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[Gaussian/gview] 掺氮石墨吸附污染物分析问题

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我在计算掺氮石墨烯吸附污染物时遇到了一点问题,下面是我的计算过程。首先,我我设计了图一构型去吸附污染物,但是结果磺酸基团并不能够和H-N形成H键。吸附能为-21.13KJ/mol,
。然我将掺氮石墨烯构型中空缺变大,也就是图二,发现了磺酸基团能与H-N 形成氢键了,吸附能为-60.31KJ/mol。我的问题:为什么空缺小时,不能形成H键。空缺变大就可以。最后是我的计算基组:# opt freq b3lyp/6-31g(d,p) scrf=(solvent=water) em=gd3bj。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-12-18 12:07:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-12-18 11:06
要对氢键的几何特征有点基本的了解,氢键是有一定方向性的,氢键键角偏离直线巨大的氢键必定很弱。如果由于 ...

谢谢卢老师

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发表于 Post on 2022-12-18 11:06:31 | 只看该作者 Only view this author
要对氢键的几何特征有点基本的了解,氢键是有一定方向性的,氢键键角偏离直线巨大的氢键必定很弱。如果由于结构原因注定没法形成键角合适的氢键的话,比如你的第一张图的情况,就别指望能形成氢键了。根本连试算都不用试。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-12-17 23:22:31 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-12-17 04:22
第二个模型不合理,有碳自由基,实际吸附污染物的时候碰到点氧气啥的就反应掉了,不可能稳定存在。

谢谢老师

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发表于 Post on 2022-12-17 04:22:23 | 只看该作者 Only view this author
第二个模型不合理,有碳自由基,实际吸附污染物的时候碰到点氧气啥的就反应掉了,不可能稳定存在。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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