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[Gaussian/gview] 求助 Gaussian优化冠醚与li+的配合物问题

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我利用Gaussian优化冠醚与li+的配合物,初始构象如下图

所使用的方法是

最后得到的结果如下图,不太正确 想问问是什么原因导致的


202303211821069024..png (125.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

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202303211824584132..png (100.97 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-22 16:13:40 | 只看该作者 Only view this author
chemhou 发表于 2023-3-22 12:04
这个优化的结果没有本质上的问题
参见:https://www.nature.com/articles/s41467-021-25597-1的方法部分和 ...

好的 谢谢兄弟 这篇文章对我的帮助很大 再次感想

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发表于 Post on 2023-3-22 12:04:53 | 只看该作者 Only view this author
这个优化的结果没有本质上的问题
参见:https://www.nature.com/articles/s41467-021-25597-1的方法部分和补充材料

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-22 11:11:12 | 只看该作者 Only view this author
北大-陶豫 发表于 2023-3-22 10:26
还有一个问题是,18-冠-6本来就比较大,中间放个K+刚刚好,Li+确实太小了,优化的时候Li+跑到一个氧上也不 ...

好的谢谢 我看了文献也是说 k+比较适配 我去更改一下

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-22 11:07:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-3-21 23:34
仔细看置顶的社员必读贴,里面明确写了怎么贴图,上传的图片必须手动插入到合适的位置

不要写完全多余 ...

好的 我去看看 谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-22 11:07:18 | 只看该作者 Only view this author
wjc404 发表于 2023-3-21 19:02
几何优化可以不用弥散函数(最多给氧原子加上弥散)。你的初始结构距离平衡时的太远,可以先用半经验的方法 ...

我明白了 谢谢 我去改一下

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发表于 Post on 2023-3-22 10:26:27 | 只看该作者 Only view this author
还有一个问题是,18-冠-6本来就比较大,中间放个K+刚刚好,Li+确实太小了,优化的时候Li+跑到一个氧上也不奇怪
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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发表于 Post on 2023-3-21 23:34:25 | 只看该作者 Only view this author
xuan12138 发表于 2023-3-21 18:34
抱歉 图太乱了 发帖之后想重新编辑 结果每次编辑完 删除的东西没删掉 所以多插了好几张图 用的方法是# opt  ...

仔细看置顶的社员必读贴,里面明确写了怎么贴图,上传的图片必须手动插入到合适的位置

不要写完全多余的noraman

没必要加弥散函数

最关键问题就是前面的人说的,要设成1 1。

这种体系不叫配合物,并没有配位键。应当说成复合物



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发表于 Post on 2023-3-21 19:02:06 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wjc404 于 2023-3-22 00:47 编辑

几何优化可以不用弥散函数(最多给氧原子加上弥散)。你的初始结构距离平衡时的太远,可以先用半经验的方法优化,再用DFT。

自旋多重度和电荷设置不对,你的体系应该是“1 1”而不是程序自动的“0 2”。

建议你去报名社长的初级量子化学班,可以少走些弯路。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-21 18:34:29 | 只看该作者 Only view this author
抱歉 图太乱了 发帖之后想重新编辑 结果每次编辑完 删除的东西没删掉 所以多插了好几张图 用的方法是# opt freq=noraman b3lyp/6-311+g(d,p) geom=connectivity
没有用老师例子里的那个#p opt freq guess=read def2tzvp tpssh 请问是这个原因吗

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