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[新手求助] ORCA与Gaussian做带电有机分子的OPT+FREQ问题求助

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如题。
本人菜鸟一枚,之前一直使用Gaussian做有机小分子的计算,但是最近由于体系的原因(原子数太多),Gaussian计算实在太慢,所以想转而使用ORCA。
看过前辈之前发的ORCA和Gaussian的泛函和基组对照,最近做的课题涉及到带电体系(有机羧酸上的氢解离),
想知道这种有机酸带电的体系一般用什么泛函和基组比较好呢?
B3LYP/def2TZVP em=GD3BJ够用么?

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发表于 Post on 2023-2-25 03:39:13 | 只看该作者 Only view this author
opt freq用B97-3c(不是仅作为预优化。结果可以直接用。比r2SCAN-3c便宜,而且出虚频的可能性更低,质量通常也足够好)。作为预优化,可以用GFN2-xTB
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-24 17:28:12 | 只看该作者 Only view this author
Freeman 发表于 2023-2-24 11:02
预优化r2scan-3c,优化泛函m062x或b3lyp-d3(bj)基组def2-svpd或ma-def2-svp(最好只给明显带电的部位加弥散 ...

这个时间还是可以接受的,非常感谢

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发表于 Post on 2023-2-24 11:02:19 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Freeman 于 2023-2-24 11:07 编辑

预优化r2scan-3c,优化泛函m062x或b3lyp-d3(bj)基组def2-svpd或ma-def2-svp(最好只给明显带电的部位加弥散)。内存用满。跑一个点约15-20min,频率约9hr。如果接受不了这个时长的话,就直接用r2scan-3c的预优化结果得了。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-24 10:35:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-2-24 05:55
我回复里提到的帖子里的Q11里都明确说了必须得说清楚总原子数,光说羧基数和元素有什么用,又不是完全决 ...

总原子数230

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发表于 Post on 2023-2-24 05:55:48 | 只看该作者 Only view this author
社会主义小战士 发表于 2023-2-23 12:10
感谢社长!
这个体系的化学组成包括C、Si、O、H、S这些元素,分子上含有6个羧基,想做这个分子的结构优 ...

我回复里提到的帖子里的Q11里都明确说了必须得说清楚总原子数,光说羧基数和元素有什么用,又不是完全决定答案的信息
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2023-2-23 16:09:45 | 只看该作者 Only view this author
社会主义小战士 发表于 2023-2-23 05:10
感谢社长!
这个体系的化学组成包括C、Si、O、H、S这些元素,分子上含有6个羧基,想做这个分子的结构优 ...

这个分子有多少原子?有特别大的共轭体系(类似卟啉那么大的)吗?有不常见的成键方式吗?有单电子吗?
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-23 12:10:30 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 社会主义小战士 于 2023-2-23 12:17 编辑
sobereva 发表于 2023-2-23 09:41
说具体体系的化学组成、计算条件,仔细看此文,特别是Q11
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得 ...

感谢社长!
这个体系的化学组成包括C、Si、O、H、S这些元素,分子上含有6个羧基,想做这个分子的结构优化、振动频率,用来拟合参数跑MD。计算资源组里现在的QC机器是36物理核72逻辑核心

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发表于 Post on 2023-2-23 09:41:18 | 只看该作者 Only view this author
说具体体系的化学组成、计算条件,仔细看此文,特别是Q11
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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