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[VMD] 用VMD显示蛋白质分子的二级结构与PDB库中的结构有时有不少差别,请教各位原因!

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本帖最后由 huhq 于 2023-2-27 17:24 编辑

PDB数据库中1G1C蛋白结构如下:



2ns动力学平衡后1G1C蛋白结构如下(经mol ssrecalc top命令渲染):



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发表于 Post on 2023-1-12 13:28:38 | 只看该作者 Only view this author
标题一行话,内容全靠猜,怎么回答你呢

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发表于 Post on 2023-1-10 11:16:37 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 乐平 于 2023-1-10 11:21 编辑

你这样提问,没人能回答……

什么蛋白质?什么差别? 至少把你在 VMD 里显示的和 PDB 网页显示的分别截图,标记处你认为有差别的地方。这样别人才能看到你所谓的差别啊。

用营销号的方式打个比方:“这个男人叫小帅,另一个男人叫大壮,他们俩有差别。你怎么看?”
谁知道你说的小帅,大壮长什么样啊?

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