计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 11517|回复 Reply: 8
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] CBS方法可不可以获得分子中每个原子的受力

[复制链接 Copy URL]

1552

帖子

2

威望

6243

eV
积分
7835

Level 6 (一方通行)

给dalao们倒茶

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
如题,以二聚水为例,CBS方法可不可以获得二聚水中每个原子的受力。另外,有没有其他软件或程序可以获得分子中每个原子的受力,谢谢各位。
淡泊以明志,宁静以致远。

1552

帖子

2

威望

6243

eV
积分
7835

Level 6 (一方通行)

给dalao们倒茶

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-23 08:19:28 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2016-6-22 17:12
根据各种原子电荷的定义在较低水平下就可以得到合理的原子电荷,例如B3LYP/6-31G(d)之类的。原子电荷根本 ...

非常感谢Li老师的回答,算电荷是想用各种方法去进行比较,以为CBS可外推得到。受力是想看看哪个原子受力最大,看来是我想多了。再次感谢Li老师以及sob老师热心的回复。
淡泊以明志,宁静以致远。

3098

帖子

28

威望

1万

eV
积分
16892

Level 6 (一方通行)

8#
发表于 Post on 2016-6-22 17:12:00 | 只看该作者 Only view this author
978142355 发表于 2016-6-22 16:58
谢谢sob老师回复。那如果不用组合的方式,只用MP2或B3LYP,能否获得原子受力和电荷分布?

根据各种原子电荷的定义在较低水平下就可以得到合理的原子电荷,例如B3LYP/6-31G(d)之类的。原子电荷根本不是实验可测量量,也不是well define的东西,外推它到“exact”即没意义、也不可能,也没有可对照的实验数据。

用任意水平做优化的时候自动输出受力,用force关键词可以在单点任务输出受力。但力是势能面(能量)的梯度,优化后的构型(忽略优化精度导致的小误差)处于势能面的极小点上,受力是0(优化完成后最大受力和均方根受力应当小于阈值),算它干啥?

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +1 收起 理由
Reason
sobereva + 1

查看全部评分 View all ratings

1552

帖子

2

威望

6243

eV
积分
7835

Level 6 (一方通行)

给dalao们倒茶

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-22 16:58:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-6-22 14:19
这些热力学组合方法是用来计算热力学量的,是一套任务的组合,根本没法像诸如MP2、B3LYP之类理论方法用 ...

谢谢sob老师回复。那如果不用组合的方式,只用MP2或B3LYP,能否获得原子受力和电荷分布?
淡泊以明志,宁静以致远。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112356

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2016-6-22 14:19:47 | 只看该作者 Only view this author
978142355 发表于 2016-6-22 14:13
哦,这样啊,看来是弄错了,谢谢纠正。那么李老师,类似完备基组外推的方法求得力和电荷?


这些热力学组合方法是用来计算热力学量的,是一套任务的组合,根本没法像诸如MP2、B3LYP之类理论方法用来得到受力、电荷
在使用任何理论方法之前,都要把其基本思想了解一下,起码知道是干什么用的。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

1552

帖子

2

威望

6243

eV
积分
7835

Level 6 (一方通行)

给dalao们倒茶

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-22 14:13:41 | 只看该作者 Only view this author
jackie 发表于 2016-6-22 11:14
对,同意楼上。CBS是由两种不同基组推算得到的完备基组,不是方法

谢谢纠正,非常感谢。
淡泊以明志,宁静以致远。

1552

帖子

2

威望

6243

eV
积分
7835

Level 6 (一方通行)

给dalao们倒茶

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-22 14:13:00 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2016-6-22 11:00
CBS不是一种方法,是很多方法把最后的自由能搞准,所以例如其中优化的每一个单点都会输出force,但没有“CB ...

哦,这样啊,看来是弄错了,谢谢纠正。那么李老师,类似完备基组外推的方法求得力和电荷?
淡泊以明志,宁静以致远。

129

帖子

0

威望

955

eV
积分
1084

Level 4 (黑子)

3#
发表于 Post on 2016-6-22 11:14:11 | 只看该作者 Only view this author
对,同意楼上。CBS是由两种不同基组推算得到的完备基组,不是方法

3098

帖子

28

威望

1万

eV
积分
16892

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2016-6-22 11:00:27 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 liyuanhe211 于 2016-6-22 17:04 编辑

CBS不是一种方法,是很多水平把最后的自由能搞准,所以例如其中优化的每一个单点都会输出force,但没有“CBS的force”一说。

优化完了在当前级别下原子的受力 by definition 是0。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +1 收起 理由
Reason
sobereva + 1

查看全部评分 View all ratings

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 10:37 , Processed in 0.159818 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list