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[Gaussian/gview] Gaussian中使用oniom优化激发态结构求助

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各位老师好,我想用oniom优化分子在晶体环境下的激发态。我计算了MM部分的CHELPG电荷,请问,应该如何电子嵌入?是类似这样的写法吗:#opt oniom(td=(singlets,nstates=10)/b3lyp/6-31g(d,p) em=gd3:uff)=embedcharge geom=connectivity
   <---空行
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   <---空行
0 1
C                 -0.86593500    0.25621000    0.11508600
C                 -1.86773300    1.17440100   -0.15059900
C                 -1.23222000   -1.02932800    0.48142100
C                  0.52813200    0.68962600    0.02868400
...略
   <---空行
-11.079484 3.713347 -0.838676 0.272660 -----此部分是根据http://sobereva.com/579文中计算得到的CHELPG电荷
-12.081139 4.631418 -1.104034 -0.210476
-11.445682 2.427925 -0.472243 -0.188136
-13.413720 4.251740 -1.034406 -0.034063
-11.829578 5.657487 -1.375829 0.110713
...略
   <---空行
   <---空行

感谢!

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发表于 Post on 2023-8-29 09:38:47 | 只看该作者 Only view this author

谢谢sob老师的解答,感谢

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发表于 Post on 2023-8-28 15:57:49 | 只看该作者 Only view this author
Red_Star 发表于 2023-8-28 10:12
非常感谢sob老师的解答,谢谢!
对于问题1,我想表达的是,如果我用的是Qeq电荷,在oniom方法中写为onio ...

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2023-8-28 10:12:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-8-27 21:06
1 2L的ppt里写明了,原子电荷写在元素名后面。跟定义背景电荷的方式完全是两码事

2 显然XYZ坐标照常写 ...

非常感谢sob老师的解答,谢谢!
对于问题1,我想表达的是,如果我用的是Qeq电荷,在oniom方法中写为oniom(td/b3lyp/6-31g(d,p) em=gd3:uff=qeq)=embedcharge,但是Qeq对电荷描述不好;用CHELPG电荷的话,是不是oniom处写成oniom(td/b3lyp/6-31g(d,p) em=gd3:uff)=embedcharge这样就可以?
谢谢sob老师!

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发表于 Post on 2023-8-27 21:06:14 | 只看该作者 Only view this author
Red_Star 发表于 2023-8-27 18:24
sob老师好,对于使用oniom优化分子在晶体环境下的激发态,我有几个问题想请教:

1.我想电子嵌入MM区域 ...

1 2L的ppt里写明了,原子电荷写在元素名后面。跟定义背景电荷的方式完全是两码事

2 显然XYZ坐标照常写在后面的列

3 对high层原子和ppt里相同方式定义原子电荷
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发表于 Post on 2023-8-27 18:24:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-1-29 12:53
背景电荷才是写在末尾

给分子力场设置原子电荷要写在元素名后面,看我培训班的ppt

sob老师好,对于使用oniom优化分子在晶体环境下的激发态,我有几个问题想请教:

1.我想电子嵌入MM区域的CHELPG电荷,就像上面那样,关键词写#opt oniom(td/b3lyp/6-31g(d,p) em=gd3:uff)=embedcharge geom=connectivity,在坐标后空一行加上CHELPG电荷?“uff”后面和“)”前面这部分不需要加任何关键词吗?

2.向sob老师回复的图片里面写的那样,UFF立场下,电荷表达为O-O_3--0.5。但这样表示,没有坐标,怎么区分辨别不同的原子呢?是按照gjf输入文件中MM区域(low层)的原子顺序依次写对应原子的CHELPG电荷吗?

3.如果是按照MM区域(low层)的原子顺序依次写CHELPG电荷,那么到了QM区域(high层)怎么办,是直接忽略过去,接着写MM区域的吗?如果直接略过,继续写MM区域的CHGLPG电荷,会不会无法与gjf输入文件对应的上?

谢谢sob老师!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-1-29 13:05:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-1-29 12:53
背景电荷才是写在末尾

给分子力场设置原子电荷要写在元素名后面,看我培训班的ppt

明白了,谢谢老师!

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楼主
发表于 Post on 2023-1-29 12:53:39 | 只看该作者 Only view this author
背景电荷才是写在末尾

给分子力场设置原子电荷要写在元素名后面,看我培训班的ppt



把td=(singlets,nstates=10)/ 改成td

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