求助：速度自相关函数趋向于0的速度的问题

MZTNXWXBCLA · 发表于 Post on 2022-12-19 18:47:36

文献中是一个n-C7H16 - N2体系，速度自相关函数在2000ps的时候到了0，我自己用GROMACS跑了下，发现速度自相关函数很快就到了0.09，但是趋向于0的速度很慢，请问是什么原因导致了这种差异呢？是因为压力吗？这篇文献中我都没有看到有关预平衡的步骤，而且还跑了nve。感觉有些奇怪

Lacrimosa · 发表于 Post on 2023-2-28 13:34:45

qiyan 发表于 2023-2-28 10:00
请问一下gromacs里计算vacf的命令是什么啊

手册里一搜便知，gmx velacc

qiyan · 发表于 Post on 2023-2-28 10:00:13

请问一下gromacs里计算vacf的命令是什么啊

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[GROMACS] 求助：速度自相关函数趋向于0的速度的问题