请问老师Amber建立溶剂盒子后怎么看溶剂盒子的长宽是多少埃呀？

jiahui

请问老师Amber建立溶剂盒子后怎么看溶剂盒子的长宽是多少埃呀？或者有没有能看到溶剂盒子长宽的软件？

.tleap 文件如下
#tleap                              
source leaprc.ff14SB               
source leaprc.gaff
CY=loadmol2 a.mol2                 
loadamberparams frcmod.ionsjc_tip3p
loadamberparams a.frcmod                           
solvatebox CY TIP3PFBOX 15.0   
charge CY
addions CY Cl- 1   
check CY                           
savepdb CY a.pdb                  
saveamberparm CY a.prmtop a.inpcrd
quit

溶剂盒子如下：

jiahui

问题已解决，谢谢老师们

sobereva

显示盒子按2L说的。获得盒子参数，载入VMD，输入molinfo top get {a b c alpha beta gamma}

rpestana94

In vmd if you load a.prmtop and a.inpcrd, you can write in the console where you open vmd: pbc box, and it will show you the edges