

帖子

1

威望

5365

eV
积分
5705

Level 6 (一方通行)

7#
发表于 Post on 2022-11-28 13:08:13 | 只看该作者 Only view this author
lurensan 发表于 2022-11-28 10:33
我用的是centos的g16,我试试关了超线程,两个CPU都工作了

嗯 那就跟我遇见的情形类似。不知道为啥超过64个逻辑核心就会有问题。

10

帖子

0

威望

173

eV
积分
183

Level 3 能力者

6#
发表于 Post on 2022-11-28 10:53:51 | 只看该作者 Only view this author
win有问题 重装换centos就好了 centos开超线程也能正常双CPU满载

125

帖子

0

威望

1198

eV
积分
1323

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-28 10:33:50 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lurensan 于 2022-11-28 10:49 编辑
paramecium86 发表于 2022-11-28 08:43
不知道你运行的是什么程序。如果是win64位版的高斯那我也碰到过。我之前用2698v4也遇到过这个情况。可以试 ...

我用的是centos的g16,我试试关了超线程,两个CPU都工作了

125

帖子

0

威望

1198

eV
积分
1323

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-28 10:31:38 | 只看该作者 Only view this author

老师,这是18核的并行情况。同样使用的是虚拟机centos7.6的gaussian 16。好像就是不太正常,需要怎么调整呢?

320

帖子

1

威望

5365

eV
积分
5705

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2022-11-28 08:43:36 | 只看该作者 Only view this author
不知道你运行的是什么程序。如果是win64位版的高斯那我也碰到过。我之前用2698v4也遇到过这个情况。可以试试关掉超线程再试试。总的逻辑处理器数目不超过64的话好像就没有这个问题。

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 21:57 , Processed in 0.192369 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list