使用aocc+aocl从头编译使用openmpi的vasp6

biogon

看到坛里有用amd官方给的用spack编译vasp的速度不理想的帖子，写个从头用aocc+aocl编译vasp的教程。
现在先随便写点，很多细节等以后补充。
1. 安装aocc和aocl
在amd官网下载3.2.0版本的aocc和aocl并安装（细节有时间再写）
4.1/4.0版本可用于编译vasp6.3.2以后的版本
安装好后需要添加环境变量，使在命令行中输入flang/clang有输出

aocl需要下载基于aocc构建的版本

2. 编译基于aocc3.2.0的openmpi（4.1.4版本）
编译过程基本与正常编译openmpi无异，区别就是在configure时要添加

1. CC=clang CXX=clang++ FC=flang

复制代码

3. 编译vasp
makefile（纯mpi）在下面已经提供，自己用只要修改里面的所有的

1. /opt/apps/amd/aocl/3.2.0

复制代码

为自己安装的aocl路径即可
cpu架构选项

1. VASP_TARGET_CPU ?= -march=znver2

复制代码

改成自己的cpu类型（1 2 3 or 4）

带VTST，VASPsol， Wannier90， HDF5可正常编译出，DFT-D4无法编译出

别的细节等有时间再补充


12.19更新
比较新的openmpi使用时configure需要使用编译器绝对路径，不然编译会报错
./configure CC=$编译器安装路径/aocc-compiler-4.1.0/bin/clang CXX=$编译器安装路径/aocc-compiler-4.1.0/bin/clang++ FC=$编译器安装路径/aocc-compiler-4.1.0/bin/flang --prefix=$安装路径

1.29
实测编译使用aocc4.1.0编译openmpi5.0.x，系统gnu编译器版本最低为11，否则编译就报错

ggshining

biogon 发表于 2024-1-26 14:57
版本呢

问题解决了，还是gcc的问题，装完aocc要用clang clang++ flang -v看下三者自动识别的gcc位置是否正确，我的就是flang自动找的gcc位置与前两个的gcc11不对应。把系统中多的gcc版本删掉或者重命名掉文件夹就好了

zmjsce

neocc 发表于 2024-1-24 00:00
参考多个教程后编译还是不通过
https://www.bilibili.com/opus/870747530826088515
http://bbs.keinsc ...

相同系统，相同配置，我也遇到了一样的报错

biogon

Jiongci-21 发表于 2024-7-26 00:52
超算管理员装了gcc13.3，我也module load了，which gcc， gcc -v，以及检查$PATH都是gcc13.3没有问题，然 ...

On RHEL and SLES systems, if you have multiple versions of devtoolset installed and the latest
version does not provide a GCC installation, use the compiler option -gcc-install-dir pointing to the
correct GCC version to be used. As an alternative solution for the RHEL systems, use the following
command to enable devtoolset version 9:

Jiongci-21

biogon 发表于 2024-7-25 12:39
编译前export绝对路径

超算管理员装了gcc13.3，我也module load了，which gcc， gcc -v，以及检查$PATH都是gcc13.3没有问题，然而安装的时候还是指向了gcc8，是不是Rocky Linux系统的一个bug。

1. (base) [c.junchi@soursop aocc-compiler-4.2.0]$ which gcc
   
2. /project/compute/compilers/gcc-13.3.0/bin/gcc
   
3. (base) [c.junchi@soursop aocc-compiler-4.2.0]$ gcc -v
   
4. Using built-in specs.
   
5. COLLECT_GCC=gcc
   
6. COLLECT_LTO_WRAPPER=/project/engineering/compilers/gcc-13.3.0/bin/../libexec/gcc/x86_64-pc-linux-gnu/13.3.0/lto-wrapper
   
7. Target: x86_64-pc-linux-gnu
   
8. Configured with: ../gcc-13.3.0/configure --prefix=/project/compute/compilers/gcc-13.3.0 --enable-languages=c,c++,fortran,go,objc,obj-c++
   
9. Thread model: posix
   
10. Supported LTO compression algorithms: zlib zstd
    
11. gcc version 13.3.0 (GCC)

复制代码

1. (base) [c.junchi@soursop aocc-compiler-4.2.0]$ echo -e "PATH:\n${PATH//:/\\n}\n"
   
2. PATH:
   
3. /home/research/c.junchi/opt/amd/AOCC-gcc13/aocc-compiler-4.2.0/share/opt-viewer
   
4. /home/research/c.junchi/opt/amd/AOCC-gcc13/aocc-compiler-4.2.0/bin
   
5. /project/compute/compilers/gcc-13.3.0/bin

复制代码

1. (base) [c.junchi@soursop aocc-compiler-4.2.0]$ bash install.sh
   
2. Successfully generated setenv file:/home/research/c.junchi/opt/amd/AOCC-gcc13/setenv_AOCC.sh
   
3. 
   
4. AOCC installation is complete
   
5. 
   
6. Compiler has been installed in following location:
   
7. ~/opt/amd/AOCC-gcc13/aocc-compiler-4.2.0/bin/clang
   
8. ~/opt/amd/AOCC-gcc13/aocc-compiler-4.2.0/bin/clang++
   
9. ~/opt/amd/AOCC-gcc13/aocc-compiler-4.2.0/bin/flang
   
10. 
    
11. Steps to setup AOCC:
    
12.         (1) Setup AOCC environment by executing below command:
    
13.                 source /home/research/c.junchi/opt/amd/AOCC-gcc13/setenv_AOCC.sh
    
14. 
    
15.         (2) For location and version of AOCC's clang enter commands given below
    
16.                 which clang
    
17.                 clang -v
    
18. 
    
19. (base) [c.junchi@soursop aocc-compiler-4.2.0]$ source /home/research/c.junchi/opt/amd/AOCC-gcc13/setenv_AOCC.sh
    
20. (base) [c.junchi@soursop aocc-compiler-4.2.0]$ which clang
    
21. ~/opt/amd/AOCC-gcc13/aocc-compiler-4.2.0/bin/clang
    
22. (base) [c.junchi@soursop aocc-compiler-4.2.0]$ clang -v
    
23. AMD clang version 16.0.3 (CLANG: AOCC_4.2.0-Build#89 2023_12_13)
    
24. Target: x86_64-unknown-linux-gnu
    
25. Thread model: posix
    
26. InstalledDir: /home/research/c.junchi/opt/amd/AOCC-gcc13/aocc-compiler-4.2.0/bin
    
27. Found candidate GCC installation: /usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/8
    
28. Selected GCC installation: /usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/8

复制代码

biogon

Jiongci-21 发表于 2024-7-23 00:59
您好，请问安装aocc的时候怎么指定clang, clang++, 和flang选用已安装的更高版本的gcc呢？(非root用户)我 ...

编译前export绝对路径

Jiongci-21

biogon 发表于 2024-1-28 20:36
这个可以替换的

您好，请问安装aocc的时候怎么指定clang, clang++, 和flang选用已安装的更高版本的gcc呢？(非root用户)我load了gcc13.3的环境，但是./install.sh 得到的还是选择系统默认的gcc8。需要在install.sh里改动哪一部分吗？
由于我想装最新的openmpi，gcc8就一直报错。

biogon

Weldingspock 发表于 2024-2-14 10:46
我用aocc+aocl编译的vasp.6.4.2比 intel oneapi编译的速度只快了5%左右。系统是Cent os 8，gnu版本是8.3.1 ...

系统换新内核的，运行可以采用如下方法

1. # Mapping of process to hardware resources
   
2. # For AMD EPYC processors it is recommended to use a single rank per L3 cache
   
3. # and set OMP_NUM_THREADS to the number of cores per L3 cache. Below is the example
   
4. # for 4th Gen EPYC processors with 8 cores per L3 cache, hence using OMP_NUM_THREADS=8
   
5. export NUM_CORES=$(nproc)
   
6. export OMP_NUM_THREADS=8
   
7. NUM_MPI_RANKS=$(( $NUM_CORES / $OMP_NUM_THREADS ))
   
8. 
   
9. # Running VASP
   
10. mpirun -np $NUM_MPI_RANKS --map-by ppr:1:l3cache:pe=$OMP_NUM_THREADS vasp_std

复制代码

Weldingspock

我用aocc+aocl编译的vasp.6.4.2比 intel oneapi编译的速度只快了5%左右。系统是Cent os 8，gnu版本是8.3.1，cpu是amd 9554。openmpi版本是4.1.6。最后运行vasp的命令直接是mpirun -np ** vasp_std。请问最后的运行命令需要改吗还是有一些别的参数需要修改？

云空

chever 发表于 2023-5-12 11:43
感谢楼主，已成功编译。在手头算的一个体系里面比Intel Parallel Studio XE 2019编译的vasp.5.4.4+加速代 ...

大佬，请问下aocc编译后怎么运行呢？我编译成功了，但是运行不起来

biogon

ggshining 发表于 2024-1-26 22:52
问题解决了，还是gcc的问题，装完aocc要用clang clang++ flang -v看下三者自动识别的gcc位置是否正确，我 ...

这个可以替换的

biogon

ggshining 发表于 2024-1-22 12:03
请问下这个问题解决了吗？怎么解决的呀
我也遇到这个问题了，一模一样的提示Fortran不成功，which gfort ...

版本呢

biogon

neocc 发表于 2024-1-24 13:08
好的

AMD EPYC 9654

你先换个系统吧，别用这玩意了

neocc

雾雨魔理沙 发表于 2024-1-24 10:58
你可以把你的环境（如电脑配置，软件版本等）先写出来，可能这样会方便大家知道你的错误原因

好的

AMD EPYC 9654

CentOS Linux release 8.5.2111

vasp642+VTSTcodes198

雾雨魔理沙

neocc 发表于 2024-1-24 00:00
参考多个教程后编译还是不通过
https://www.bilibili.com/opus/870747530826088515
http://bbs.keinsc ...

你可以把你的环境（如电脑配置，软件版本等）先写出来，可能这样会方便大家知道你的错误原因