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[Gaussian/gview] Gaussian中使用oniom优化激发态结构求助

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楼主
各位老师好,我想用oniom优化分子在晶体环境下的激发态。我计算了MM部分的CHELPG电荷,请问,应该如何电子嵌入?是类似这样的写法吗:#opt oniom(td=(singlets,nstates=10)/b3lyp/6-31g(d,p) em=gd3:uff)=embedcharge geom=connectivity
   <---空行
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   <---空行
0 1
C                 -0.86593500    0.25621000    0.11508600
C                 -1.86773300    1.17440100   -0.15059900
C                 -1.23222000   -1.02932800    0.48142100
C                  0.52813200    0.68962600    0.02868400
...略
   <---空行
-11.079484 3.713347 -0.838676 0.272660 -----此部分是根据http://sobereva.com/579文中计算得到的CHELPG电荷
-12.081139 4.631418 -1.104034 -0.210476
-11.445682 2.427925 -0.472243 -0.188136
-13.413720 4.251740 -1.034406 -0.034063
-11.829578 5.657487 -1.375829 0.110713
...略
   <---空行
   <---空行

感谢!

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发表于 Post on 2023-1-29 12:53:39 | 只看该作者 Only view this author
背景电荷才是写在末尾

给分子力场设置原子电荷要写在元素名后面,看我培训班的ppt



把td=(singlets,nstates=10)/ 改成td

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-1-29 13:05:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-1-29 12:53
背景电荷才是写在末尾

给分子力场设置原子电荷要写在元素名后面,看我培训班的ppt

明白了,谢谢老师!

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发表于 Post on 2023-8-27 18:24:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-1-29 12:53
背景电荷才是写在末尾

给分子力场设置原子电荷要写在元素名后面,看我培训班的ppt

sob老师好,对于使用oniom优化分子在晶体环境下的激发态,我有几个问题想请教:

1.我想电子嵌入MM区域的CHELPG电荷,就像上面那样,关键词写#opt oniom(td/b3lyp/6-31g(d,p) em=gd3:uff)=embedcharge geom=connectivity,在坐标后空一行加上CHELPG电荷?“uff”后面和“)”前面这部分不需要加任何关键词吗?

2.向sob老师回复的图片里面写的那样,UFF立场下,电荷表达为O-O_3--0.5。但这样表示,没有坐标,怎么区分辨别不同的原子呢?是按照gjf输入文件中MM区域(low层)的原子顺序依次写对应原子的CHELPG电荷吗?

3.如果是按照MM区域(low层)的原子顺序依次写CHELPG电荷,那么到了QM区域(high层)怎么办,是直接忽略过去,接着写MM区域的吗?如果直接略过,继续写MM区域的CHGLPG电荷,会不会无法与gjf输入文件对应的上?

谢谢sob老师!

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发表于 Post on 2023-8-27 21:06:14 | 只看该作者 Only view this author
Red_Star 发表于 2023-8-27 18:24
sob老师好,对于使用oniom优化分子在晶体环境下的激发态,我有几个问题想请教:

1.我想电子嵌入MM区域 ...

1 2L的ppt里写明了,原子电荷写在元素名后面。跟定义背景电荷的方式完全是两码事

2 显然XYZ坐标照常写在后面的列

3 对high层原子和ppt里相同方式定义原子电荷
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发表于 Post on 2023-8-28 10:12:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-8-27 21:06
1 2L的ppt里写明了,原子电荷写在元素名后面。跟定义背景电荷的方式完全是两码事

2 显然XYZ坐标照常写 ...

非常感谢sob老师的解答,谢谢!
对于问题1,我想表达的是,如果我用的是Qeq电荷,在oniom方法中写为oniom(td/b3lyp/6-31g(d,p) em=gd3:uff=qeq)=embedcharge,但是Qeq对电荷描述不好;用CHELPG电荷的话,是不是oniom处写成oniom(td/b3lyp/6-31g(d,p) em=gd3:uff)=embedcharge这样就可以?
谢谢sob老师!

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发表于 Post on 2023-8-28 15:57:49 | 只看该作者 Only view this author
Red_Star 发表于 2023-8-28 10:12
非常感谢sob老师的解答,谢谢!
对于问题1,我想表达的是,如果我用的是Qeq电荷,在oniom方法中写为onio ...

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发表于 Post on 2023-8-29 09:38:47 | 只看该作者 Only view this author

谢谢sob老师的解答,感谢

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